CRAT |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1NM8, 1S5O | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CRAT, carnitine O-acetyltransferase, CAT1, CAT, NBIA8 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600184 MGI: 109501 HomoloGene: 598 GeneCards: CRAT |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • acyltransferase activity • signaling receptor binding • carnitine O-acetyltransferase activity |
---|
Клітинна компонента | • мітохондріальна внутрішня мембрана • пероксисома • peroxisomal matrix • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • мітохондрія • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA oxidase • fatty acid metabolic process • lipid metabolism • carnitine metabolic process, CoA-linked • GO:0015915 транспорт • protein targeting to peroxisome |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_000755 NM_001257363 NM_004003 NM_144782 NM_001346546
| NM_001346547 NM_001346548 NM_001346549 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_000746 NP_001244292 NP_001333475 NP_001333476 NP_001333477
| NP_001333478 NP_003994 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 129.09 – 129.11 Mb | Хр. 2: 30.4 – 30.42 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CRAT (англ. Carnitine O-acetyltransferase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 626 амінокислот, а молекулярна маса — 70 858[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLAFAARTVV | | KPLGFLKPFS | | LMKASSRFKA | | HQDALPRLPV | | PPLQQSLDHY |
LKALQPIVSE | | EEWAHTKQLV | | DEFQASGGVG | | ERLQKGLERR | | ARKTENWLSE |
WWLKTAYLQY | | RQPVVIYSSP | | GVMLPKQDFV | | DLQGQLRFAA | | KLIEGVLDFK |
VMIDNETLPV | | EYLGGKPLCM | | NQYYQILSSC | | RVPGPKQDTV | | SNFSKTKKPP |
THITVVHNYQ | | FFELDVYHSD | | GTPLTADQIF | | VQLEKIWNSS | | LQTNKEPVGI |
LTSNHRNSWA | | KAYNTLIKDK | | VNRDSVRSIQ | | KSIFTVCLDA | | TMPRVSEDVY |
RSHVAGQMLH | | GGGSRLNSGN | | RWFDKTLQFI | | VAEDGSCGLV | | YEHAAAEGPP |
IVTLLDYVIE | | YTKKPELVRS | | PLVPLPMPKK | | LRFNITPEIK | | SDIEKAKQNL |
SIMIQDLDIT | | VMVFHHFGKD | | FPKSEKLSPD | | AFIQMALQLA | | YYRIYGQACA |
TYESASLRMF | | HLGRTDTIRS | | ASMDSLTFVK | | AMDDSSVTEH | | QKVELLRKAV |
QAHRGYTDRA | | IRGEAFDRHL | | LGLKLQAIED | | LVSMPDIFMD | | TSYAIAMHFH |
LSTSQVPAKT | | DCVMFFGPVV | | PDGYGVCYNP | | MEAHINFSLS | | AYNSCAETNA |
ARLAHYLEKA | | LLDMRALLQS | | HPRAKL |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ацилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, транспорт, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі, пероксисомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Corti O., DiDonato S., Finocchiaro G. (1994). Divergent sequences in the 5' region of cDNA suggest alternative splicing as a mechanism for the generation of carnitine acetyltransferases with different subcellular localizations. Biochem. J. 303: 37—41. PMID 7945262 DOI:10.1042/bj3030037
- Corti O., Finocchiaro G., Rossi E., Zuffardi O., Didonato S. (1994). Molecular cloning of cDNAs encoding human carnitine acetyltransferase and mapping of the corresponding gene to chromosome 9q34.1. Genomics. 23: 94—99. PMID 7829107 DOI:10.1006/geno.1994.1463
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2342 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P43155 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |