HERPUD1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1WGD

Ідентифікатори

Символи

HERPUD1, HERP, Mif1, SUP, homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608070 MGI: 1927406 HomoloGene: 40973 GeneCards: HERPUD1

Пов'язані генетичні захворювання

метаболічні захворювання^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transmembrane transporter binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція • ubiquitin ligase-substrate adaptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • Lewy body core • Кальцієві канали • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум
Біологічний процес	• negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • regulation of protein ubiquitination • regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • cellular calcium ion homeostasis • endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis • response to endoplasmic reticulum stress • PERK-mediated unfolded protein response • positive regulation of ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process • response to unfolded protein • retrograde protein transport, ER to cytosol • positive regulation of protein binding • Відповідь на незгорнуті білки • Убіквітин-залежний протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9709


64209

Ensembl


ENSG00000051108


ENSMUSG00000031770

UniProt


Q15011


Q9JJK5

RefSeq (мРНК)


NM_001010989 NM_001010990 NM_001272103 NM_014685


NM_022331 NM_001357205

RefSeq (білок)


NP_001010989 NP_001259032 NP_055500 NP_001259032.1


NP_071726 NP_001344134

Локус (UCSC)

Хр. 16: 56.93 – 56.94 Mb

Хр. 8: 95.11 – 95.12 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HERPUD1 (англ. Homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислот, а молекулярна маса — 43 720^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESETEPEPV	TLLVKSPNQR	HRDLELSGDR	GWSVGHLKAH	LSRVYPERPR
PEDQRLIYSG	KLLLDHQCLR	DLLPKQEKRH	VLHLVCNVKS	PSKMPEINAK
VAESTEEPAG	SNRGQYPEDS	SSDGLRQREV	LRNLSSPGWE	NISRPEAAQQ
AFQGLGPGFS	GYTPYGWLQL	SWFQQIYARQ	YYMQYLAATA	ASGAFVPPPS
AQEIPVVSAP	APAPIHNQFP	AENQPANQNA	APQVVVNPGA	NQNLRMNAQG
GPIVEEDDEI	NRDWLDWTYS	AATFSVFLSI	LYFYSSLSRF	LMVMGATVVM
YLHHVGWFPF	RPRPVQNFPN	DGPPPDVVNQ	DPNNNLQEGT	DPETEDPNHL
PPDRDVLDGE	QTSPSFMSTA	WLVFKTFFAS	LLPEGPPAIA	N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на порушення конформації білку, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Kokame K., Agarwala K.L., Kato H., Miyata T. (2000). Herp, a new ubiquitin-like membrane protein induced by endoplasmic reticulum stress. J. Biol. Chem. 275: 32846—32853. PMID 10922362 DOI:10.1074/jbc.M002063200
Kokame K., Kato H., Miyata T. (2001). Identification of ERSE-II, a new cis-acting element responsible for the ATF6-dependent mammalian unfolded protein response. J. Biol. Chem. 276: 9199—9205. PMID 11112790 DOI:10.1074/jbc.M010486200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kim T.Y., Kim E., Yoon S.K., Yoon J.B. (2008). Herp enhances ER-associated protein degradation by recruiting ubiquilins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 369: 741—746. PMID 18307982 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.02.086

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HERPUD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13744 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q15011 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.