BDP1

Ідентифікатори

Символи

BDP1, HSA238520, TAF3B1, TFC5, TFIIIB150, TFIIIB90, TFNR, B double prime 1, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor IIIB, DFNB112, TFIIIB

Зовнішні ІД

OMIM: 607012 MGI: 1347077 HomoloGene: 34582 GeneCards: BDP1

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • TFIIIC-class transcription factor complex binding • RNA polymerase III general transcription initiation factor activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • transcription factor TFIIIB complex • нуклеоплазма
Біологічний процес	• regulation of transcription by RNA polymerase III • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • RNA polymerase III preinitiation complex assembly • transcription by RNA polymerase III
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55814


544971

Ensembl


ENSG00000274803 ENSG00000273873 ENSG00000145734


ENSMUSG00000049658

UniProt


A6H8Y1 H7C5U4


Q571C7

RefSeq (мРНК)


NM_018429


NM_001081061

RefSeq (білок)


NP_060899


NP_001074530

Локус (UCSC)

Хр. 5: 71.46 – 71.57 Mb

Хр. 13: 100.02 – 100.1 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

BDP1 (англ. B double prime 1, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor IIIB) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 624 амінокислот, а молекулярна маса — 293 885^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFRRARLSVK	PNVRPGVGAR	GSTASNPQRG	RESPRPPDPA	TDSASKPAEP
TDVPTVDFGG	AEPQEKAPRS	STEKTGGDND	VEESSRSSST	VSQRRKRISS
TSSLVKSSVS	VPSESHPLST	INQEAPQPTA	TSTKEKQPCS	DRYRIYKAQK
LREMLKEELR	KEKKQWKNKY	AINESQRPPD	RSKMTMRDFI	YYLPDNNPMT
SSLEQEKKTE	KPSTPVQTRE	QEGKSTPNAE	DNEMEEETDD	GPLLVPRVKV
AEDGSIILDE	ESLTVEVLRT	KGPCVVEEND	PIFERGSTTT	YSSFRKNYYS
KPWSNKETDM	FFLAISMVGT	DFSMIGQLFP	HRARIEIKNK	FKREEKTNGW
RIDKAFQEKR	PFDFDFFAHL	LQKVLAEEEK	RKQKSVKNHS	LKEKKSTKPR
KNVKVKKVAC	EGVNNDPDES	MSSRISDTER	SQKDAQTVEE	ESLTLSREDA
EQVALEVDLN	QKKRRRKKQD	GANELGVNNL	LENATVQAGP	SKGEKHKNKC
QAIRPELKEG	ECSKEQMLSC	TQNIDGIVGF	ASTEKVEKRT	DPILSLSNQQ
DATSVATESS	ESSTSDLPSF	EVGIRALCEV	NNAEGSCIEE	RNVDLKNNSL
EIDQTENVKP	MLRGRFQRPK	PNLSRAGKKS	VLSQGKTESE	SKNSHSKTSV
EKNHVEKDKM	NTLDILRMET	TERENPEAET	VSVLGEKNCL	QEGSQLKALR
PVQVRGRLQK	PKPNAGKAAE	RKEILISQEE	IGANVEKNEN	ESCADRDTPQ
HMEDQSRKDF	EEEDVILQPE	KNDSFQNVQP	DEPKVLNECL	SVQENNKANK
LNQVPILRTR	FQKPKPNIGR	GTGRREISSK	EEVLEKILVS	GEMAAALRET
VRLDTSPKEM	VPAEINTKEM	QSDLKETGRR	AISPREKILD	VIDDTIEMET
GLKAMGREIC	LREKTPEVID	ATEEIDKDLE	EAGRREISPQ	KNGPEEVKPL
GEVETDLKAT	GNESSPREKT	PEVTDATEEI	DKNLEETGRR	KISPRENGPE
EVKPVDEMET	DLNATGRESS	PREKTPEVID	ATEEIDLEET	EREVSPQENG
LEEVKPLGEM	ETDLKATGRD	SFPRGKTPEV	IDAIEEIEID	LEETEREISP
QENGLEEVKP	LGEMQTDLKA	TGREISPREK	TPEVIDATEE	IDKDLEETGR
REISPEENGP	EEVKPVDEME	TDLKTTGREG	SSREKTREVI	DAAEVIETDL
EETEREISPQ	ENGPEEVKPV	GKMETDLKEI	REEISQREKV	LAEFSAIREK
EIDLKETGKR	DIPIMEKVSG	KMAVVEEMEA	DLKETGKENF	RERGSEEICV
TEEKVAELKQ	TGKTDISPRE	NELEETSTSR	QTDTHLMQSG	SNDFSAVPSL
DIQNISSEVL	SMMHTPVEEK	RNSEKEVSSH	FSHFKISSQT	HESDKTEVQG
IQSPDVPEQF	SDINLSKSLP	QEQKPLEIKP	APFVRSRFKR	PKPNLARAAL
KRETTESEKY	IYEKKSETKK	METIVMQENN	EQTDTLPSQH	DEASLMISRE
KDTLGHRNEE	AVILPCTQTE	RNLSPSNSCE	PKEESQSAPV	QKNDSVVSVG
TNNVNTFQQE	MKESVIQTAR	QVRGRLQRPR	PNIRKTGQRQ	IVDKGEAKGI
IKEGRTILPK	DETEKKVLTV	SNSQIETEIE	VPSSAVPEHR	MYENQSQVVL
VENLHVNKTN	ETIRHENKPY	VPSSAQMTRR	KFQKAKPNLG	RAHSKKEEPV
LEKVTTDQSK	EGKPEDHLLQ	KGASNTQLLL	KEKAELLTSL	EVSARKDCVG
SKESALAKID	AELEEVGPSR	RVGEETVGDN	SPSSVVEEQY	LNKLTSCPQP
LNETSYSKIA	LDGKTTISST	SEYERNRGER	RSHKKFKPNV	TRGRGSKRVR
GKTSKKEPRA	SKAMLVTLRA	SQEEDDDADD	FESDYEEESY	HLAPEEVNKA
PVFVPVGLRS	PEPVSAQIEE	TMEELEITVN	VPDVGCIAVV	EHELPNTDVT
TEEMKQEENL	SVPFEMTTSE	HIQDEPGTND	GSTEAAITLL	TMGDLVLQSE
ISSEQGDVGV	CIIPHVHSKD	KSHIPSSLDN	VNHKIVHECQ	ELSSPVITTS
PASFEENKIV	LEEQSSREEI	SLMEKVKENA	TPTRNTISKV	TSNLRIRSRL
AKPKPNLEKT	LGTNRLDDYQ	EVSSLCVTKG	AEMETQRETE	KNASKATELE
NKNLGPVTTA	ENKDQSKLAC	VHGIKGTSIS	SEVNLTERNE	NQEESSQEVH
MLSVAPVASS	ETGPCTLGLD	RGLGENSVEE	PQIKDSKGDS	VLTLPVPEYT
PTSIPEVQQE	NIINPQDLTV	NLVANVPQDG	EDEQAFILTL	VEIPANAVEE
FTDATAQFMP	NPLLPAPILV	KSVNTEERGD	MSICLPATSV	GQDAMGLSIS
GRDNSKKPPD	NLDLVSRKRF	QCRLDKNDHI	PPAKKRSLTL	RDDCQEYTTE
VHSKELTNVF	EETGESHKGQ	DIFLTSGSTL	TTPEPQRQQV	EAAFQSRGSR
SPDACMDKNV	PQLPQDEMIV	SDKEERTDAA	PKSQQMDSRT	SSSKASLSRP
GRRPLGFLSL	ICSKNSLESD	EPMQVHSKKR	LKPLIPGLRK	KLKRSNPFNE
SQEKNRESSD	LLPSPSVITT	QSENISSSAT	QVSCDQPLLK	EGYKSAQKRA
PQGEATTVSE	YFFNDIFIEV	DETE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

Schramm L., Pendergrast P.S., Sun Y., Hernandez N. (2000). Different human TFIIIB activities direct RNA polymerase III transcription from TATA-containing and TATA-less promoters. Genes Dev. 14: 2650—2663. PMID 11040218 DOI:10.1101/gad.836400
Kelter A.R., Herchenbach J., Wirth B. (2000). The transcription factor-like nuclear regulator (TFNR) contains a novel 55-amino-acid motif repeated nine times and maps closely to SMN1. Genomics. 70: 315—326. PMID 11161782 DOI:10.1006/geno.2000.6396
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Teichmann M., Wang Z., Roeder R.G. (2000). A stable complex of a novel transcription factor IIB- related factor, human TFIIIB50, and associated proteins mediate selective transcription by RNA polymerase III of genes with upstream promoter elements. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 14200—14205. PMID 11121026 DOI:10.1073/pnas.97.26.14200
Fairley J.A., Scott P.H., White R.J. (2003). TFIIIB is phosphorylated, disrupted and selectively released from tRNA promoters during mitosis in vivo. EMBO J. 22: 5841—5850. PMID 14592981 DOI:10.1093/emboj/cdg544
Hu P., Samudre K., Wu S., Sun Y., Hernandez N. (2004). CK2 phosphorylation of Bdp1 executes cell cycle-specific RNA polymerase III transcription repression. Mol. Cell. 16: 81—92. PMID 15469824 DOI:10.1016/j.molcel.2004.09.008

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з BDP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13652 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, A6H8Y1 (англ.) . Архів оригіналу за 16 листопада 2016. Процитовано 5 вересня 2017.