CNOT3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4C0D, 4C0G, 5FU6, 5FU7 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CNOT3, LENG2, NOT3, NOT3H, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, IDDSADF |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604910 MGI: 2385261 HomoloGene: 133900 GeneCards: CNOT3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • CCR4-NOT complex • гіалоплазма • P-body • клітинне ядро • CCR4-NOT core complex |
---|
Біологічний процес | • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • multicellular organism development • Сайленсинг генів • negative regulation of translation • regulation of stem cell population maintenance • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • trophectodermal cell differentiation • regulation of translation • transcription, DNA-templated • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • positive regulation of cold-induced thermogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | ENSG00000088038 ENSG00000277600 ENSG00000277114 ENSG00000274616 ENSG00000275979
| ENSG00000277615 ENSG00000276082 ENSG00000274176 ENSG00000274941 ENSG00000273943 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 54.14 – 54.16 Mb | Хр. 7: 3.65 – 3.66 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CNOT3 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 753 амінокислот, а молекулярна маса — 81 872[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADKRKLQGE | | IDRCLKKVSE | | GVEQFEDIWQ | | KLHNAANANQ | | KEKYEADLKK |
EIKKLQRLRD | | QIKTWVASNE | | IKDKRQLIDN | | RKLIETQMER | | FKVVERETKT |
KAYSKEGLGL | | AQKVDPAQKE | | KEEVGQWLTN | | TIDTLNMQVD | | QFESEVESLS |
VQTRKKKGDK | | DKQDRIEGLK | | RHIEKHRYHV | | RMLETILRML | | DNDSILVDAI |
RKIKDDVEYY | | VDSSQDPDFE | | ENEFLYDDLD | | LEDIPQALVA | | TSPPSHSHME |
DEIFNQSSST | | PTSTTSSSPI | | PPSPANCTTE | | NSEDDKKRGR | | STDSEVSQSP |
AKNGSKPVHS | | NQHPQSPAVP | | PTYPSGPPPA | | ASALSTTPGN | | NGVPAPAAPP |
SALGPKASPA | | PSHNSGTPAP | | YAQAVAPPAP | | SGPSTTQPRP | | PSVQPSGGGG |
GGSGGGGSSS | | SSNSSAGGGA | | GKQNGATSYS | | SVVADSPAEV | | ALSSSGGNNA |
SSQALGPPSG | | PHNPPPSTSK | | EPSAAAPTGA | | GGVAPGSGNN | | SGGPSLLVPL |
PVNPPSSPTP | | SFSDAKAAGA | | LLNGPPQFST | | APEIKAPEPL | | SSLKSMAERA |
AISSGIEDPV | | PTLHLTERDI | | ILSSTSAPPA | | SAQPPLQLSE | | VNIPLSLGVC |
PLGPVPLTKE | | QLYQQAMEEA | | AWHHMPHPSD | | SERIRQYLPR | | NPCPTPPYHH |
QMPPPHSDTV | | EFYQRLSTET | | LFFIFYYLEG | | TKAQYLAAKA | | LKKQSWRFHT |
KYMMWFQRHE | | EPKTITDEFE | | QGTYIYFDYE | | KWGQRKKEGF | | TFEYRYLEDR |
DLQ |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Aoki T., Okada N., Wakamatsu T., Tamura T.-A. (2002). TBP-interacting protein 120B, which is induced in relation to myogenesis, binds to NOT3. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296: 1097—1103. PMID 12207886 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02031-4
- Zwartjes C.G., Jayne S., van den Berg D.L., Timmers H.T. (2004). Repression of promoter activity by CNOT2, a subunit of the transcription regulatory Ccr4-not complex. J. Biol. Chem. 279: 10848—10854. PMID 14707134 DOI:10.1074/jbc.M311747200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7879 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O75175 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |