COMMD3-BMI1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2H0D, 3RPG, 4R8P

Ідентифікатори

Символи

COMMD3-BMI1, COMMD3-BMI1 readthrough, BMI1, RNF51, PCGF4

Зовнішні ІД

MGI: 88174 HomoloGene: 3797 GeneCards: COMMD3-BMI1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• promoter-specific chromatin binding • RING-like zinc finger domain binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ubiquitin ligase complex • нуклеоплазма • PRC1 complex • PcG protein complex • клітинне ядро • гіалоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of fibroblast proliferation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • segment specification • negative regulation of gene expression, epigenetic • positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity • регуляція експресії генів • histone H2A-K119 monoubiquitination • negative regulation of G0 to G1 transition • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • кровотворення
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


100532731


12151

Ensembl


ENSG00000269897


ENSMUSG00000026739

UniProt


P35226


P25916

RefSeq (мРНК)


NM_001204062


NM_007552

RefSeq (білок)


NP_001190991 NP_005171


NP_031578

Локус (UCSC)

Хр. 10: 22.32 – 22.33 Mb

Хр. 2: 18.68 – 18.69 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

COMMD3-BMI1 (англ. BMI1 proto-oncogene, polycomb ring finger) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 326 амінокислот, а молекулярна маса — 36 949^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHRTTRIKIT	ELNPHLMCVL	CGGYFIDATT	IIECLHSFCK	TCIVRYLETS
KYCPICDVQV	HKTRPLLNIR	SDKTLQDIVY	KLVPGLFKNE	MKRRRDFYAA
HPSADAANGS	NEDRGEVADE	DKRIITDDEI	ISLSIEFFDQ	NRLDRKVNKD
KEKSKEEVND	KRYLRCPAAM	TVMHLRKFLR	SKMDIPNTFQ	IDVMYEEEPL
KDYYTLMDIA	YIYTWRRNGP	LPLKYRVRPT	CKRMKISHQR	DGLTNAGELE
SDSGSDKANS	PAGGIPSTSS	CLPSPSTPVQ	SPHPQFPHIS	STMNGTSNSP
SGNHQSSFAN	RPRKSSVNGS	SATSSG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Alkema M.J., Wiegand J., Raap A.K., Berns A., van Lohuizen M. (1993). Characterization and chromosomal localization of the human proto-oncogene BMI-1. Hum. Mol. Genet. 2: 1597—1603. PMID 8268912 DOI:10.1093/hmg/2.10.1597
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cao R., Tsukada Y., Zhang Y. (2005). Role of Bmi-1 and Ring1A in H2A ubiquitylation and Hox gene silencing. Mol. Cell. 20: 845—854. PMID 16359901 DOI:10.1016/j.molcel.2005.12.002
Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642
Levy L.S., Lobelle-Rich P.A., Overbaugh J. (1993). flvi-2, a target of retroviral insertional mutagenesis in feline thymic lymphosarcomas, encodes bmi-1. Oncogene. 8: 1833—1838. PMID 8390036

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1066 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P35226 (англ.) . Архів оригіналу за 3 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.