CNTNAP4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CNTNAP4, CASPR4, contactin associated protein like 4, contactin associated protein family member 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610518 MGI: 2183572 HomoloGene: 24912 GeneCards: CNTNAP4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • дендрит (нейробіологія) • синапс • presynaptic membrane • мембрана • GABA-ergic synapse • integral component of presynaptic membrane |
---|
Біологічний процес | • regulation of synaptic transmission, dopaminergic • regulation of grooming behavior • адгезія клітин • regulation of synaptic transmission, GABAergic • GO:1904739 regulation of synapse organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_033401 NM_138994 NM_001322178 NM_001322179 NM_001322180
| NM_001322181 NM_001322187 NM_001322188 NM_001322189 NM_001322190 NM_001322191 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001309107 NP_001309108 NP_001309109 NP_001309110 NP_001309116
| NP_001309117 NP_001309118 NP_001309119 NP_001309120 NP_207837 NP_620481 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 76.28 – 76.56 Mb | Хр. 8: 113.3 – 113.61 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CNTNAP4 (англ. Contactin associated protein like 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 308 амінокислот, а молекулярна маса — 145 274[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGSVTGAVLK | | TLLLLSTQNW | | NRVEAGNSYD | | CDDPLVSALP | | QASFSSSSEL |
SSSHGPGFAR | | LNRRDGAGGW | | SPLVSNKYQW | | LQIDLGERME | | VTAVATQGGY |
GSSNWVTSYL | | LMFSDSGWNW | | KQYRQEDSIW | | GFSGNANADS | | VVYYRLQPSI |
KARFLRFIPL | | EWNPKGRIGM | | RIEVFGCAYR | | SEVVDLDGKS | | SLLYRFDQKS |
LSPIKDIISL | | KFKTMQSDGI | | LLHREGPNGD | | HITLQLRRAR | | LFLLINSGEA |
KLPSTSTLVN | | LTLGSLLDDQ | | HWHSVLIQRL | | GKQVNFTVDE | | HRHHFHARGE |
FNLMNLDYEI | | SFGGIPAPGK | | SVSFPHRNFH | | GCLENLYYNG | | VDIIDLAKQQ |
KPQIIAMGNV | | SFSCSQPQSM | | PVTFLSSRSY | | LALPDFSGEE | | EVSATFQFRT |
WNKAGLLLFS | | ELQLISGGIL | | LFLSDGKLKS | | NLYQPGKLPS | | DITAGVELND |
GQWHSVSLSA | | KKNHLSVAVD | | GQMASAAPLL | | GPEQIYSGGT | | YYFGGCPDKS |
FGSKCKSPLG | | GFQGCMRLIS | | ISGKVVDLIS | | VQQGSLGNFS | | DLQIDSCGIS |
DRCLPNYCEH | | GGECSQSWST | | FHCNCTNTGY | | RGATCHNSIY | | EQSCEAYKHR |
GNTSGFYYID | | SDGSGPLEPF | | LLYCNMTETA | | WTIIQHNGSD | | LTRVRNTNPE |
NPYAGFFEYV | | ASMEQLQATI | | NRAEHCEQEF | | TYYCKKSRLV | | NKQDGTPLSW |
WVGRTNETQT | | YWGGSSPDLQ | | KCTCGLEGNC | | IDSQYYCNCD | | ADRNEWTNDT |
GLLAYKEHLP | | VTKIVITDTG | | RLHSEAAYKL | | GPLLCQGDRS | | FWNSASFDTE |
ASYLHFPTFH | | GELSADVSFF | | FKTTASSGVF | | LENLGIADFI | | RIELRSPTVV |
TFSFDVGNGP | | FEISVQSPTH | | FNDNQWHHVR | | VERNMKEASL | | QVDQLTPKTQ |
PAPADGHVLL | | QLNSQLFVGG | | TATRQRGFLG | | CIRSLQLNGM | | TLDLEERAQV |
TPEVQPGCRG | | HCSSYGKLCR | | NGGKCRERPI | | GFFCDCTFSA | | YTGPFCSNEI |
SAYFGSGSSV | | IYNFQENYLL | | SKNSSSHAAS | | FHGDMKLSRE | | MIKFSFRTTR |
TPSLLLFVSS | | FYKEYLSVII | | AKNGSLQIRY | | KLNKYQEPDV | | VNFDFKNMAD |
GQLHHIMINR | | EEGVVFIEID | | DNRRRQVHLS | | SGTEFSAVKS | | LVLGRILEHS |
DVDQDTALAG | | AQGFTGCLSA | | VQLSHVAPLK | | AALHPSHPDP | | VTVTGHVTES |
SCMAQPGTDA | | TSRERTHSFA | | DHSGTIDDRE | | PLANAIKSDS | | AVIGGLIAVV |
IFILLCITAI | | AVRIYQQKRL | | YKRSEAKRSE | | NVDSAEAVLK | | SELNIQNAVN |
ENQKEYFF |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.
Література
- Liu X., Shepherd T.R., Murray A.M., Xu Z., Fuentes E.J. (2013). The structure of the Tiam1 PDZ domain/ phospho-syndecan1 complex reveals a ligand conformation that modulates protein dynamics. Structure. 21: 342—354. PMID 23395182 DOI:10.1016/j.str.2013.01.004
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18747 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9C0A0 (англ.) . Архів оригіналу за 30 березня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |