CLEC4A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
5B1W, 5B1X

Ідентифікатори

Символи

CLEC4A, CLECSF6, DCIR, DDB27, LLIR, CD367, HDCGC13P, C-type lectin domain family 4 member A, hDCIR

Зовнішні ІД

OMIM: 605306 MGI: 1349412 HomoloGene: 49291 GeneCards: CLEC4A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transmembrane signaling receptor activity • carbohydrate binding • calcium ion binding • mannose binding • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана
Біологічний процес	• cell surface receptor signaling pathway • адгезія клітин • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • вроджений імунітет • GO:0032697 negative regulation of cytokine production • plasmacytoid dendritic cell antigen processing and presentation • negative regulation of tumor necrosis factor production • CD8-positive, alpha-beta T cell activation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


50856


26888

Ensembl


ENSG00000111729


ENSMUSG00000030148

UniProt


Q9UMR7


Q9QZ15

RefSeq (мРНК)


NM_016184 NM_194447 NM_194448 NM_194450


NM_001170332 NM_001170333 NM_011999

RefSeq (білок)


NP_057268 NP_919429 NP_919430 NP_919432


NP_001163803 NP_001163804 NP_036129

Локус (UCSC)

Хр. 12: 8.12 – 8.14 Mb

Хр. 6: 123.08 – 123.12 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLEC4A (англ. C-type lectin domain family 4 member A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 237 амінокислот, а молекулярна маса — 27 512^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSEITYAEV	RFKNEFKSSG	INTASSAASK	ERTAPHKSNT	GFPKLLCASL
LIFFLLLAIS	FFIAFVIFFQ	KYSQLLEKKT	TKELVHTTLE	CVKKNMPVEE
TAWSCCPKNW	KSFSSNCYFI	STESASWQDS	EKDCARMEAH	LLVINTQEEQ
DFIFQNLQEE	SAYFVGLSDP	EGQRHWQWVD	QTPYNESSTF	WHPREPSDPN
ERCVVLNFRK	SPKRWGWNDV	NCLGPQRSVC	EMMKIHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Richard M., Veilleux P., Rouleau M., Paquin R., Beaulieu A.D. (2002). The expression pattern of the ITIM-bearing lectin CLECSF6 in neutrophils suggests a key role in the control of inflammation. J. Leukoc. Biol. 71: 871—880. PMID 11994513

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13257 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UMR7 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.