CHMP3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2XZE, 3FRT, 3FRV, 2GD5

Ідентифікатори

Символи

CHMP3, NEDF, VPS24, CGI-149, charged multivesicular body protein 3

Зовнішні ІД

OMIM: 610052 MGI: 1913950 HomoloGene: 6368 GeneCards: CHMP3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylcholine binding • protein homodimerization activity • ubiquitin-specific protease binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • мембрана • клітинна мембрана • ендосома • late endosome membrane • екзосома • ESCRT III complex • гіалоплазма • внутрішньоклітинний • late endosome • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • multivesicular body
Біологічний процес	• GO:0000046 autophagosome maturation • GO:0019067 viral life cycle • protein polymerization • multivesicular body assembly • клітинний цикл • поділ клітини • regulation of mitotic spindle assembly • endosomal transport • regulation of centrosome duplication • GO:0097285 апоптоз • protein heterooligomerization • vacuolar transport • septum digestion after cytokinesis • protein transport • nucleus organization • mitotic metaphase plate congression • multivesicular body sorting pathway • regulation of exosomal secretion • macroautophagy • multivesicular body-lysosome fusion • regulation of early endosome to late endosome transport • GO:0015915 транспорт • viral budding via host ESCRT complex • endosome transport via multivesicular body sorting pathway • late endosome to vacuole transport • midbody abscission
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51652


66700

Ensembl


ENSG00000115561


ENSMUSG00000053119

UniProt


Q9Y3E7


Q9CQ10

RefSeq (мРНК)


NM_001005753 NM_001193517 NM_016079


NM_025783 NM_001355674 NM_001355675 NM_001361405

RefSeq (білок)


NP_001005753 NP_001180446 NP_057163


NP_080059 NP_001342603 NP_001342604 NP_001348334

Локус (UCSC)

Хр. 2: 86.5 – 86.56 Mb

Хр. 6: 71.52 – 71.56 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CHMP3 (англ. Charged multivesicular body protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 222 амінокислот, а молекулярна маса — 25 073^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGLFGKTQEK	PPKELVNEWS	LKIRKEMRVV	DRQIRDIQRE	EEKVKRSVKD
AAKKGQKDVC	IVLAKEMIRS	RKAVSKLYAS	KAHMNSVLMG	MKNQLAVLRV
AGSLQKSTEV	MKAMQSLVKI	PEIQATMREL	SKEMMKAGII	EEMLEDTFES
MDDQEEMEEE	AEMEIDRILF	EITAGALGKA	PSKVTDALPE	PEPPGAMAAS
EDEEEEEEAL	EAMQSRLATL	RS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

Wilson E.M., Oh Y., Hwa V., Rosenfeld R.G. (2001). Interaction of IGF-binding protein-related protein 1 with a novel protein, neuroendocrine differentiation factor, results in neuroendocrine differentiation of prostate cancer cells. J. Clin. Endocrinol. Metab. 86: 4504—4511. PMID 11549700 DOI:10.1210/jcem.86.9.7845
Khoury C.M., Yang Z., Ismail S., Greenwood M.T. (2007). Characterization of a novel alternatively spliced human transcript encoding an N-terminally truncated Vps24 protein that suppresses the effects of Bax in an ESCRT independent manner in yeast. Gene. 391: 233—241. PMID 17331679 DOI:10.1016/j.gene.2006.12.039
Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
Lin Y., Kimpler L.A., Naismith T.V., Lauer J.M., Hanson P.I. (2005). Interaction of the mammalian endosomal sorting complex required for transport (ESCRT) III protein hSnf7-1 with itself, membranes, and the AAA+ ATPase SKD1. J. Biol. Chem. 280: 12799—12809. PMID 15632132 DOI:10.1074/jbc.M413968200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29865 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y3E7 (англ.) . Архів оригіналу за 24 жовтня 2016. Процитовано 29 серпня 2017.