APBB1IP

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2MWN, 3ZDL

Ідентифікатори

Символи

APBB1IP, amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 1 interacting protein, INAG1, PREL1, RARP1, RIAM, amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein

Зовнішні ІД

OMIM: 609036 MGI: 1861354 HomoloGene: 32434 GeneCards: APBB1IP

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • міжклітинні контакти • cell projection • T cell receptor complex • цитоскелет • мембрана • focal adhesion • lamellipodium • гіалоплазма • клітинна мембрана
Біологічний процес	• T cell activation via T cell receptor contact with antigen bound to MHC molecule on antigen presenting cell • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cell adhesion
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54518


54519

Ensembl


ENSG00000077420


ENSMUSG00000026786

UniProt


Q7Z5R6


Q8R5A3

RefSeq (мРНК)


NM_019043


NM_019456

RefSeq (білок)


NP_061916


NP_062329

Локус (UCSC)

Хр. 10: 26.44 – 26.57 Mb

Хр. 2: 22.66 – 22.77 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

APBB1IP (англ. Amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 666 амінокислот, а молекулярна маса — 73 183^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGESSEDIDQ	MFSTLLGEMD	LLTQSLGVDT	LPPPDPNPPR	AEFNYSVGFK
DLNESLNALE	DQDLDALMAD	LVADISEAEQ	RTIQAQKESL	QNQHHSASLQ
ASIFSGAASL	GYGTNVAATG	ISQYEDDLPP	PPADPVLDLP	LPPPPPEPLS
QEEEEAQAKA	DKIKLALEKL	KEAKVKKLVV	KVHMNDNSTK	SLMVDERQLA
RDVLDNLFEK	THCDCNVDWC	LYEIYPELQI	ERFFEDHENV	VEVLSDWTRD
TENKILFLEK	EEKYAVFKNP	QNFYLDNRGK	KESKETNEKM	NAKNKESLLE
ESFCGTSIIV	PELEGALYLK	EDGKKSWKRR	YFLLRASGIY	YVPKGKTKTS
RDLACFIQFE	NVNIYYGTQH	KMKYKAPTDY	CFVLKHPQIQ	KESQYIKYLC
CDDTRTLNQW	VMGIRIAKYG	KTLYDNYQRA	VAKAGLASRW	TNLGTVNAAA
PAQPSTGPKT	GTTQPNGQIP	QATHSVSAVL	QEAQRHAETS	KDKKPALGNH
HDPAVPRAPH	APKSSLPPPP	PVRRSSDTSG	SPATPLKAKG	TGGGGLPAPP
DDFLPPPPPP	PPLDDPELPP	PPPDFMEPPP	DFVPPPPPSY	AGIAGSELPP
PPPPPPAPAP	APVPDSARPP	PAVAKRPPVP	PKRQENPGHP	GGAGGGEQDF
MSDLMKALQK	KRGNVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

Jenzora A., Behrendt B., Small J.V., Wehland J., Stradal T.E. (2005). PREL1 provides a link from Ras signalling to the actin cytoskeleton via Ena/VASP proteins. FEBS Lett. 579: 455—463. PMID 15642358 DOI:10.1016/j.febslet.2004.10.110
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17379 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q7Z5R6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.