FAM107A

Ідентифікатори

Символи

FAM107A, DRR1, TU3A, family with sequence similarity 107 member A

Зовнішні ІД

OMIM: 608295 MGI: 3041256 HomoloGene: 48509 GeneCards: FAM107A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція • actin binding
Клітинна компонента	• neuron projection • клітинне ядро • nuclear speck • stress fiber • цитоплазма • focal adhesion • actin cytoskeleton • ruffle membrane • синапс • цитоскелет • клітинна мембрана • мембрана • міжклітинні контакти • cell projection
Біологічний процес	• regulation of growth • regulation of cell growth • actin filament polymerization • positive regulation of cell migration • positive regulation of protein ubiquitination • regulation of protein stability • cellular response to nutrient levels • regulation of actin cytoskeleton organization • когнітивність • actin filament bundle assembly • negative regulation of focal adhesion assembly • regulation of microtubule cytoskeleton organization • cellular response to glucocorticoid stimulus • negative regulation of long-term synaptic potentiation • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • клітинний цикл
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11170


268709

Ensembl


ENSG00000168309


ENSMUSG00000021750

UniProt


O95990


Q78TU8

RefSeq (мРНК)


NM_001076778 NM_001282713 NM_001282714 NM_007177


NM_183187 NM_001360337 NM_001360338 NM_001360339

RefSeq (білок)


NP_001070246 NP_001269642 NP_001269643 NP_009108 NP_001269643.1


NP_001347266 NP_001347267 NP_001347268 NP_899010

Локус (UCSC)

Хр. 3: 58.56 – 58.63 Mb

Хр. 14: 14.15 – 14.17 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FAM107A (англ. Family with sequence similarity 107 member A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 144 амінокислот, а молекулярна маса — 17 455^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYSEIQRERA	DIGGLMARPE	YREWNPELIK	PKKLLNPVKA	SRSHQELHRE
LLMNHRRGLG	VDSKPELQRV	LEHRRRNQLI	KKKKEELEAK	RLQCPFEQEL
LRRQQRLNQL	EKPPEKEEDH	APEFIKVREN	LRRIATLTSE	EREL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція росту, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Simpson J.C., Wellenreuther R., Poustka A., Pepperkok R., Wiemann S. (2000). Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing. EMBO Rep. 1: 287—292. PMID 11256614 DOI:10.1093/embo-reports/kvd058
Yamato T., Orikasa K., Fukushige S., Orikasa S., Horii A. (1999). Isolation and characterization of the novel gene, TU3A, in a commonly deleted region on 3p14.3->p14.2 in renal cell carcinoma. Cytogenet. Cell Genet. 87: 291—295. PMID 10702698

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30827 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O95990 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.