HMGXB3

Ідентифікатори

Символи

HMGXB3, HMGX3, SMF, HMG-box containing 3

Зовнішні ІД

MGI: 2441817 HomoloGene: 44229 GeneCards: HMGXB3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • kinase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • компонент клітини
Біологічний процес	• фосфорилювання • GO:0022610 життєдіяльність • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22993


106894

Ensembl


ENSG00000113716


ENSMUSG00000024622

UniProt


Q12766 Q562E5


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_014983 NM_001366501


NM_134134 NM_178277

RefSeq (білок)


NP_055798 NP_001353430 NP_055798.2


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 5: 150 – 150.05 Mb

Хр. 18: 61.26 – 61.31 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HMGXB3 (англ. HMG-box containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 538 амінокислот, а молекулярна маса — 168 334^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQRTQPRPCY	LNAPQQCPGA	ERPGRPTAGS	HSFLLRPGPL	AGSSPFALLD
PLQAFEQFVW	VRSQARAGLL	RLRQGSHAVT	RCRPLPVRRE	GRRDGSPWRS
VVCRYCRCSR	QTGASVTTVS	LPSSSSSPGL	DPRGPRQASV	RSLRSEPVLL
FLPFRTPYRD	SEEGKREGLS	RLRAVCRRAG	PRGRGSFSPR	DARASPRLHF
LVAAVTTGAA	SRRQRGARVR	QPSPSSSRRA	KRLRECERRS	LHAPPAMDAS
YDGTEVTVVM	EEIEEAYCYT	SPGPPKKKKK	YKIHGEKTKK	PRSAYLLYYY
DIYLKVQQEL	PHLPQSEINK	KISESWRLLS	VAERSYYLEK	AKLEKEGLDP
NSKLSALTAV	VPDIPGFRKI	LPRSDYIIIP	KSSLQEDRSC	PQLELCVAQN
QMSPKGPPLV	SNTAPETVPS	HAGMAEQCLA	VEALAEEVGA	LTQSGAVQEI
ATSEILSQDV	LLEDASLEVG	ESHQPYQTSL	VIEETLVNGS	PDLPTGSLAV
PHPQVGESVS	VVTVMRDSSE	SSSSAPATQF	IMLPLPAYSV	VENPTSIKLT
TTYTRRGHGT	CTSPGCSFTY	VTRHKPPKCP	TCGNFLGGKW	IPKEKPAKVK
VELASGVSSK	GSVVKRNQQP	VTTEQNSSKE	NASKLTLENS	EAVSQLLNVA
PPREVGEESE	WEEVIISDAH	VLVKEAPGNC	GTAVTKTPVV	KSGVQPEVTL
GTTDNDSPGA	DVPTPSEGTS	TSSPLPAPKK	PTGADLLTPG	SRAPELKGRA
RGKPSLLAAA	RPMRAILPAP	VNVGRGSSMG	LPRARQAFSL	SDKTPSVRTC
GLKPSTLKQL	GQPIQQPSGP	GEVKLPSGPS	NRTSQVKVVE	VKPDMFPPYK
YSCTVTLDLG	LATSRGRGKC	KNPSCSYVYT	NRHKPRICPS	CGVNLAKDRT
EKTTKAIEVS	SPLPDVLNAT	EPLSTAQREI	QRQSTLQLLR	KVLQIPENES
ELAEVFALIH	ELNSSRLILS	NVSEETVTIE	QTSWSNYYES	PSTQCLLCSS
PLFKGGQNSL	AGPQECWLLT	ASRLQTVTAQ	VKMCLNPHCL	ALHSFIDIYT
GLFNVGNKLL	VSLDLLFAIR	NQIKLGEDPR	VSINVVLKSV	QEQTEKTLTS
EELSQLQELL	CNGYWAFECL	TVRDYNDMIC	GICGVAPKVE	MAQRSEENVL
ALKSVEFTWP	EFLGSNEVNV	EDFWATMETE	VIEQVAFPAS	IPITKFDASV
IAPFFPPLMR	GAVVVNTEKD	KNLDVQPVPG	SGSALVRLLQ	EGTCKLDEIG
SYSEEKLQHL	LRQCGIPFGA	EDSKDQLCFS	LLALYESVQN	GARAIRPPRH
FTGGKIYKVC	PHQVVCGSKY	LVRGESARDH	VDLLASSRHW	PPVYVVDMAT
SVALCADLCY	PELTNQMWGR	NQGCFSSPTE	PPVSVSCPEL	LDQHYTVDMT
ETEHSIQHPV	TKTATRRIVH	AGLQPNPGDP	SAGHHSLALC	PELAPYATIL
ASIVDSKPNG	VRQRPIAFDN	ATHYYLYNRL	MDFLTSREIV	NRQIHDIVQS
CQPGEVVIRD	TLYRLGVAQI	KTETEEEGEE	EEVAAVAE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28982 (англ.) . Архів оригіналу за 29 липня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q12766 (англ.) . Архів оригіналу за 28 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.