CPSF2

Ідентифікатори

Символи

CPSF2, CPSF100, cleavage and polyadenylation specific factor 2

Зовнішні ІД

OMIM: 606028 MGI: 1861601 HomoloGene: 6460 GeneCards: CPSF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA polyadenylation • mRNA processing • mRNA cleavage • mRNA 3'-end processing by stem-loop binding and cleavage • mRNA 3'-end processing • mRNA export from nucleus
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


53981


51786

Ensembl


ENSG00000165934


ENSMUSG00000041781

UniProt


Q9P2I0


O35218

RefSeq (мРНК)


NM_017437 NM_001322270 NM_001322271 NM_001322272


NM_016856

RefSeq (білок)


NP_001309199 NP_001309200 NP_001309201 NP_059133


NP_058552

Локус (UCSC)

Хр. 14: 92.12 – 92.17 Mb

Хр. 12: 101.94 – 101.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CPSF2 (англ. Cleavage and polyadenylation specific factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 782 амінокислот, а молекулярна маса — 88 487^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSIIKLTTL	SGVQEESALC	YLLQVDEFRF	LLDCGWDEHF	SMDIIDSLRK
HVHQIDAVLL	SHPDPLHLGA	LPYAVGKLGL	NCAIYATIPV	YKMGQMFMYD
LYQSRHNTED	FTLFTLDDVD	AAFDKIQQLK	FSQIVNLKGK	GHGLSITPLP
AGHMIGGTIW	KIVKDGEEEI	VYAVDFNHKR	EIHLNGCSLE	MLSRPSLLIT
DSFNATYVQP	RRKQRDEQLL	TNVLETLRGD	GNVLIAVDTA	GRVLELAQLL
DQIWRTKDAG	LGVYSLALLN	NVSYNVVEFS	KSQVEWMSDK	LMRCFEDKRN
NPFQFRHLSL	CHGLSDLARV	PSPKVVLASQ	PDLECGFSRD	LFIQWCQDPK
NSIILTYRTT	PGTLARFLID	NPSEKITEIE	LRKRVKLEGK	ELEEYLEKEK
LKKEAAKKLE	QSKEADIDSS	DESDIEEDID	QPSAHKTKHD	LMMKGEGSRK
GSFFKQAKKS	YPMFPAPEER	IKWDEYGEII	KPEDFLVPEL	QATEEEKSKL
ESGLTNGDEP	MDQDLSDVPT	KCISTTESIE	IKARVTYIDY	EGRSDGDSIK
KIINQMKPRQ	LIIVHGPPEA	SQDLAECCRA	FGGKDIKVYM	PKLHETVDAT
SETHIYQVRL	KDSLVSSLQF	CKAKDAELAW	IDGVLDMRVS	KVDTGVILEE
GELKDDGEDS	EMQVEAPSDS	SVIAQQKAMK	SLFGDDEKET	GEESEIIPTL
EPLPPHEVPG	HQSVFMNEPR	LSDFKQVLLR	EGIQAEFVGG	VLVCNNQVAV
RRTETGRIGL	EGCLCQDFYR	IRDLLYEQYA	IV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070
Kolev N.G., Yario T.A., Benson E., Steitz J.A. (2008). Conserved motifs in both CPSF73 and CPSF100 are required to assemble the active endonuclease for histone mRNA 3'-end maturation. EMBO Rep. 9: 1013—1018. PMID 18688255 DOI:10.1038/embor.2008.146
Laishram R.S., Anderson R.A. (2010). The poly A polymerase Star-PAP controls 3'-end cleavage by promoting CPSF interaction and specificity toward the pre-mRNA. EMBO J. 29: 4132—4145. PMID 21102410 DOI:10.1038/emboj.2010.287

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2325 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9P2I0 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2017. Процитовано 11 вересня 2017.