CLEC1B : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CLEC1B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2C6U, 3WSR, 3WWK

Ідентифікатори

Символи

CLEC1B, 1810061I13Rik, CLEC2, CLEC2B, PRO1384, QDED721, C-type lectin domain family 1 member B

Зовнішні ІД

OMIM: 606783 MGI: 1913287 HomoloGene: 49468 GeneCards: CLEC1B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • transmembrane signaling receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана
Біологічний процес	• platelet activation • defense response • cell surface receptor signaling pathway • Тромбоцитопоез • GO:0072468 сигнальна трансдукція
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51266


56760

Ensembl


ENSG00000165682


ENSMUSG00000030159

UniProt


Q9P126


Q9JL99

RefSeq (мРНК)


NM_001099431 NM_016509 NM_001393342


NM_001204239 NM_001204253 NM_019985

RefSeq (білок)


NP_001092901 NP_057593


NP_001191168 NP_001191182 NP_064369

Локус (UCSC)

Хр. 12: 9.99 – 10.01 Mb

Хр. 6: 129.37 – 129.39 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLEC1B (англ. C-type lectin domain family 1 member B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 229 амінокислот, а молекулярна маса — 26 596^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQDEDGYITL	NIKTRKPALI	SVGSASSSWW	RVMALILLIL	CVGMVVGLVA
LGIWSVMQRN	YLQGENENRT	GTLQQLAKRF	CQYVVKQSEL	KGTFKGHKCS
PCDTNWRYYG	DSCYGFFRHN	LTWEESKQYC	TDMNATLLKI	DNRNIVEYIK
ARTHLIRWVG	LSRQKSNEVW	KWEDGSVISE	NMFEFLEDGK	GNMNCAYFHN
GKMHPTFCEN	KHYLMCERKA	GMTKVDQLP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у мембрані.

Література

Colonna M., Samaridis J., Angman L. (2000). Molecular characterization of two novel C-type lectin-like receptors, one of which is selectively expressed in human dendritic cells. Eur. J. Immunol. 30: 697—704. PMID 10671229 DOI:10.1002/1521-4141(200002)30:2<697::AID-IMMU697>3.0.CO;2-M
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24356 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9P126 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.