IFT57

Ідентифікатори

Символи

IFT57, ESRRBL1, HIPPI, MHS4R2, intraflagellar transport 57, OFD18

Зовнішні ІД

OMIM: 606621 MGI: 1921166 HomoloGene: 32383 GeneCards: IFT57

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• intraciliary transport particle B • цитоплазма • ciliary basal body • центросома • комплекс Ґольджі • cell projection • photoreceptor connecting cilium • dendrite terminus • ciliary tip • GO:0035085 Аксонема • цитоскелет • війка
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • intraciliary transport • transcription, DNA-templated • heart looping • neural tube closure • negative regulation of epithelial cell proliferation • smoothened signaling pathway • left/right pattern formation • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • GO:0097285 апоптоз • intraciliary transport involved in cilium assembly • motile cilium assembly • non-motile cilium assembly • cilium assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55081


73916

Ensembl


ENSG00000114446


ENSMUSG00000032965

UniProt


Q9NWB7


Q8BXG3

RefSeq (мРНК)


NM_018010


NM_028680

RefSeq (білок)


NP_060480


NP_082956

Локус (UCSC)

Хр. 3: 108.16 – 108.22 Mb

Хр. 16: 49.52 – 49.59 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IFT57 (англ. Intraflagellar transport 57) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 429 амінокислот, а молекулярна маса — 49 108^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTAALAVVTT	SGLEDGVPRS	RGEGTGEVVL	ERGPGAAYHM	FVVMEDLVEK
LKLLRYEEEF	LRKSNLKAPS	RHYFALPTNP	GEQFYMFCTL	AAWLINKAGR
PFEQPQEYDD	PNATISNILS	ELRSFGRTAD	FPPSKLKSGY	GEHVCYVLDC
FAEEALKYIG	FTWKRPIYPV	EELEEESVAE	DDAELTLNKV	DEEFVEEETD
NEENFIDLNV	LKAQTYHLDM	NETAKQEDIL	ESTTDAAEWS	LEVERVLPQL
KVTIRTDNKD	WRIHVDQMHQ	HRSGIESALK	ETKGFLDKLH	NEITRTLEKI
SSREKYINNQ	LENLVQEYRA	AQAQLSEAKE	RYQQGNGGVT	ERTRLLSEVM
EELEKVKQEM	EEKGSSMTDG	APLVKIKQSL	TKLKQETVEM	DIRIGIVEHT
LLQSKLKEKS	NMTRNMHATV	IPEPATGFY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cheng C.-M., Huang S.-P., Chang Y.-F., Chung W.-Y., Yuo C.-Y. (2003). The viral death protein Apoptin interacts with Hippi, the protein interactor of Huntingtin-interacting protein 1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 305: 359—364. PMID 12745083 DOI:10.1016/S0006-291X(03)00764-2
Majumder P., Choudhury A., Banerjee M., Lahiri A., Bhattacharyya N.P. (2007). Interactions of HIPPI, a molecular partner of Huntingtin interacting protein HIP1, with the specific motif present at the putative promoter sequence of the caspase-1, caspase-8 and caspase-10 genes. FEBS J. 274: 3886—3899. PMID 17623017 DOI:10.1111/j.1742-4658.2007.05922.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17367 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9NWB7 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.