DROSHA |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2KHX, 5B16 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | DROSHA, ETOHI2, HSA242976, RANSE3L, RN3, RNASE3L, RNASEN, drosha ribonuclease III |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608828 MGI: 1261425 HomoloGene: 8293 GeneCards: DROSHA |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • ribonuclease III activity • protein homodimerization activity • lipopolysaccharide binding • зв'язування з іоном металу • endoribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclease activity • endonuclease activity • hydrolase activity • RNA binding • DEAD/H-box RNA helicase binding • SMAD binding • R-SMAD binding • primary miRNA binding • double-stranded RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • нуклеоплазма • microprocessor complex • ядерце • клітинне ядро • клітинна мембрана • focal adhesion • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення |
---|
Біологічний процес | • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • ribosome biogenesis • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • rRNA catabolic process • GO:1901313 positive regulation of gene expression • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • regulation of miRNA metabolic process • GO:1990744, GO:1990729 primary miRNA processing • регуляція експресії генів • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • regulation of regulatory T cell differentiation • RNA phosphodiester bond hydrolysis • regulation of inflammatory response • GO:0061715 miRNA metabolic process • Сайленсинг генів • GO:0070919 production of siRNA involved in RNA interference • pre-miRNA processing |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001100412 NM_013235 NM_001382508 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001093882 NP_037367 NP_001369437 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 31.4 – 31.53 Mb | Хр. 15: 12.82 – 12.94 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DROSHA (англ. Drosha ribonuclease III) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 374 амінокислот, а молекулярна маса — 159 316[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MMQGNTCHRM | | SFHPGRGCPR | | GRGGHGARPS | | APSFRPQNLR | | LLHPQQPPVQ |
YQYEPPSAPS | | TTFSNSPAPN | | FLPPRPDFVP | | FPPPMPPSAQ | | GPLPPCPIRP |
PFPNHQMRHP | | FPVPPCFPPM | | PPPMPCPNNP | | PVPGAPPGQG | | TFPFMMPPPS |
MPHPPPPPVM | | PQQVNYQYPP | | GYSHHNFPPP | | SFNSFQNNPS | | SFLPSANNSS |
SPHFRHLPPY | | PLPKAPSERR | | SPERLKHYDD | | HRHRDHSHGR | | GERHRSLDRR |
ERGRSPDRRR | | QDSRYRSDYD | | RGRTPSRHRS | | YERSRERERE | | RHRHRDNRRS |
PSLERSYKKE | | YKRSGRSYGL | | SVVPEPAGCT | | PELPGEIIKN | | TDSWAPPLEI |
VNHRSPSREK | | KRARWEEEKD | | RWSDNQSSGK | | DKNYTSIKEK | | EPEETMPDKN |
EEEEEELLKP | | VWIRCTHSEN | | YYSSDPMDQV | | GDSTVVGTSR | | LRDLYDKFEE |
ELGSRQEKAK | | AARPPWEPPK | | TKLDEDLESS | | SESECESDED | | STCSSSSDSE |
VFDVIAEIKR | | KKAHPDRLHD | | ELWYNDPGQM | | NDGPLCKCSA | | KARRTGIRHS |
IYPGEEAIKP | | CRPMTNNAGR | | LFHYRITVSP | | PTNFLTDRPT | | VIEYDDHEYI |
FEGFSMFAHA | | PLTNIPLCKV | | IRFNIDYTIH | | FIEEMMPENF | | CVKGLELFSL |
FLFRDILELY | | DWNLKGPLFE | | DSPPCCPRFH | | FMPRFVRFLP | | DGGKEVLSMH |
QILLYLLRCS | | KALVPEEEIA | | NMLQWEELEW | | QKYAEECKGM | | IVTNPGTKPS |
SVRIDQLDRE | | QFNPDVITFP | | IIVHFGIRPA | | QLSYAGDPQY | | QKLWKSYVKL |
RHLLANSPKV | | KQTDKQKLAQ | | REEALQKIRQ | | KNTMRREVTV | | ELSSQGFWKT |
GIRSDVCQHA | | MMLPVLTHHI | | RYHQCLMHLD | | KLIGYTFQDR | | CLLQLAMTHP |
SHHLNFGMNP | | DHARNSLSNC | | GIRQPKYGDR | | KVHHMHMRKK | | GINTLINIMS |
RLGQDDPTPS | | RINHNERLEF | | LGDAVVEFLT | | SVHLYYLFPS | | LEEGGLATYR |
TAIVQNQHLA | | MLAKKLELDR | | FMLYAHGPDL | | CRESDLRHAM | | ANCFEALIGA |
VYLEGSLEEA | | KQLFGRLLFN | | DPDLREVWLN | | YPLHPLQLQE | | PNTDRQLIET |
SPVLQKLTEF | | EEAIGVIFTH | | VRLLARAFTL | | RTVGFNHLTL | | GHNQRMEFLG |
DSIMQLVATE | | YLFIHFPDHH | | EGHLTLLRSS | | LVNNRTQAKV | | AEELGMQEYA |
ITNDKTKRPV | | ALRTKTLADL | | LESFIAALYI | | DKDLEYVHTF | | MNVCFFPRLK |
EFILNQDWND | | PKSQLQQCCL | | TLRTEGKEPD | | IPLYKTLQTV | | GPSHARTYTV |
AVYFKGERIG | | CGKGPSIQQA | | EMGAAMDALE | | KYNFPQMAHQ | | KRFIERKYRQ |
ELKEMRWERE | | HQEREPDETE | | DIKK |
DROSHA за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез рибосом, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК, іоном марганцю. Локалізований у ядрі.
Література
- Wu H., Xu H., Miraglia L.J., Crooke S.T. (2000). Human RNase III is a 160-kDa protein involved in preribosomal RNA processing. J. Biol. Chem. 275: 36957—36965. PMID 10948199 DOI:10.1074/jbc.M005494200
- Gunther M., Laithier M., Brison O. (2000). A set of proteins interacting with transcription factor Sp1 identified in a two-hybrid screening. Mol. Cell. Biochem. 210: 131—142. PMID 10976766 DOI:10.1023/A:1007177623283
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Landthaler M., Yalcin A., Tuschl T. (2004). The human DiGeorge syndrome critical region gene 8 and its D. melanogaster homolog are required for miRNA biogenesis. Curr. Biol. 14: 2162—2167. PMID 15589161 DOI:10.1016/j.cub.2004.11.001
- Zeng Y., Yi R., Cullen B.R. (2005). Recognition and cleavage of primary microRNA precursors by the nuclear processing enzyme Drosha. EMBO J. 24: 138—148. PMID 15565168 DOI:10.1038/sj.emboj.7600491
- Faller M., Matsunaga M., Yin S., Loo J.A., Guo F. (2007). Heme is involved in microRNA processing. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 23—29. PMID 17159994 DOI:10.1038/nsmb1182
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17904 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NRR4 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |