CD200R1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4BFG, 4BFI

Ідентифікатори

Символи

CD200R1, CD200R, HCRTR2, MOX2R, OX2R, CD200 receptor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 607546 MGI: 1889024 HomoloGene: 10957 GeneCards: CD200R1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • immunoglobulin receptor activity • signaling receptor activity • glycosylated region protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • extracellular region • receptor complex • мембрана • external side of plasma membrane • клітинна мембрана • cell surface
Біологічний процес	• GO:0022415 viral process • regulation of immune response • GO:0072468 сигнальна трансдукція • heterotypic cell-cell adhesion • GO:0007243 intracellular signal transduction • Fc receptor signaling pathway • regulation of neuroinflammatory response • negative regulation of neuroinflammatory response • negative regulation of neuron death • negative regulation of macrophage migration • negative regulation of T cell migration
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


131450


57781

Ensembl


ENSG00000163606


ENSMUSG00000022667

UniProt


Q8TD46


Q9ES57

RefSeq (мРНК)


NM_138806 NM_138939 NM_138940 NM_170780


NM_021325

RefSeq (білок)


NP_620161 NP_620385 NP_620386 NP_740750


NP_067300

Локус (UCSC)

Хр. 3: 112.92 – 112.98 Mb

Хр. 16: 44.59 – 44.62 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CD200R1 (англ. CD200 receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 325 амінокислот, а молекулярна маса — 36 620^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLCPWRTANL	GLLLILTIFL	VAASSSLCMD	EKQITQNYSK	VLAEVNTSWP
VKMATNAVLC	CPPIALRNLI	IITWEIILRG	QPSCTKAYRK	ETNETKETNC
TDERITWVSR	PDQNSDLQIR	PVAITHDGYY	RCIMVTPDGN	FHRGYHLQVL
VTPEVTLFQN	RNRTAVCKAV	AGKPAAQISW	IPEGDCATKQ	EYWSNGTVTV
KSTCHWEVHN	VSTVTCHVSH	LTGNKSLYIE	LLPVPGAKKS	AKLYIPYIIL
TIIILTIVGF	IWLLKVNGCR	KYKLNKTEST	PVVEEDEMQP	YASYTEKNNP
LYDTTNKVKA	SEALQSEVDT	DLHTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Vaine C.A., Soberman R.J. (2014). The CD200-CD200R1 inhibitory signaling pathway: immune regulation and host-pathogen interactions. Adv. Immunol. 121: 191—211. PMID 24388216 DOI:10.1016/B978-0-12-800100-4.00005-2

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24235 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8TD46 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.