HEATR1

Ідентифікатори

Символи

HEATR1, BAP28, UTP10, HEAT repeat containing 1

Зовнішні ІД

MGI: 2442524 HomoloGene: 34562 GeneCards: HEATR1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • snoRNA binding • RNA binding
Клітинна компонента	• small-subunit processome • мембрана • мітохондрія • 90S preribosome • t-UTP complex • нуклеоплазма • fibrillar center • клітинне ядро • ядерце
Біологічний процес	• maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • ribosome biogenesis • rRNA processing • positive regulation of rRNA processing • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription by RNA polymerase I
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55127


217995

Ensembl


ENSG00000119285


ENSMUSG00000050244

UniProt


Q9H583


G3X9B1

RefSeq (мРНК)


NM_018072


NM_144835

RefSeq (білок)


NP_060542 NP_060542.4


NP_659084

Локус (UCSC)

Хр. 1: 236.55 – 236.6 Mb

Хр. 13: 12.41 – 12.46 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HEATR1 (англ. HEAT repeat containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 144 амінокислот, а молекулярна маса — 242 370^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSLAQQLQR	LALPQSDASL	LSRDEVASLL	FDPKEAATID	RDTAFAIGCT
GLEELLGIDP	SFEQFEAPLF	SQLAKTLERS	VQTKAVNKQL	DENISLFLIH
LSPYFLLKPA	QKCLEWLIHR	FHIHLYNQDS	LIACVLPYHE	TRIFVRVIQL
LKINNSKHRW	FWLLPVKQSG	VPLAKGTLIT	HCYKDLGFMD	FICSLVTKSV
KVFAEYPGSS	AQLRVLLAFY	ASTIVSALVA	AEDVSDNIIA	KLFPYIQKGL
KSSLPDYRAA	TYMIICQISV	KVTMENTFVN	SLASQIIKTL	TKIPSLIKDG
LSCLIVLLQR	QKPESLGKKP	FPHLCNVPDL	ITILHGISET	YDVSPLLHYM
LPHLVVSIIH	HVTGEETEGM	DGQIYKRHLE	AILTKISLKN	NLDHLLASLL
FEEYISYSSQ	EEMDSNKVSL	LNEQFLPLIR	LLESKYPRTL	DVVLEEHLKE
IADLKKQELF	HQFVSLSTSG	GKYQFLADSD	TSLMLSLNHP	LAPVRILAMN
HLKKIMKTSK	EGVDESFIKE	AVLARLGDDN	IDVVLSAISA	FEIFKEHFSS
EVTISNLLNL	FQRAELSKNG	EWYEVLKIAA	DILIKEEILS	ENDQLSNQVV
VCLLPFMVIN	NDDTESAEMK	IAIYLSKSGI	CSLHPLLRGW	EEALENVIKS
TKPGKLIGVA	NQKMIELLAD	NINLGDPSSM	LKMVEDLISV	GEEESFNLKQ
KVTFHVILSV	LVSCCSSLKE	THFPFAIRVF	SLLQKKIKKL	ESVITAVEIP
SEWHIELMLD	RGIPVELWAH	YVEELNSTQR	VAVEDSVFLV	FSLKKFIYAL
KAPKSFPKGD	IWWNPEQLKE	DSRDYLHLLI	GLFEMMLNGA	DAVHFRVLMK
LFIKVHLEDV	FQLFKFCSVL	WTYGSSLSNP	LNCSVKTVLQ	TQALYVGCAM
LSSQKTQCKH	QLASISSPVV	TSLLINLGSP	VKEVRRAAIQ	CLQALSGVAS
PFYLIIDHLI	SKAEEITSDA	AYVIQDLATL	FEELQREKKL	KSHQKLSETL
KNLLSCVYSC	PSYIAKDLMK	VLQGVNGEMV	LSQLLPMAEQ	LLEKIQKEPT
AVLKDEAMVL	HLTLGKYNEF	SVSLLNEDPK	SLDIFIKAVH	TTKELYAGMP
TIQITALEKI	TKPFFAAISD	EKVQQKLLRM	LFDLLVNCKN	SHCAQTVSSV
FKGISVNAEQ	VRIELEPPDK	AKPLGTVQQK	RRQKMQQKKS	QDLESVQEVG
GSYWQRVTLI	LELLQHKKKL	RSPQILVPTL	FNLLSRCLEP	LPQEQGNMEY
TKQLILSCLL	NICQKLSPDG	GKIPKDILDE	EKFNVELIVQ	CIRLSEMPQT
HHHALLLLGT	VAGIFPDKVL	HNIMSIFTFM	GANVMRLDDT	YSFQVINKTV
KMVIPALIQS	DSGDSIEVSR	NVEEIVVKII	SVFVDALPHV	PEHRRLPILV
QLVDTLGAEK	FLWILLILLF	EQYVTKTVLA	AAYGEKDAIL	EADTEFWFSV
CCEFSVQHQI	QSLMNILQYL	LKLPEEKEET	IPKAVSFNKS	ESQEEMLQVF
NVETHTSKQL	RHFKFLSVSF	MSQLLSSNNF	LKKVVESGGP	EILKGLEERL
LETVLGYISA	VAQSMERNAD	KLTVKFWRAL	LSKAYDLLDK	VNALLPTETF
IPVIRGLVGN	PLPSVRRKAL	DLLNNKLQQN	ISWKKTIVTR	FLKLVPDLLA
IVQRKKKEGE	EEQAINRQTA	LYTLKLLCKN	FGAENPDPFV	PVLNTAVKLI
APERKEEKNV	LGSALLCIAE	VTSTLEALAI	PQLPSLMPSL	LTTMKNTSEL
VSSEVYLLSA	LAALQKVVET	LPHFISPYLE	GILSQVIHLE	KITSEMGSAS
QANIRLTSLK	KTLATTLAPR	VLLPAIKKTY	KQIEKNWKNH	MGPFMSILQE
HIGVMKKEEL	TSHQSQLTAF	FLEALDFRAQ	HSENDLEEVG	KTENCIIDCL
VAMVVKLSEV	TFRPLFFKLF	DWAKTEDAPK	DRLLTFYNLA	DCIAEKLKGL
FTLFAGHLVK	PFADTLNQVN	ISKTDEAFFD	SENDPEKCCL	LLQFILNCLY
KIFLFDTQHF	ISKERAEALM	MPLVDQLENR	LGGEEKFQER	VTKHLIPCIA
QFSVAMADDS	LWKPLNYQIL	LKTRDSSPKV	RFAALITVLA	LAEKLKENYI
VLLPESIPFL	AELMEDECEE	VEHQCQKTIQ	QLETVLGEPL	QSYF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, процесинг рРНК, біогенез рибосом, поліморфізм, ацетиляція. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Prieto J.L., McStay B. (2007). Recruitment of factors linking transcription and processing of pre-rRNA to NOR chromatin is UBF-dependent and occurs independent of transcription in human cells. Genes Dev. 21: 2041—2054. PMID 17699751 DOI:10.1101/gad.436707

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25517 (англ.) . Архів оригіналу за 12 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9H583 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.