HIP1R

HIP1R
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1R0D

Ідентифікатори
Символи HIP1R, HIP12, HIP3, ILWEQ, huntingtin interacting protein 1 related
Зовнішні ІД OMIM: 605613 MGI: 1352504 HomoloGene: 78348 GeneCards: HIP1R
Онтологія гена
Молекулярна функція

• actin binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• phospholipid binding
• phosphatidylinositol binding
• phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding
• phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding
• SH3 domain binding
• clathrin binding
• clathrin light chain binding
• clathrin adaptor activity
• protein homodimerization activity
• phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding
• protein heterodimerization activity
• actin filament binding
• phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding
• identical protein binding

Клітинна компонента

• perinuclear region of cytoplasm
• clathrin-coated pit
• цитоскелет
• clathrin-coated vesicle membrane
• внутрішньоклітинна мембранна органела
• система ендомембран
• мембрана
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• clathrin-coated vesicle
• цитоплазма
• мітохондрія
• гіалоплазма
• cell cortex
• GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
• apical plasma membrane
• ruffle membrane
• dendrite cytoplasm
• neuronal cell body
• dendritic spine
• synaptic membrane
• AP-2 adaptor complex
• actin cortical patch

Біологічний процес

• ендоцитоз
• рецептор-опосередкований ендоцитоз
• GO:0097285 апоптоз
• activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• regulation of endocytosis
• negative regulation of actin filament polymerization
• positive regulation of protein binding
• regulation of actin cytoskeleton organization
• negative regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation
• positive regulation of apoptotic process
• negative regulation of apoptotic process
• positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway
• clathrin coat assembly
• protein stabilization
• digestive system development
• regulation of gastric acid secretion
• membrane organization
• positive regulation of mitochondrial outer membrane permeabilization involved in apoptotic signaling pathway
• positive regulation of clathrin coat assembly
• positive regulation of platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway
• regulation of clathrin-dependent endocytosis
• actin filament organization
• positive regulation of receptor-mediated endocytosis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9026
29816
Ensembl
ENSG00000130787
ENSMUSG00000000915
UniProt
O75146
Q9JKY5
RefSeq (мРНК)
NM_001303097
NM_001303099
NM_003959
NM_145070
RefSeq (білок)
NP_001290026
NP_001290028
NP_003950
NP_659507
Локус (UCSC) Хр. 12: 122.83 – 122.86 Mb Хр. 5: 124.11 – 124.14 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HIP1R (англ. Huntingtin interacting protein 1 related) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 068 амінокислот, а молекулярна маса — 119 388[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNSIKNVPARVLSRRPGHSLEAEREQFDKTQAISISKAINTQEAPVKEKH
ARRIILGTHHEKGAFTFWSYAIGLPLPSSSILSWKFCHVLHKVLRDGHPN
VLHDCQRYRSNIREIGDLWGHLHDRYGQLVNVYTKLLLTKISFHLKHPQF
PAGLEVTDEVLEKAAGTDVNNIFQLTVEMFDYMDCELKLSESVFRQLNTA
IAVSQMSSGQCRLAPLIQVIQDCSHLYHYTVKLLFKLHSCLPADTLQGHR
DRFHEQFHSLRNFFRRASDMLYFKRLIQIPRLPEGPPNFLRASALAEHIK
PVVVIPEEAPEDEEPENLIEISTGPPAGEPVVVADLFDQTFGPPNGSVKD
DRDLQIESLKREVEMLRSELEKIKLEAQRYIAQLKSQVNALEGELEEQRK
QKQKALVDNEQLRHELAQLRAAQLEGERSQGLREEAERKASATEARYNKL
KEKHSELVHVHAELLRKNADTAKQLTVTQQSQEEVARVKEQLAFQVEQVK
RESELKLEEKSDQLEKLKRELEAKAGELARAQEALSHTEQSKSELSSRLD
TLSAEKDALSGAVRQREADLLAAQSLVRETEAALSREQQRSSQEQGELQG
RLAERESQEQGLRQRLLDEQFAVLRGAAAEAAGILQDAVSKLDDPLHLRC
TSSPDYLVSRAQEALDAVSTLEEGHAQYLTSLADASALVAALTRFSHLAA
DTIINGGATSHLAPTDPADRLIDTCRECGARALELMGQLQDQQALRHMQA
SLVRTPLQGILQLGQELKPKSLDVRQEELGAVVDKEMAATSAAIEDAVRR
IEDMMNQARHASSGVKLEVNERILNSCTDLMKAIRLLVTTSTSLQKEIVE
SGRGAATQQEFYAKNSRWTEGLISASKAVGWGATQLVEAADKVVLHTGKY
EELIVCSHEIAASTAQLVAASKVKANKHSPHLSRLQECSRTVNERAANVV
ASTKSGQEQIEDRDTMDFSGLSLIKLKKQEMETQVRVLELEKTLEAERMR
LGELRKQHYVLAGASGSPGEEVAIRPSTAPRSVTTKKPPLAQKPSVAPRQ
DHQLDKKDGIYPAQLVNY

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Chen C.-Y., Brodsky F.M. (2005). Huntingtin-interacting protein 1 (Hip1) and Hip1-related protein (Hip1R) bind the conserved sequence of clathrin light chains and thereby influence clathrin assembly in vitro and actin distribution in vivo. J. Biol. Chem. 280: 6109—6117. PMID 15533940 DOI:10.1074/jbc.M408454200
  • Brett T.J., Legendre-Guillemin V., McPherson P.S., Fremont D.H. (2006). Structural definition of the F-actin-binding THATCH domain from HIP1R. Nat. Struct. Mol. Biol. 13: 121—130. PMID 16415883 DOI:10.1038/nsmb1043

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18415 (англ.) . Архів оригіналу за 17 червня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, O75146 (англ.) . Архів оригіналу за 11 березня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.