IFIT3

Ідентифікатори

Символи

IFIT3, CIG-49, GARG-49, IFI60, IFIT4, IRG2, ISG60, P60, RIG-G, cig41, interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3

Зовнішні ІД

OMIM: 604650 MGI: 1101055 HomoloGene: 1189 GeneCards: IFIT3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• identical protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • мітохондрія • гіалоплазма
Біологічний процес	• процес імунної системи • response to virus • вроджений імунітет • negative regulation of apoptotic process • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • cellular response to interferon-alpha • response to bacterium • cellular response to interferon-beta
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3437


15959

Ensembl


ENSG00000119917


ENSMUSG00000074896

UniProt


O14879


Q64345

RefSeq (мРНК)


NM_001549 NM_001031683 NM_001289758 NM_001289759


NM_010501

RefSeq (білок)


NP_001026853 NP_001276687 NP_001276688 NP_001540


NP_034631

Локус (UCSC)

Хр. 10: 89.33 – 89.38 Mb

Хр. 19: 34.56 – 34.57 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IFIT3 (англ. Interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490 амінокислот, а молекулярна маса — 55 985^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSEVTKNSLE	KILPQLKCHF	TWNLFKEDSV	SRDLEDRVCN	QIEFLNTEFK
ATMYNLLAYI	KHLDGNNEAA	LECLRQAEEL	IQQEHADQAE	IRSLVTWGNY
AWVYYHLGRL	SDAQIYVDKV	KQTCKKFSNP	YSIEYSELDC	EEGWTQLKCG
RNERAKVCFE	KALEEKPNNP	EFSSGLAIAM	YHLDNHPEKQ	FSTDVLKQAI
ELSPDNQYVK	VLLGLKLQKM	NKEAEGEQFV	EEALEKSPCQ	TDVLRSAAKF
YRRKGDLDKA	IELFQRVLES	TPNNGYLYHQ	IGCCYKAKVR	QMQNTGESEA
SGNKEMIEAL	KQYAMDYSNK	ALEKGLNPLN	AYSDLAEFLE	TECYQTPFNK
EVPDAEKQQS	HQRYCNLQKY	NGKSEDTAVQ	HGLEGLSISK	KSTDKEEIKD
QPQNVSENLL	PQNAPNYWYL	QGLIHKQNGD	LLQAAKCYEK	ELGRLLRDAP
SGIGSIFLSA	SELEDGSEEM	GQGAVSSSPR	ELLSNSEQLN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, противірусний захист. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

Zhu H., Cong J.-P., Shenk T. (1997). Use of differential display analysis to assess the effect of human cytomegalovirus infection on the accumulation of cellular RNAs: induction of interferon-responsive RNAs. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 13985—13990. PMID 9391139 DOI:10.1073/pnas.94.25.13985
de Veer M.J., Sim H., Whisstock J.C., Devenish R.J., Ralph S.J. (1998). IFI60/ISG60/IFIT4, a new member of the human IFI54/IFIT2 family of interferon-stimulated genes. Genomics. 54: 267—277. PMID 9828129 DOI:10.1006/geno.1998.5555
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Stawowczyk M., Van Scoy S., Kumar K.P., Reich N.C. (2011). The interferon stimulated gene 54 promotes apoptosis. J. Biol. Chem. 286: 7257—7266. PMID 21190939 DOI:10.1074/jbc.M110.207068
Liu X.Y., Chen W., Wei B., Shan Y.F., Wang C. (2011). IFN-induced TPR protein IFIT3 potentiates antiviral signaling by bridging MAVS and TBK1. J. Immunol. 187: 2559—2568. PMID 21813773 DOI:10.4049/jimmunol.1100963
Fensterl V., Sen G.C. (2011). The ISG56/IFIT1 gene family. J. Interferon Cytokine Res. 31: 71—78. PMID 20950130 DOI:10.1089/jir.2010.0101

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5411 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O14879 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.