AMFR

AMFR
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2EJS, 2LVN, 2LVO, 2LVP, 2LVQ, 2LXH, 2LXP, 3FSH, 3H8K, 3TIW, 4G3O, 4LAD

Ідентифікатори
Символи AMFR, GP78, RNF45, autocrine motility factor receptor
Зовнішні ІД OMIM: 603243 MGI: 1345634 HomoloGene: 888 GeneCards: AMFR
Онтологія гена
Молекулярна функція

• protein-macromolecule adaptor activity
• chaperone binding
• GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
• зв'язування з іоном металу
• GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity
• ubiquitin-ubiquitin ligase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• ubiquitin-specific protease binding
• transferase activity
• identical protein binding
• BAT3 complex binding
• signaling receptor activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• integral component of membrane
• мембрана
• growth cone
• integral component of endoplasmic reticulum membrane
• neuronal cell body
• дендрит (нейробіологія)
• Derlin-1 retrotranslocation complex
• perinuclear region of cytoplasm
• клітинне ядро
• ендоплазматичний ретикулум
• endoplasmic reticulum membrane
• комплекс Ґольджі
• endoplasmic reticulum quality control compartment
• GO:0009327 protein-containing complex
• ubiquitin ligase complex
• гіалоплазма

Біологічний процес

• ERAD pathway
• ubiquitin-dependent protein catabolic process
• GO:0010260 старіння людини
• protein polyubiquitination
• Відповідь на незгорнуті білки
• protein K48-linked ubiquitination
• protein complex oligomerization
• Убіквітин-залежний протеоліз
• ubiquitin-dependent ERAD pathway
• learning or memory
• positive regulation of protein binding
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• protein autoubiquitination
• згортання білків
• endoplasmic reticulum mannose trimming

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
267
23802
Ensembl
ENSG00000159461
ENSMUSG00000031751
UniProt
Q9UKV5
Q9R049
RefSeq (мРНК)
NM_001144
NM_138958
NM_001323511
NM_001323512
NM_011787
RefSeq (білок)
NP_001135
NP_001310440
NP_001310441
NP_035917
Локус (UCSC) Хр. 16: 56.36 – 56.43 Mb Хр. 8: 94.7 – 94.74 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

AMFR (англ. Autocrine motility factor receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 643 амінокислот, а молекулярна маса — 72 996[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPLLFLERFPWPSLRTYTGLSGLALLGTIISAYRALSQPEAGPGEPDQLT
ASLQPEPPAPARPSAGGPRARDVAQYLLSDSLFVWVLVNTACCVLMLVAK
LIQCIVFGPLRVSERQHLKDKFWNFIFYKFIFIFGVLNVQTVEEVVMWCL
WFAGLVFLHLMVQLCKDRFEYLSFSPTTPMSSHGRVLSLLVAMLLSCCGL
AAVCSITGYTHGMHTLAFMAAESLLVTVRTAHVILRYVIHLWDLNHEGTW
EGKGTYVYYTDFVMELTLLSLDLMHHIHMLLFGNIWLSMASLVIFMQLRY
LFHEVQRRIRRHKNYLRVVGNMEARFAVATPEELAVNNDDCAICWDSMQA
ARKLPCGHLFHNSCLRSWLEQDTSCPTCRMSLNIADNNRVREEHQGENLD
ENLVPVAAAEGRPRLNQHNHFFHFDGSRIASWLPSFSVEVMHTTNILGIT
QASNSQLNAMAHQIQEMFPQVPYHLVLQDLQLTRSVEITTDNILEGRIQV
PFPTQRSDSIRPALNSPVERPSSDQEEGETSAQTERVPLDLSPRLEETLD
FGEVEVEPSEVEDFEARGSRFSKSADERQRMLVQRKDELLQQARKRFLNK
SSEDDAASESFLPSEGASSDPVTLRRRMLAAAAERRLQKQQTS

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Huang B., Xie Y., Raz A. (1995). Identification of an upstream region that controls the transcription of the human autocrine motility factor receptor. Biochem. Biophys. Res. Commun. 212: 727—742. PMID 7626106 DOI:10.1006/bbrc.1995.2031
  • Song B.L., Sever N., DeBose-Boyd R.A. (2005). Gp78, a membrane-anchored ubiquitin ligase, associates with Insig-1 and couples sterol-regulated ubiquitination to degradation of HMG CoA reductase. Mol. Cell. 19: 829—840. PMID 16168377 DOI:10.1016/j.molcel.2005.08.009
  • Hanzelmann P., Schindelin H. (2011). The structural and functional basis of the p97/valosin-containing protein (VCP)-interacting motif (VIM): mutually exclusive binding of cofactors to the N-terminal domain of p97. J. Biol. Chem. 286: 38679—38690. PMID 21914798 DOI:10.1074/jbc.M111.274506

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:463 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q9UKV5 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»