HLA-DMB

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1HDM, 2BC4, 4FQX, 4GBX, 4I0P

Ідентифікатори

Символи

HLA-DMB, D6S221E, RING7, major histocompatibility complex, class II, DM beta

Зовнішні ІД

OMIM: 142856 MGI: 95922 HomoloGene: 68231 GeneCards: HLA-DMB

Онтологія гена
Молекулярна функція	• MHC class II protein complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• lysosomal membrane • лізосома • мембрана • ендосома • late endosome membrane • integral component of membrane • MHC class II protein complex
Біологічний процес	• positive regulation of T cell activation via T cell receptor contact with antigen bound to MHC molecule on antigen presenting cell • antigen processing and presentation • MHC class II protein complex assembly • positive regulation of T cell proliferation • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • peptide antigen assembly with MHC class II protein complex • процес імунної системи • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • адаптивна імунна відповідь
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3109


14999

Ensembl

ENSG00000241674 ENSG00000226264 ENSG00000242574 ENSG00000239329 ENSG00000234154
ENSG00000242386 ENSG00000242092 ENSG00000241296


ENSMUSG00000079547

UniProt


P28068


P35737 Q31094

RefSeq (мРНК)


NM_002118


NM_010387

RefSeq (білок)


NP_002109


NP_034517

Локус (UCSC)

Хр. 6: 32.93 – 32.94 Mb

Хр. 17: 34.37 – 34.38 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HLA-DMB (англ. Major histocompatibility complex, class II, DM beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 263 амінокислот, а молекулярна маса — 28 943^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MITFLPLLLG	LSLGCTGAGG	FVAHVESTCL	LDDAGTPKDF	TYCISFNKDL
LTCWDPEENK	MAPCEFGVLN	SLANVLSQHL	NQKDTLMQRL	RNGLQNCATH
TQPFWGSLTN	RTRPPSVQVA	KTTPFNTREP	VMLACYVWGF	YPAEVTITWR
KNGKLVMPHS	SAHKTAQPNG	DWTYQTLSHL	ALTPSYGDTY	TCVVEHIGAP
EPILRDWTPG	LSPMQTLKVS	VSAVTLGLGL	IIFSLGVISW	RRAGHSSYTP
LPGSNYSEGW	HIS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

Kelly A.P., Monaco J.J., Cho S., Trowsdale J. (1991). A new human HLA class II-related locus, DM. Nature. 353: 571—573. PMID 1922365 DOI:10.1038/353571a0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Sanderson F., Powis S.H., Kelly A.P., Trowsdale J. (1994). Limited polymorphism in HLA-DM does not involve the peptide binding groove. Immunogenetics. 39: 56—58. PMID 8225438 DOI:10.1007/BF00171797
Carrington M., Yeager M., Mann D. (1993). Characterization of HLA-DMB polymorphism. Immunogenetics. 38: 446—449. PMID 8406617 DOI:10.1007/BF00184526
Kim T.-G., Carrington M., Choi H.B., Kim H.Y., Han H. (1996). Three HLA-DMB variants in Korean patients with autoimmune diseases. Hum. Immunol. 46: 58—60. PMID 9157091 DOI:10.1016/0198-8859(95)00171-9
McTernan C.L., Mijovic C.H., Cockram C.S., Barnett A.H. (2000). The nucleotide sequence of a new DMB allele, DMB*0106. Tissue Antigens. 55: 470—472. PMID 10885572 DOI:10.1034/j.1399-0039.2000.550514.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4935 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P28068 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.