GPATCH8 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | GPATCH8, GPATC8, KIAA0553, G-patch domain containing 8 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 614396 MGI: 1918667 HomoloGene: 46117 GeneCards: GPATCH8 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • компонент клітини |
---|
Біологічний процес | • GO:0022610 життєдіяльність |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001002909 NM_001304939 NM_001304940 NM_001304941 NM_001304942
| NM_001304943 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001002909 NP_001291868 NP_001291869 NP_001291870 NP_001291871
| NP_001291872 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 44.4 – 44.5 Mb | Хр. 11: 102.48 – 102.56 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GPATCH8 (англ. G-patch domain containing 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 502 амінокислот, а молекулярна маса — 164 197[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADRFSRFNE | | DRDFQGNHFD | | QYEEGHLEIE | | QASLDKPIES | | DNIGHRLLQK |
HGWKLGQGLG | | KSLQGRTDPI | | PIVVKYDVMG | | MGRMEMELDY | | AEDATERRRV |
LEVEKEDTEE | | LRQKYKDYVD | | KEKAIAKALE | | DLRANFYCEL | | CDKQYQKHQE |
FDNHINSYDH | | AHKQRLKDLK | | QREFARNVSS | | RSRKDEKKQE | | KALRRLHELA |
EQRKQAECAP | | GSGPMFKPTT | | VAVDEEGGED | | DKDESATNSG | | TGATASCGLG |
SEFSTDKGGP | | FTAVQITNTT | | GLAQAPGLAS | | QGISFGIKNN | | LGTPLQKLGV |
SFSFAKKAPV | | KLESIASVFK | | DHAEEGTSED | | GTKPDEKSSD | | QGLQKVGDSD |
GSSNLDGKKE | | DEDPQDGGSL | | ASTLSKLKRM | | KREEGAGATE | | PEYYHYIPPA |
HCKVKPNFPF | | LLFMRASEQM | | DGDNTTHPKN | | APESKKGSSP | | KPKSCIKAAA |
SQGAEKTVSE | | VSEQPKETSM | | TEPSEPGSKA | | EAKKALGGDV | | SDQSLESHSQ |
KVSETQMCES | | NSSKETSLAT | | PAGKESQEGP | | KHPTGPFFPV | | LSKDESTALQ |
WPSELLIFTK | | AEPSISYSCN | | PLYFDFKLSR | | NKDARTKGTE | | KPKDIGSSSK |
DHLQGLDPGE | | PNKSKEVGGE | | KIVRSSGGRM | | DAPASGSACS | | GLNKQEPGGS |
HGSETEDTGR | | SLPSKKERSG | | KSHRHKKKKK | | HKKSSKHKRK | | HKADTEEKSS |
KAESGEKSKK | | RKKRKRKKNK | | SSAPADSERG | | PKPEPPGSGS | | PAPPRRRRRA |
QDDSQRRSLP | | AEEGSSGKKD | | EGGGGSSSQD | | HGGRKHKGEL | | PPSSCQRRAG |
TKRSSRSSHR | | SQPSSGDEDS | | DDASSHRLHQ | | KSPSQYSEEE | | EEEDSGSEHS |
RSRSRSGRRH | | SSHRSSRRSY | | SSSSDASSDQ | | SCYSRQRSYS | | DDSYSDYSDR |
SRRHSKRSHD | | SDDSDYASSK | | HRSKRHKYSS | | SDDDYSLSCS | | QSRSRSRSHT |
RERSRSRGRS | | RSSSCSRSRS | | KRRSRSTTAH | | SWQRSRSYSR | | DRSRSTRSPS |
QRSGSRKRSW | | GHESPEERHS | | GRRDFIRSKI | | YRSQSPHYFR | | SGRGEGPGKK |
DDGRGDDSKA | | TGPPSQNSNI | | GTGRGSEGDC | | SPEDKNSVTA | | KLLLEKIQSR |
KVERKPSVSE | | EVQATPNKAG | | PKLKDPPQGY | | FGPKLPPSLG | | NKPVLPLIGK |
LPATRKPNKK | | CEESGLERGE | | EQEQSETEEG | | PPGSSDALFG | | HQFPSEETTG |
PLLDPPPEES | | KSGEATADHP | | VAPLGTPAHS | | DCYPGDPTIS | | HNYLPDPSDG |
DTLESLDSSS | | QPGPVESSLL | | PIAPDLEHFP | | SYAPPSGDPS | | IESTDGAEDA |
SLAPLESQPI | | TFTPEEMEKY | | SKLQQAAQQH | | IQQQLLAKQV | | KAFPASAALA |
PATPALQPIH | | IQQPATASAT | | SITTVQHAIL | | QHHAAAAAAA | | IGIHPHPHPQ |
PLAQVHHIPQ | | PHLTPISLSH | | LTHSIIPGHP | | ATFLASHPIH | | IIPASAIHPG |
PFTFHPVPHA | | ALYPTLLAPR | | PAAAAATALH | | LHPLLHPIFS | | GQDLQHPPSH |
GT |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29066 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9UKJ3 (англ.) . Архів оригіналу за 6 травня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |