GDA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4AQL, 3E0L, 2UZ9

Ідентифікатори

Символи

GDA, guanine deaminase, CYPIN, GUANASE, NEDASIN, Guanine deaminase, GAH

Зовнішні ІД

OMIM: 139260 MGI: 95678 HomoloGene: 3171 GeneCards: GDA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds • zinc ion binding • guanine deaminase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• guanine catabolic process • purine nucleotide catabolic process • nucleobase-containing compound metabolic process • нейробіологія розвитку • guanine metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9615


14544

Ensembl


ENSG00000119125


ENSMUSG00000058624

UniProt


Q9Y2T3


Q9R111

RefSeq (мРНК)

NM_001242505 NM_001242506 NM_001242507 NM_004293 NM_001351571
NM_001351572 NM_001351573


NM_010266

RefSeq (білок)

NP_001229434 NP_001229435 NP_001229436 NP_004284 NP_001338500
NP_001338501 NP_001338502


NP_034396

Локус (UCSC)

Хр. 9: 72.11 – 72.26 Mb

Хр. 19: 21.37 – 21.45 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GDA (англ. Guanine deaminase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 51 003^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MCAAQMPPLA	HIFRGTFVHS	TWTCPMEVLR	DHLLGVSDSG	KIVFLEEASQ
QEKLAKEWCF	KPCEIRELSH	HEFFMPGLVD	THIHASQYSF	AGSSIDLPLL
EWLTKYTFPA	EHRFQNIDFA	EEVYTRVVRR	TLKNGTTTAC	YFATIHTDSS
LLLADITDKF	GQRAFVGKVC	MDLNDTFPEY	KETTEESIKE	TERFVSEMLQ
KNYSRVKPIV	TPRFSLSCSE	TLMGELGNIA	KTRDLHIQSH	ISENRDEVEA
VKNLYPSYKN	YTSVYDKNNL	LTNKTVMAHG	CYLSAEELNV	FHERGASIAH
CPNSNLSLSS	GFLNVLEVLK	HEVKIGLGTD	VAGGYSYSML	DAIRRAVMVS
NILLINKVNE	KSLTLKEVFR	LATLGGSQAL	GLDGEIGNFE	VGKEFDAILI
NPKASDSPID	LFYGDFFGDI	SEAVIQKFLY	LGDDRNIEEV	YVGGKQVVPF
SSSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

Yuan G., Bin J.C., McKay D.J., Snyder F.F. (1999). Cloning and characterization of human guanine deaminase. Purification and partial amino acid sequence of the mouse protein. J. Biol. Chem. 274: 8175—8180. PMID 10075721 DOI:10.1074/jbc.274.12.8175
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Murphy P.M., Bolduc J.M., Gallaher J.L., Stoddard B.L., Baker D. (2009). Alteration of enzyme specificity by computational loop remodeling and design. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106: 9215—9220. PMID 19470646 DOI:10.1073/pnas.0811070106

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4212 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y2T3 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.