HNRNPLL : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

HNRNPLL

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1WEX, 2E5I

Ідентифікатори

Символи

HNRNPLL, HNRPLL, SRRF, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like

Зовнішні ІД

OMIM: 611208 MGI: 1919942 HomoloGene: 26701 GeneCards: HNRNPLL

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• мембрана • клітинне ядро
Біологічний процес	• positive regulation of RNA splicing • mRNA processing
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


92906


72692

Ensembl


ENSG00000143889


ENSMUSG00000024095

UniProt


Q8WVV9


Q921F4

RefSeq (мРНК)


NM_001142650 NM_138394


NM_144802

RefSeq (білок)


NP_001136122 NP_612403


NP_659051

Локус (UCSC)

Хр. 2: 38.56 – 38.6 Mb

Хр. 17: 80.34 – 80.37 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HNRNPLL (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 542 амінокислот, а молекулярна маса — 60 083^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSSSSSPRE	TYEEDREYES	QAKRLKTEEG	EIDYSAEEGE	NRREATPRGG
GDGGGGGRSF	SQPEAGGSHH	KVSVSPVVHV	RGLCESVVEA	DLVEALEKFG
TICYVMMMPF	KRQALVEFEN	IDSAKECVTF	AADEPVYIAG	QQAFFNYSTS
KRITRPGNTD	DPSGGNKVLL	LSIQNPLYPI	TVDVLYTVCN	PVGKVQRIVI
FKRNGIQAMV	EFESVLCAQK	AKAALNGADI	YAGCCTLKIE	YARPTRLNVI
RNDNDSWDYT	KPYLGRRDRG	KGRQRQAILG	EHPSSFRHDG	YGSHGPLLPL
PSRYRMGSRD	TPELVAYPLP	QASSSYMHGG	NPSGSVVMVS	GLHQLKMNCS
RVFNLFCLYG	NIEKVKFMKT	IPGTALVEMG	DEYAVERAVT	HLNNVKLFGK
RLNVCVSKQH	SVVPSQIFEL	EDGTSSYKDF	AMSKNNRFTS	AGQASKNIIQ
PPSCVLHYYN	VPLCVTEETF	TKLCNDHEVL	TFIKYKVFDA	KPSAKTLSGL
LEWECKTDAV	EALTALNHYQ	IRVPNGSNPY	TLKLCFSTSS	HL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК.

Література

Shur I., Ben-Avraham D., Benayahu D. (2004). Alternatively spliced isoforms of a novel stromal RNA regulating factor. Gene. 334: 113—121. PMID 15256261 DOI:10.1016/j.gene.2004.03.012
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25127 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8WVV9 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.