DEFA5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1ZMP, 2LXZ, 2MIT, 3I5W, 4E82, 4E83, 4E86, 4RBW, 4RBX, 5CUM, 5CUJ, 5CUI

Ідентифікатори

Символи

DEFA5, DEF5, HD-5, defensin alpha 5, alpha defensin 5

Зовнішні ІД

OMIM: 600472 MGI: 3711900 HomoloGene: 128604 GeneCards: DEFA5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity
Клітинна компонента	• Golgi lumen • secretory granule lumen • transport vesicle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• defense response • defense response to bacterium • defense response to fungus • antimicrobial humoral response • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • вроджений імунітет • positive regulation of membrane permeability • killing of cells of other organism • innate immune response in mucosa • antibacterial humoral response • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • membrane disruption in other organism • cellular response to lipopolysaccharide
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1670


100041688

Ensembl


ENSG00000164816 ENSG00000285251


ENSMUSG00000061845

UniProt


Q01523


E9QLQ1

RefSeq (мРНК)


NM_021010


NM_001177481

RefSeq (білок)


NP_066290


NP_001170952

Локус (UCSC)

Хр. 8: 7.06 – 7.06 Mb

Хр. 8: 21.56 – 21.56 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DEFA5 (англ. Defensin alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 94 амінокислот, а молекулярна маса — 10 071^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTIAILAAI		LLVALQAQAE		SLQERADEAT		TQKQSGEDNQ		DLAISFAGNG
LSALRTSGSQ		ARATCYCRTG		RCATRESLSG		VCEISGRLYR		LCCR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фунгіцидів. Локалізований у цитоплазматичних везикулах. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ericksen B., Wu Z., Lu W., Lehrer R.I. (2005). Antibacterial activity and specificity of the six human alpha-defensins. Antimicrob. Agents Chemother. 49: 269—275. PMID 15616305 DOI:10.1128/AAC.49.1.269-275.2005
Jones D.E., Bevins C.L. (1992). Paneth cells of the human small intestine express an antimicrobial peptide gene. J. Biol. Chem. 267: 23216—23225. PMID 1429669

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2764 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q01523 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.