BPI |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1BP1, 1EWF | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | BPI, bactericidal/permeability-increasing protein, BPIFD1, rbactericidal permeability increasing protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 109195 MGI: 3045315 HomoloGene: 37519 GeneCards: BPI |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • lipid binding • lipopolysaccharide binding |
---|
Клітинна компонента | • екзосома • мембрана • цитоплазма • integral component of plasma membrane • extracellular region • міжклітинний простір • azurophil granule lumen • specific granule lumen • cytoplasmic stress granule |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of interleukin-6 production • negative regulation of interleukin-8 production • defense response to bacterium • negative regulation of tumor necrosis factor production • negative regulation of macrophage activation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • antimicrobial humoral response • neutrophil degranulation • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 20: 38.3 – 38.34 Mb | Хр. 2: 158.1 – 158.13 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
BPI (англ. Bactericidal/permeability-increasing protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 487 амінокислот, а молекулярна маса — 53 900[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRENMARGPC | | NAPRWASLMV | | LVAIGTAVTA | | AVNPGVVVRI | | SQKGLDYASQ |
QGTAALQKEL | | KRIKIPDYSD | | SFKIKHLGKG | | HYSFYSMDIR | | EFQLPSSQIS |
MVPNVGLKFS | | ISNANIKISG | | KWKAQKRFLK | | MSGNFDLSIE | | GMSISADLKL |
GSNPTSGKPT | | ITCSSCSSHI | | NSVHVHISKS | | KVGWLIQLFH | | KKIESALRNK |
MNSQVCEKVT | | NSVSSELQPY | | FQTLPVMTKI | | DSVAGINYGL | | VAPPATTAET |
LDVQMKGEFY | | SENHHNPPPF | | APPVMEFPAA | | HDRMVYLGLS | | DYFFNTAGLV |
YQEAGVLKMT | | LRDDMIPKES | | KFRLTTKFFG | | TFLPEVAKKF | | PNMKIQIHVS |
ASTPPHLSVQ | | PTGLTFYPAV | | DVQAFAVLPN | | SSLASLFLIG | | MHTTGSMEVS |
AESNRLVGEL | | KLDRLLLELK | | HSNIGPFPVE | | LLQDIMNYIV | | PILVLPRVNE |
KLQKGFPLPT | | PARVQLYNVV | | LQPHQNFLLF | | GADVVYK |
Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beamer L.J., Carroll S.F., Eisenberg D. (1997). Crystal structure of human BPI and two bound phospholipids at 2.4-A resolution. Science. 276: 1861—1864. PMID 9188532 DOI:10.1126/science.276.5320.1861
- Kleiger G., Beamer L.J., Grothe R., Mallick P., Eisenberg D. (2000). The 1.7 A crystal structure of BPI: a study of how two dissimilar amino acid sequences can adopt the same fold. J. Mol. Biol. 299: 1019—1034. PMID 10843855 DOI:10.1006/jmbi.2000.3805
- Wasiluk K.R., Skubitz K.M., Gray B.H. (1991). Comparison of granule proteins from human polymorphonuclear leukocytes which are bactericidal toward Pseudomonas aeruginosa. Infect. Immun. 59: 4193—4200. PMID 1937776
- Ooi C.E., Weiss J., Elsbach P., Frangione B., Mannion B. (1987). A 25-kDa NH2-terminal fragment carries all the antibacterial activities of the human neutrophil 60-kDa bactericidal/permeability-increasing protein. J. Biol. Chem. 262: 14891—14894. PMID 3667613
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1095 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P17213 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |