DBR1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

DBR1

Ідентифікатори

Символи

DBR1, debranching RNA lariats 1

Зовнішні ІД

OMIM: 607024 MGI: 1931520 HomoloGene: 9428 GeneCards: DBR1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• hydrolase activity • RNA lariat debranching enzyme activity • hydrolase activity, acting on ester bonds • зв'язування з іоном металу • RNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51163


83703

Ensembl


ENSG00000138231


ENSMUSG00000032469

UniProt


Q9UK59


Q923B1

RefSeq (мРНК)


NM_016216


NM_031403 NM_001368298

RefSeq (білок)


NP_057300


NP_113580 NP_001355227

Локус (UCSC)

Хр. 3: 138.16 – 138.17 Mb

Хр. 9: 99.46 – 99.47 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DBR1 (англ. Debranching RNA lariats 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 544 амінокислот, а молекулярна маса — 61 555^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRVAVAGCCH	GELDKIYETL	ALAERRGPGP	VDLLLCCGDF	QAVRNEADLR
CMAVPPKYRH	MQTFYRYYSG	EKKAPVLTLF	IGGNHEASNH	LQELPYGGWV
APNIYYLGLA	GVVKYRGVRI	GGISGIFKSH	DYRKGHFECP	PYNSSTIRSI
YHVRNIEVYK	LKQLKQPIDI	FLSHDWPRSI	YHYGNKKQLL	KTKSFFRQEV
ENNTLGSPAA	SELLEHLKPT	YWFSAHLHVK	FAALMQHQAK	DKGQTARATK
FLALDKCLPH	RDFLQILEIE	HDPSAPDYLE	YDIEWLTILR	ATDDLINVTG
RLWNMPENNG	LHARWDYSAT	EEGMKEVLEK	LNHDLKVPCN	FSVTAACYDP
SKPQTQMQLI	HRINPQTTEF	CAQLGIIDIN	VRLQKSKEEH	HVCGEYEEQD
DVESNDSGED	QSEYNTDTSA	LSSINPDEIM	LDEEEDEDSI	VSAHSGMNTP
SVEPSDQASE	FSASFSDVRI	LPGSMIVSSD	DTVDSTIDRE	GKPGGTVESG
NGEDLTKVPL	KRLSDEHEPE	QRKKIKRRNQ	AIYAAVDDDD	DDAA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ye Y., De Leon J., Yokoyama N., Naidu Y., Camerini D. (2005). DBR1 siRNA inhibition of HIV-1 replication. Retrovirology. 2: 63—63. PMID 16232320 DOI:10.1186/1742-4690-2-63
Arenas J., Hurwitz J. (1987). Purification of a RNA debranching activity from HeLa cells. J. Biol. Chem. 262: 4274—4279. PMID 2435736

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15594 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UK59 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.