HMCES : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

HMCES

Ідентифікатори

Символи

HMCES, C3orf37, SRAPD1, DC12, 5-hydroxymethylcytosine (hmC) binding, ES cell-specific, 5-hydroxymethylcytosine binding, ES cell specific

Зовнішні ІД

OMIM: 618288 MGI: 1914053 HomoloGene: 6636 GeneCards: HMCES

шифр КФ

3.4.-.-

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56941


232210

Ensembl


ENSG00000183624


ENSMUSG00000030060

UniProt


Q96FZ2


Q8R1M0

RefSeq (мРНК)

NM_001006109 NM_020187 NM_001363881 NM_001370343 NM_001370344
NM_001370345


NM_173737

RefSeq (білок)

NP_001006109 NP_064572 NP_001350810 NP_001357272 NP_001357273
NP_001357274


NP_776098

Локус (UCSC)

Хр. 3: 129.28 – 129.31 Mb

Хр. 6: 87.89 – 87.91 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HMCES (англ. 5-hydroxymethylcytosine (hmC) binding, ES cell-specific) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 354 амінокислот, а молекулярна маса — 40 575^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MCGRTSCHLP	RDVLTRACAY	QDRRGQQRLP	EWRDPDKYCP	SYNKSPQSNS
PVLLSRLHFE	KDADSSERII	APMRWGLVPS	WFKESDPSKL	QFNTTNCRSD
TVMEKRSFKV	PLGKGRRCVV	LADGFYEWQR	CQGTNQRQPY	FIYFPQIKTE
KSGSIGAADS	PENWEKVWDN	WRLLTMAGIF	DCWEPPEGGD	VLYSYTIITV
DSCKGLSDIH	HRMPAILDGE	EAVSKWLDFG	EVSTQEALKL	IHPTENITFH
AVSSVVNNSR	NNTPECLAPV	DLVVKKELRA	SGSSQRMLQW	LATKSPKKED
SKTPQKEESD	VPQWSSQFLQ	KSPLPTKRGT	AGLLEQWLKR	EKEEEPVAKR
PYSQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з ДНК.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Aravind L., Anand S., Iyer L.M. (2013). Novel autoproteolytic and DNA-damage sensing components in the bacterial SOS response and oxidized methylcytosine-induced eukaryotic DNA demethylation systems. Biol. Direct. 8: 20—20. PMID 23945014 DOI:10.1186/1745-6150-8-20

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24446 (англ.) . Архів оригіналу за 13 травня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96FZ2 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.