BPI (ген)

BPI

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1BP1, 1EWF

Ідентифікатори

Символи

BPI, bactericidal/permeability-increasing protein, BPIFD1, rbactericidal permeability increasing protein

Зовнішні ІД

OMIM: 109195 MGI: 3045315 HomoloGene: 37519 GeneCards: BPI

Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipid binding • lipopolysaccharide binding
Клітинна компонента	• екзосома • мембрана • цитоплазма • integral component of plasma membrane • extracellular region • міжклітинний простір • azurophil granule lumen • specific granule lumen • cytoplasmic stress granule
Біологічний процес	• negative regulation of interleukin-6 production • negative regulation of interleukin-8 production • defense response to bacterium • negative regulation of tumor necrosis factor production • negative regulation of macrophage activation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • antimicrobial humoral response • neutrophil degranulation • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


671


329547

Ensembl


ENSG00000101425


ENSMUSG00000052922

UniProt


P17213


Q67E05

RefSeq (мРНК)


NM_001725


NM_177850 NM_001356542

RefSeq (білок)


NP_001716


NP_808518 NP_001343471

Локус (UCSC)

Хр. 20: 38.3 – 38.34 Mb

Хр. 2: 158.1 – 158.13 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

BPI (англ. Bactericidal/permeability-increasing protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 487 амінокислот, а молекулярна маса — 53 900^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRENMARGPC	NAPRWASLMV	LVAIGTAVTA	AVNPGVVVRI	SQKGLDYASQ
QGTAALQKEL	KRIKIPDYSD	SFKIKHLGKG	HYSFYSMDIR	EFQLPSSQIS
MVPNVGLKFS	ISNANIKISG	KWKAQKRFLK	MSGNFDLSIE	GMSISADLKL
GSNPTSGKPT	ITCSSCSSHI	NSVHVHISKS	KVGWLIQLFH	KKIESALRNK
MNSQVCEKVT	NSVSSELQPY	FQTLPVMTKI	DSVAGINYGL	VAPPATTAET
LDVQMKGEFY	SENHHNPPPF	APPVMEFPAA	HDRMVYLGLS	DYFFNTAGLV
YQEAGVLKMT	LRDDMIPKES	KFRLTTKFFG	TFLPEVAKKF	PNMKIQIHVS
ASTPPHLSVQ	PTGLTFYPAV	DVQAFAVLPN	SSLASLFLIG	MHTTGSMEVS
AESNRLVGEL	KLDRLLLELK	HSNIGPFPVE	LLQDIMNYIV	PILVLPRVNE
KLQKGFPLPT	PARVQLYNVV	LQPHQNFLLF	GADVVYK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beamer L.J., Carroll S.F., Eisenberg D. (1997). Crystal structure of human BPI and two bound phospholipids at 2.4-A resolution. Science. 276: 1861—1864. PMID 9188532 DOI:10.1126/science.276.5320.1861
Kleiger G., Beamer L.J., Grothe R., Mallick P., Eisenberg D. (2000). The 1.7 A crystal structure of BPI: a study of how two dissimilar amino acid sequences can adopt the same fold. J. Mol. Biol. 299: 1019—1034. PMID 10843855 DOI:10.1006/jmbi.2000.3805
Wasiluk K.R., Skubitz K.M., Gray B.H. (1991). Comparison of granule proteins from human polymorphonuclear leukocytes which are bactericidal toward Pseudomonas aeruginosa. Infect. Immun. 59: 4193—4200. PMID 1937776
Ooi C.E., Weiss J., Elsbach P., Frangione B., Mannion B. (1987). A 25-kDa NH2-terminal fragment carries all the antibacterial activities of the human neutrophil 60-kDa bactericidal/permeability-increasing protein. J. Biol. Chem. 262: 14891—14894. PMID 3667613

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1095 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P17213 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.