CSPG5

Ідентифікатори

Символи

CSPG5, NGC, chondroitin sulfate proteoglycan 5

Зовнішні ІД

OMIM: 606775 MGI: 1352747 HomoloGene: 4795 GeneCards: CSPG5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • growth factor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • cell surface • lysosomal lumen • ендоплазматичний ретикулум • Golgi lumen • Golgi-associated vesicle membrane • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic membrane
Біологічний процес	• диференціація клітин • chondroitin sulfate biosynthetic process • modulation of chemical synaptic transmission • intracellular transport • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • chondroitin sulfate catabolic process • regulation of growth • dermatan sulfate biosynthetic process • regulation of signaling receptor activity • trans-synaptic signaling, modulating synaptic transmission • regulation of synaptic vesicle exocytosis • cytoskeleton organization • glial cell projection elongation • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • GO:0072468 сигнальна трансдукція
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10675


29873

Ensembl


ENSG00000114646


ENSMUSG00000032482

UniProt


O95196


Q71M36

RefSeq (мРНК)


NM_006574 NM_001206942 NM_001206943 NM_001206944 NM_001206945


NM_001166273 NM_013884

RefSeq (білок)


NP_001193871 NP_001193872 NP_001193873 NP_001193874 NP_006565


NP_001159745 NP_038912

Локус (UCSC)

Хр. 3: 47.56 – 47.58 Mb

Хр. 9: 110.07 – 110.09 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CSPG5 (англ. Chondroitin sulfate proteoglycan 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 566 амінокислот, а молекулярна маса — 60 016^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGRAGGGGPG	RGPPPLLLFL	GAALVLASGA	VPAREAGSAV	EAEELVKGSP
AWEPPANDTR	EEAGPPAAGE	DEASWTAPGG	ELAGPEEVLQ	ESAAVTGTAW
LEADSPGLGG	VTAEAGSGDA	QALPATLQAP	HEVLGQSIMP	PAIPEATEAS
GPPSPTPGDK	LSPASELPKE	SPLEVWLNLG	GSTPDPQGPE	LTYPFQGTLE
PQPASDIIDI	DYFEGLDGEG	RGADLGSFPG	SPGTSENHPD	TEGETPSWSL
LDLYDDFTPF	DESDFYPTTS	FYDDLDEEEE	EEEDDKDAVG	GGDLEDENEL
LVPTGKPGLG	PGTGQPTSRW	HAVPPQHTLG	SVPGSSIALR	PRPGEPGRDL
ASSENGTECR	SGFVRHNGSC	RSVCDLFPSY	CHNGGQCYLV	ENIGAFCRCN
TQDYIWHKGM	RCESIITDFQ	VMCVAVGSAA	LVLLLLFMMT	VFFAKKLYLL
KTENTKLRRT	NKFRTPSELH	NDNFSLSTIA	EGSHPNVRKL	CNTPRTSSPH
ARALAHYDNV	ICQDDPSAPH	KIQEVLKSCL	KEEESFNIQN	SMSPKLEGGK
GDQADLDVNC	LQNNLT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція росту, диференціація, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

Hassel B., Schreff M., Stuebe E.-M., Blaich U., Schumacher S. (2003). CALEB/NGC interacts with the Golgi-associated protein PIST. J. Biol. Chem. 278: 40136—40143. PMID 12885772 DOI:10.1074/jbc.M305577200
Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2467 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O95196 (англ.) . Архів оригіналу за 17 листопада 2016. Процитовано 30 серпня 2017.