CRYBG1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3CW3, 2DAD,%%s2DAD | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CRYBG1, ST4, AIM1, absent in melanoma 1, crystallin beta-gamma domain containing 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601797 MGI: 109544 HomoloGene: 18168 GeneCards: CRYBG1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
інсульт, цереброваскулярні хвороби[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • carbohydrate binding • молекулярна функція |
---|
Клітинна компонента | • компонент клітини |
---|
Біологічний процес | • GO:0022610 життєдіяльність |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_172393 NM_001368305 NM_001368306 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 106.36 – 106.57 Mb | Хр. 10: 43.83 – 44.02 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CRYBG1 (англ. Crystallin beta-gamma domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 723 амінокислот, а молекулярна маса — 188 676[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEKRSSGRRS | | GRRRGSQKST | | DSPGADAELP | | ESAARDDAVF | | DDEVAPNAAS |
DNASAEKKVK | | SPRAALDGGV | | ASAASPESKP | | SPGTKGQLRG | | ESDRSKQPPP |
ASSPTKRKGR | | SRALEAVPAP | | PASGPRAPAK | | ESPPKRVPDP | | SPVTKGTAAE |
SGEEAARAIP | | RELPVKSSSL | | LPEIKPEHKR | | GPLPNHFNGR | | AEGGRSRELG |
RAAGAPGASD | | ADGLKPRNHF | | GVGRSTVTTK | | VTLPAKPKHV | | ELNLKTPKNL |
DSLGNEHNPF | | SQPVHKGNTA | | TKISLFENKR | | TNSSPRHTDI | | RGQRNTPASS |
KTFVGRAKLN | | LAKKAKEMEQ | | PEKKVMPNSP | | QNGVLVKETA | | IETKVTVSEE |
EILPATRGMN | | GDSSENQALG | | PQPNQDDKAD | | VQTDAGCLSE | | PVASALIPVK |
DHKLLEKEDS | | EAADSKSLVL | | ENVTDTAQDI | | PTTVDTKDLP | | PTAMPKPQHT |
FSDSQSPAES | | SPGPSLSLSA | | PAPGDVPKDT | | CVQSPISSFP | | CTDLKVSENH |
KGCVLPVSRQ | | NNEKMPLLEL | | GGETTPPLST | | ERSPEAVGSE | | CPSRVLVQVR |
SFVLPVESTQ | | DVSSQVIPES | | SEVREVQLPT | | CHSNEPEVVS | | VASCAPPQEE |
VLGNEHSHCT | | AELAAKSGPQ | | VIPPASEKTL | | PIQAQSQGSR | | TPLMAESSPT |
NSPSSGNHLA | | TPQRPDQTVT | | NGQDSPASLL | | NISAGSDDSV | | FDSSSDMEKF |
TEIIKQMDSA | | VCMPMKRKKA | | RMPNSPAPHF | | AMPPIHEDHL | | EKVFDPKVFT |
FGLGKKKESQ | | PEMSPALHLM | | QNLDTKSKLR | | PKRASAEQSV | | LFKSLHTNTN |
GNSEPLVMPE | | INDKENRDVT | | NGGIKRSRLE | | KSALFSSLLS | | SLPQDKIFSP |
SVTSVNTMTT | | AFSTSQNGSL | | SQSSVSQPTT | | EGAPPCGLNK | | EQSNLLPDNS |
LKVFNFNSSS | | TSHSSLKSPS | | HMEKYPQKEK | | TKEDLDSRSN | | LHLPETKFSE |
LSKLKNDDME | | KANHIESVIK | | SNLPNCANSD | | TDFMGLFKSS | | RYDPSISFSG |
MSLSDTMTLR | | GSVQNKLNPR | | PGKVVIYSEP | | DVSEKCIEVF | | SDIQDCSSWS |
LSPVILIKVV | | RGCWILYEQP | | NFEGHSIPLE | | EGELELSGLW | | GIEDILERHE |
EAESDKPVVI | | GSIRHVVQDY | | RVSHIDLFTE | | PEGLGILSSY | | FDDTEEMQGF |
GVMQKTCSMK | | VHWGTWLIYE | | EPGFQGVPFI | | LEPGEYPDLS | | FWDTEEAYIG |
SMRPLKMGGR | | KVEFPTDPKV | | VVYEKPFFEG | | KCVELETGMC | | SFVMEGGETE |
EATGDDHLPF | | TSVGSMKVLR | | GIWVAYEKPG | | FTGHQYLLEE | | GEYRDWKAWG |
GYNGELQSLR | | PILGDFSNAH | | MIMYSEKNFG | | SKGSSIDVLG | | IVANLKETGY |
GVKTQSINVL | | SGVWVAYENP | | DFTGEQYILD | | KGFYTSFEDW | | GGKNCKISSV |
QPICLDSFTG | | PRRRNQIHLF | | SEPQFQGHSQ | | SFEETTSQID | | DSFSTKSCRV |
SGGSWVVYDG | | ENFTGNQYVL | | EEGHYPCLSA | | MGCPPGATFK | | SLRFIDVEFS |
EPTIILFERE | | DFKGKKIELN | | AETVNLRSLG | | FNTQIRSVQV | | IGGIWVTYEY |
GSYRGRQFLL | | SPAEVPNWYE | | FSGCRQIGSL | | RPFVQKRIYF | | RLRNKATGLF |
MSTNGNLEDL | | KLLRIQVMED | | VGADDQIWIY | | QEGCIKCRIA | | EDCCLTIVGS |
LVTSGSKLGL | | ALDQNADSQF | | WSLKSDGRIY | | SKLKPNLVLD | | IKGGTQYDQN |
HIILNTVSKE | | KFTQVWEAMV | | LYT |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами.
Література
- Ray M.E., Wistow G., Su Y.A., Meltzer P.S., Trent J.M. (1997). AIM1, a novel non-lens member of the betagamma-crystallin superfamily, is associated with the control of tumorigenicity in human malignant melanoma. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 3229—3234. PMID 9096375 DOI:10.1073/pnas.94.7.3229
- Aravind P., Wistow G., Sharma Y., Sankaranarayanan R. (2008). Exploring the limits of sequence and structure in a variant betagamma-crystallin domain of the protein absent in melanoma-1 (AIM1). J. Mol. Biol. 381: 509—518. PMID 18582473 DOI:10.1016/j.jmb.2008.06.019
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CRYBG1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:356 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y4K1 (англ.) . Архів оригіналу за 25 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |