CCDC80

Ідентифікатори

Символи

CCDC80, DRO1, SSG1, URB, okuribin, coiled-coil domain containing 80, CL2, LINC01279

Зовнішні ІД

OMIM: 608298 MGI: 1915146 HomoloGene: 12206 GeneCards: CCDC80

Онтологія гена
Молекулярна функція	• fibronectin binding • glycosaminoglycan binding • heparin binding
Клітинна компонента	• extracellular region • базальна мембрана • interstitial matrix • GO:0005578 Позаклітинна матриця
Біологічний процес	• extracellular matrix organization • positive regulation of cell-substrate adhesion • response to bacterium
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


151887


67896

Ensembl


ENSG00000091986


ENSMUSG00000022665

UniProt


Q76M96


Q8R2G6

RefSeq (мРНК)


NM_199512 NM_199511 NM_178274


NM_026439

RefSeq (білок)


NP_955805 NP_955806


NP_080715

Локус (UCSC)

Хр. 3: 112.6 – 112.65 Mb

Хр. 16: 44.91 – 44.95 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CCDC80 (англ. Coiled-coil domain containing 80) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 950 амінокислот, а молекулярна маса — 108 174^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTWRMGPRFT	MLLAMWLVCG	SEPHPHATIR	GSHGGRKVPL	VSPDSSRPAR
FLRHTGRSRG	IERSTLEEPN	LQPLQRRRSV	PVLRLARPTE	PPARSDINGA
AVRPEQRPAA	RGSPREMIRD	EGSSARSRML	RFPSGSSSPN	ILASFAGKNR
VWVISAPHAS	EGYYRLMMSL	LKDDVYCELA	ERHIQQIVLF	HQAGEEGGKV
RRITSEGQIL	EQPLDPSLIP	KLMSFLKLEK	GKFGMVLLKK	TLQVEERYPY
PVRLEAMYEV	IDQGPIRRIE	KIRQKGFVQK	CKASGVEGQV	VAEGNDGGGG
AGRPSLGSEK	KKEDPRRAQV	PPTRESRVKV	LRKLAATAPA	LPQPPSTPRA
TTLPPAPATT	VTRSTSRAVT	VAARPMTTTA	FPTTQRPWTP	SPSHRPPTTT
EVITARRPSV	SENLYPPSRK	DQHRERPQTT	RRPSKATSLE	SFTNAPPTTI
SEPSTRAAGP	GRFRDNRMDR	REHGHRDPNV	VPGPPKPAKE	KPPKKKAQDK
ILSNEYEEKY	DLSRPTASQL	EDELQVGNVP	LKKAKESKKH	EKLEKPEKEK
KKKMKNENAD	KLLKSEKQMK	KSEKKSKQEK	EKSKKKKGGK	TEQDGYQKPT
NKHFTQSPKK	SVADLLGSFE	GKRRLLLITA	PKAENNMYVQ	QRDEYLESFC
KMATRKISVI	TIFGPVNNST	MKIDHFQLDN	EKPMRVVDDE	DLVDQRLISE
LRKEYGMTYN	DFFMVLTDVD	LRVKQYYEVP	ITMKSVFDLI	DTFQSRIKDM
EKQKKEGIVC	KEDKKQSLEN	FLSRFRWRRR	LLVISAPNDE	DWAYSQQLSA
LSGQACNFGL	RHITILKLLG	VGEEVGGVLE	LFPINGSSVV	EREDVPAHLV
KDIRNYFQVS	PEYFSMLLVG	KDGNVKSWYP	SPMWSMVIVY	DLIDSMQLRR
QEMAIQQSLG	MRCPEDEYAG	YGYHSYHQGY	QDGYQDDYRH	HESYHHGYPY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30649 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q76M96 (англ.) . Архів оригіналу за 3 грудня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.