CDH12 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CDH12, CDHB, cadherin 12 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600562 MGI: 109503 HomoloGene: 37873 GeneCards: CDH12 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell surface • catenin complex |
---|
Біологічний процес | • адгезія клітин • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004061 NM_001317227 NM_001317228 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001304156 NP_001304157 NP_004052 NP_001351033 NP_001351034
| NP_001351035 NP_001351036 NP_001351037 NP_001351038 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 21.75 – 22.85 Mb | Хр. 15: 20.45 – 21.59 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CDH12 (англ. Cadherin 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 794 амінокислот, а молекулярна маса — 88 332[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLTRNCLSLL | | LWVLFDGGLL | | TPLQPQPQQT | | LATEPRENVI | | HLPGQRSHFQ |
RVKRGWVWNQ | | FFVLEEYVGS | | EPQYVGKLHS | | DLDKGEGTVK | | YTLSGDGAGT |
VFTIDETTGD | | IHAIRSLDRE | | EKPFYTLRAQ | | AVDIETRKPL | | EPESEFIIKV |
QDINDNEPKF | | LDGPYVATVP | | EMSPVGAYVL | | QVKATDADDP | | TYGNSARVVY |
SILQGQPYFS | | IDPKTGVIRT | | ALPNMDREVK | | EQYQVLIQAK | | DMGGQLGGLA |
GTTIVNITLT | | DVNDNPPRFP | | KSIFHLKVPE | | SSPIGSAIGR | | IRAVDPDFGQ |
NAEIEYNIVP | | GDGGNLFDIV | | TDEDTQEGVI | | KLKKPLDFET | | KKAYTFKVEA |
SNLHLDHRFH | | SAGPFKDTAT | | VKISVLDVDE | | PPVFSKPLYT | | MEVYEDTPVG |
TIIGAVTAQD | | LDVGSSAVRY | | FIDWKSDGDS | | YFTIDGNEGT | | IATNELLDRE |
STAQYNFSII | | ASKVSNPLLT | | SKVNILINVL | | DVNEFPPEIS | | VPYETAVCEN |
AKPGQIIQIV | | SAADRDLSPA | | GQQFSFRLSP | | EAAIKPNFTV | | RDFRNNTAGI |
ETRRNGYSRR | | QQELYFLPVV | | IEDSSYPVQS | | STNTMTIRVC | | RCDSDGTILS |
CNVEAIFLPV | | GLSTGALIAI | | LLCIVILLAI | | VVLYVALRRQ | | KKKDTLMTSK |
EDIRDNVIHY | | DDEGGGEEDT | | QAFDIGALRN | | PKVIEENKIR | | RDIKPDSLCL |
PRQRPPMEDN | | TDIRDFIHQR | | LQENDVDPTA | | PPYDSLATYA | | YEGSGSVAES |
LSSIDSLTTE | | ADQDYDYLTD | | WGPRFKVLAD | | MFGEEESYNP | | DKVT |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1751 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P55289 (англ.) . Архів оригіналу за 10 січня 2018. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |