FXR2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | FXR2, FMR1L2, FXR2P, FMR1 autosomal homolog 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605339 MGI: 1346074 HomoloGene: 21014 GeneCards: FXR2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein heterodimerization activity • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • protein homodimerization activity • identical protein binding • RNA binding • mRNA 3'-UTR binding • translation regulator activity |
---|
Клітинна компонента | • Полісома • cytosolic large ribosomal subunit • екзосома • мембрана • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • аксон • ribonucleoprotein granule • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • neuronal cell body • dendritic spine |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of translation • regulation of translation • regulation of mRNA stability • positive regulation of translation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 7.59 – 7.61 Mb | Хр. 11: 69.52 – 69.54 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
FXR2 (англ. FMR1 autosomal homolog 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 673 амінокислот, а молекулярна маса — 74 223[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGGLASGGDV | | EPGLPVEVRG | | SNGAFYKGFV | | KDVHEDSVTI | | FFENNWQSER |
QIPFGDVRLP | | PPADYNKEIT | | EGDEVEVYSR | | ANEQEPCGWW | | LARVRMMKGD |
FYVIEYAACD | | ATYNEIVTLE | | RLRPVNPNPL | | ATKGSFFKVT | | MAVPEDLREA |
CSNENVHKEF | | KKALGANCIF | | LNITNSELFI | | LSTTEAPVKR | | ASLLGDMHFR |
SLRTKLLLMS | | RNEEATKHLE | | TSKQLAAAFQ | | EEFTVREDLM | | GLAIGTHGAN |
IQQARKVPGV | | TAIELGEETC | | TFRIYGETPE | | ACRQARSYLE | | FSEDSVQVPR |
NLVGKVIGKN | | GKVIQEIVDK | | SGVVRVRVEG | | DNDKKNPREE | | GMVPFIFVGT |
RENISNAQAL | | LEYHLSYLQE | | VEQLRLERLQ | | IDEQLRQIGL | | GFRPPGSGRG |
SGGSDKAGYS | | TDESSSSSLH | | ATRTYGGSYG | | GRGRGRRTGG | | PAYGPSSDVS |
TASETESEKR | | EEPNRAGPGD | | RDPPTRGEES | | RRRPTGGRGR | | GPPPAPRPTS |
RYNSSSISSV | | LKDPDSNPYS | | LLDTSEPEPP | | VDSEPGEPPP | | ASARRRRSRR |
RRTDEDRTVM | | DGGLESDGPN | | MTENGLEDES | | RPQRRNRSRR | | RRNRGNRTDG |
SISGDRQPVT | | VADYISRAES | | QSRQRPPLER | | TKPSEDSLSG | | QKGDSVSKLP |
KGPSENGELS | | APLELGSMVN | | GVS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Joseph D.R. (1998). The rat androgen-binding protein (ABP/SHBG) gene contains triplet repeats similar to unstable triplets: evidence that the ABP/SHBG and the fragile X-related 2 genes overlap. Steroids. 63: 2—4. PMID 9437788 DOI:10.1016/S0039-128X(97)00087-1
- Siomi M.C., Zhang Y., Siomi H., Dreyfuss G. (1996). Specific sequences in the fragile X syndrome protein FMR1 and the FXR proteins mediate their binding to 60S ribosomal subunits and the interactions among them. Mol. Cell. Biol. 16: 3825—3832. PMID 8668200 DOI:10.1128/MCB.16.7.3825
- Laggerbauer B., Ostareck D., Keidel E.M., Ostareck-Lederer A., Fischer U. (2001). Evidence that fragile X mental retardation protein is a negative regulator of translation. Hum. Mol. Genet. 10: 329—338. PMID 11157796 DOI:10.1093/hmg/10.4.329
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4024 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P51116 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |