ARHGEF7

ARHGEF7
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1BY1, 1ZSG, 2L3G

Ідентифікатори
Символи ARHGEF7, BETA-PIX, COOL-1, COOL1, Nbla10314, P50, P50BP, P85, P85COOL1, P85SPR, PAK3, PIXB, Rho guanine nucleotide exchange factor 7
Зовнішні ІД OMIM: 605477 MGI: 1860493 HomoloGene: 2895 GeneCards: ARHGEF7
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• guanyl-nucleotide exchange factor activity
• protein kinase binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• cell projection
• focal adhesion
• ruffle
• клітинна мембрана
• міжклітинні контакти
• neuronal cell body
• cell cortex
• neuron projection
• storage vacuole
• lamellipodium
• внутрішньоклітинний

Біологічний процес

• regulation of GTP binding
• GO:0007243 intracellular signal transduction
• negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway
• positive regulation of lamellipodium morphogenesis
• Golgi organization
• ephrin receptor signaling pathway
• нейробіологія розвитку
• focal adhesion assembly
• positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading
• positive regulation of growth hormone secretion
• hematopoietic progenitor cell differentiation
• positive regulation of apoptotic process
• positive regulation of protein binding
• regulation of Rho protein signal transduction
• regulation of small GTPase mediated signal transduction
• positive regulation of fibroblast migration
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• lamellipodium assembly
• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
• G protein-coupled receptor signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8874
54126
Ensembl
ENSG00000102606
ENSMUSG00000031511
UniProt
Q14155
Q9ES28
RefSeq (мРНК)
NM_001113511
NM_001113512
NM_001113513
NM_003899
NM_145735
NM_001320851
NM_001320852
NM_001320853
NM_001320854
NM_001330597
NM_001330598
NM_001354046
NM_001354047
NM_001354048
NM_001354049
NM_001354050
NM_001354051
NM_001354052
NM_001354053
NM_001354054
NM_001354055
NM_001354056
NM_001354057
NM_001354058
NM_001354059
NM_001354060
NM_001354061
NM_001113517
NM_001113518
NM_017402
NM_001372321
NM_001372322
NM_001372323
NM_001372324
NM_001372325
NM_001372326
RefSeq (білок)
NP_001106983
NP_001106984
NP_001106985
NP_001307780
NP_001307781
NP_001307782
NP_001307783
NP_001317526
NP_001317527
NP_003890
NP_663788
NP_001340975
NP_001340976
NP_001340977
NP_001340978
NP_001340979
NP_001340980
NP_001340981
NP_001340982
NP_001340983
NP_001340984
NP_001340985
NP_001340986
NP_001340987
NP_001340988
NP_001340989
NP_001340990
NP_001106985.1
NP_003890.1
NP_001307780.1
NP_001106989
NP_001106990
NP_059098
NP_001359250
NP_001359251
NP_001359252
NP_001359253
NP_001359254
NP_001359255
Локус (UCSC) Хр. 13: 111.11 – 111.31 Mb Хр. 8: 11.73 – 11.84 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ARHGEF7 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 803 амінокислот, а молекулярна маса — 90 012[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNSAEQTVTWLITLGVLESPKKTISDPEGFLQASLKDGVVLCRLLERLLP
GTIEKVYPEPRSESECLSNIREFLRGCGASLRLELLFPPSQPPQHLVTTI
LLSASTFDANDLYQGQNFNKVLSSLVTLNKVTADIGLGSDSVCARPSSHR
IKSFDSLGSQSLHTRTSKLFQGQYRSLDMTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNE
DELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSP
KSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRP
LQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCF
LNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLT
TGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQE
VRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERY
LLLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISG
SMIERILVSCNNQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSH
PVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPW
SLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFAS
RKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSTWQGTDLMHNHVLADDDQ
PSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSEDSDYDSIWTAHSYRMGSTSRKSCCSYIS
HQN

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

  • Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
  • Bagrodia S., Taylor S.J., Jordon K.A., Van Aelst L., Cerione R.A. (1998). A novel regulator of p21-activated kinases. J. Biol. Chem. 273: 23633—23636. PMID 9726964 DOI:10.1074/jbc.273.37.23633
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Homma K., Kikuno R.F., Nagase T., Ohara O., Nishikawa K. (2004). Alternative splice variants encoding unstable protein domains exist in the human brain. J. Mol. Biol. 343: 1207—1220. PMID 15491607 DOI:10.1016/j.jmb.2004.09.028
  • Mott H.R., Nietlispach D., Evetts K.A., Owen D. (2005). Structural analysis of the SH3 domain of beta-PIX and its interaction with alpha-p21 activated kinase (PAK). Biochemistry. 44: 10977—10983. PMID 16101281 DOI:10.1021/bi050374a

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15607 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. ↑ UniProt, Q14155 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 13
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.