EDF1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EDF1, EDF-1, MBF1, CFAP280, endothelial differentiation related factor 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605107 MGI: 1891227 HomoloGene: 2809 GeneCards: EDF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • calmodulin binding • histone acetyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • TFIID-class transcription factor complex binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • transcription factor TFIID complex • внутрішньоклітинний • ядерце • екзосома • клітинне ядро • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of lipid metabolic process • endothelial cell differentiation • positive regulation of DNA binding |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_153200 NM_001281297 NM_001281298 NM_001281299 NM_003792 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001268226 NP_001268227 NP_001268228 NP_003783 NP_694880 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 136.86 – 136.87 Mb | Хр. 2: 25.45 – 25.45 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EDF1 (англ. Endothelial differentiation related factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 148 амінокислот, а молекулярна маса — 16 369[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAESDWDTVT | | VLRKKGPTAA | | QAKSKQAILA | | AQRRGEDVET | | SKKWAAGQNK |
QHSITKNTAK | | LDRETEELHH | | DRVTLEVGKV | | IQQGRQSKGL | | TQKDLATKIN |
EKPQVIADYE | | SGRAIPNNQV | | LGKIERAIGL | | KLRGKDIGKP | | IEKGPRAK |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Dragoni I., Mariotti M., Consalez G.G., Soria M.R., Maier J.A.M. (1998). EDF-1, a novel gene product down-regulated in human endothelial cell differentiation. J. Biol. Chem. 273: 31119—31124. PMID 9813014 DOI:10.1074/jbc.273.47.31119
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mariotti M., De Benedictis L., Avon E., Maier J.A.M. (2000). Interaction between endothelial differentiation-related factor-1 and calmodulin in vitro and in vivo. J. Biol. Chem. 275: 24047—24051. PMID 10816571 DOI:10.1074/jbc.M001928200
- Brendel C., Gelman L., Auwerx J. (2002). Multiprotein bridging factor-1 (MBF-1) is a cofactor for nuclear receptors that regulate lipid metabolism. Mol. Endocrinol. 16: 1367—1377. PMID 12040021 DOI:10.1210/mend.16.6.0843
- Ballabio E., Mariotti M., De Benedictis L., Maier J.A.M. (2004). The dual role of endothelial differentiation-related factor-1 in the cytosol and nucleus: modulation by protein kinase A. Cell. Mol. Life Sci. 61: 1069—1074. PMID 15112053 DOI:10.1007/s00018-004-4016-0
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3164 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O60869 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |