ARL1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1UPT, 4DCN, 5EE5

Ідентифікатори

Символи

ARL1, ARFL1, ADP ribosylation factor like GTPase 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603425 MGI: 99436 HomoloGene: 20319 GeneCards: ARL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GO:0010577 enzyme activator activity • GO:0006184 GTPase activity • protein domain specific binding • зв'язування з іоном металу • GTP binding
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі • Golgi membrane • внутрішньоклітинний • мембрана • цитоплазма • trans-Golgi network • trans-Golgi network membrane • гіалоплазма
Біологічний процес	• protein localization to Golgi apparatus • toxin metabolic process • activation of phospholipase D activity • retrograde transport, endosome to Golgi • Golgi organization • Golgi vesicle transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


400


104303

Ensembl


ENSG00000120805


ENSMUSG00000060904

UniProt


P40616


P61211

RefSeq (мРНК)


NM_001301068 NM_001177


NM_025859

RefSeq (білок)


NP_001168 NP_001287997


NP_080135

Локус (UCSC)

Хр. 12: 101.39 – 101.41 Mb

Хр. 10: 88.57 – 88.58 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ARL1 (англ. ADP ribosylation factor like GTPase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 181 амінокислот, а молекулярна маса — 20 418^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGGFFSSIFS	SLFGTREMRI	LILGLDGAGK	TTILYRLQVG	EVVTTIPTIG
FNVETVTYKN	LKFQVWDLGG	QTSIRPYWRC	YYSNTDAVIY	VVDSCDRDRI
GISKSELVAM	LEEEELRKAI	LVVFANKQDM	EQAMTSSEMA	NSLGLPALKD
RKWQIFKTSA	TKGTGLDEAM	EWLVETLKSR	Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, ГТФ, іоном магнію. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Van Valkenburgh H., Shern J.F., Sharer J.D., Zhu X., Kahn R.A. (2001). ADP-ribosylation factors (ARFs) and ARF-like 1 (ARL1) have both specific and shared effectors: characterizing ARL1-binding proteins. J. Biol. Chem. 276: 22826—22837. PMID 11303027 DOI:10.1074/jbc.M102359200
Panic B., Perisic O., Veprintsev D.B., Williams R.L., Munro S. (2003). Structural basis for Arl1-dependent targeting of homodimeric GRIP domains to the Golgi apparatus. Mol. Cell. 12: 863—874. PMID 14580338 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00356-3

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:692 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P40616 (англ.) . Архів оригіналу за 14 грудня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.