CSTF2T : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CSTF2T

Ідентифікатори

Символи

CSTF2T, CstF-64T, cleavage stimulation factor subunit 2, tau variant, cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant

Зовнішні ІД

OMIM: 611968 MGI: 1932622 HomoloGene: 80230 GeneCards: CSTF2T

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• mRNA processing • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA 3'-end processing
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23283


83410

Ensembl


ENSG00000177613


ENSMUSG00000053536

UniProt


Q9H0L4


Q8C7E9

RefSeq (мРНК)


NM_015235


NM_031249

RefSeq (білок)


NP_056050


NP_112539

Локус (UCSC)

Хр. 10: 51.7 – 51.7 Mb

Хр. 19: 31.06 – 31.06 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CSTF2T (англ. Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 616 амінокислот, а молекулярна маса — 64 437^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSLAVRDPA	MDRSLRSVFV	GNIPYEATEE	QLKDIFSEVG	SVVSFRLVYD
RETGKPKGYG	FCEYQDQETA	LSAMRNLNGR	EFSGRALRVD	NAASEKNKEE
LKSLGPAAPI	IDSPYGDPID	PEDAPESITR	AVASLPPEQM	FELMKQMKLC
VQNSHQEARN	MLLQNPQLAY	ALLQAQVVMR	IMDPEIALKI	LHRKIHVTPL
IPGKSQSVSV	SGPGPGPGPG	LCPGPNVLLN	QQNPPAPQPQ	HLARRPVKDI
PPLMQTPIQG	GIPAPGPIPA	AVPGAGPGSL	TPGGAMQPQL	GMPGVGPVPL
ERGQVQMSDP	RAPIPRGPVT	PGGLPPRGLL	GDAPNDPRGG	TLLSVTGEVE
PRGYLGPPHQ	GPPMHHASGH	DTRGPSSHEM	RGGPLGDPRL	LIGEPRGPMI
DQRGLPMDGR	GGRDSRAMET	RAMETEVLET	RVMERRGMET	CAMETRGMEA
RGMDARGLEM	RGPVPSSRGP	MTGGIQGPGP	INIGAGGPPQ	GPRQVPGISG
VGNPGAGMQG	TGIQGTGMQG	AGIQGGGMQG	AGIQGVSIQG	GGIQGGGIQG
ASKQGGSQPS	SFSPGQSQVT	PQDQEKAALI	MQVLQLTADQ	IAMLPPEQRQ
SILILKEQIQ	KSTGAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Dass B., McDaniel L., Schultz R.A., Attaya E., MacDonald C.C. (2002). The gene CSTF2T, encoding the human variant CstF-64 polyadenylation protein CstF-64, lacks introns and may be associated with male sterility. Genomics. 80: 509—514. PMID 12408968 DOI:10.1006/geno.2002.6862
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17086 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H0L4 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.