AKAP1

Ідентифікатори

Символи

AKAP1, AKAP, AKAP121, AKAP149, AKAP84, D-PPP1R43, PRKA1, SAKAP84, TDRD17, A-kinase anchoring protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602449 MGI: 104729 HomoloGene: 31165 GeneCards: AKAP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase A regulatory subunit binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мітохондрія • мітохондріальна зовнішня мембрана • мембрана • гіалоплазма
Біологічний процес	• regulation of protein kinase A signaling • зсідання крові
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8165


11640

Ensembl


ENSG00000121057


ENSMUSG00000018428

UniProt


Q92667


O08715

RefSeq (мРНК)

NM_001242902 NM_001242903 NM_003488 NM_139275 NM_001370423
NM_001370424 NM_001370425 NM_001370426 NM_001370427


NM_001042541 NM_009648

RefSeq (білок)

NP_001229831 NP_001229832 NP_003479 NP_001357352 NP_001357353
NP_001357354 NP_001357355 NP_001357356


NP_001036006 NP_033778

Локус (UCSC)

Хр. 17: 57.09 – 57.12 Mb

Хр. 11: 88.72 – 88.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

AKAP1 (англ. A-kinase anchoring protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 903 амінокислот, а молекулярна маса — 97 342^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAIQFRSLFP	LALPGMLALL	GWWWFFSRKK	GHVSSHDEQQ	VEAGAVQLRA
DPAIKEPLPV	EDVCPKVVST	PPSVTEPPEK	ELSTVSKLPA	EPPALLQTHP
PCRRSESSGI	LPNTTDMRLR	PGTRRDDSTK	LELALTGGEA	KSIPLECPLS
SPKGVLFSSK	SAEVCKQDSP	FSRVPRKVQP	GYPVVPAEKR	SSGERARETG
GAEGTGDAVL	GEKVLEEALL	SREHVLELEN	SKGPSLASLE	GEEDKGKSSS
SQVVGPVQEE	EYVAEKLPSR	FIESAHTELA	KDDAAPAPPV	ADAKAQDRGV
EGELGNEESL	DRNEEGLDRN	EEGLDRNEES	LDRNEEGLDR	NEEIKRAAFQ
IISQVISEAT	EQVLATTVGK	VAGRVCQASQ	LQGQKEESCV	PVHQKTVLGP
DTAEPATAEA	AVAPPDAGLP	LPGLPAEGSP	PPKTYVSCLK	SLLSSPTKDS
KPNISAHHIS	LASCLALTTP	SEELPDRAGI	LVEDATCVTC	MSDSSQSVPL
VASPGHCSDS	FSTSGLEDSC	TETSSSPRDK	AITPPLPEST	VPFSNGVLKG
ELSDLGAEDG	WTMDAEADHS	GGSDRNSMDS	VDSCCSLKKT	ESFQNAQAGS
NPKKVDLIIW	EIEVPKHLVG	RLIGKQGRYV	SFLKQTSGAK	IYISTLPYTQ
SVQICHIEGS	QHHVDKALNL	IGKKFKELNL	TNIYAPPLPS	LALPSLPMTS
WLMLPDGITV	EVIVVNQVNA	GHLFVQQHTH	PTFHALRSLD	QQMYLCYSQP
GIPTLPTPVE	ITVICAAPGA	DGAWWRAQVV	ASYEETNEVE	IRYVDYGGYK
RVKVDVLRQI	RSDFVTLPFQ	GAEVLLDSVM	PLSDDDQFSP	EADAAMSEMT
GNTALLAQVT	SYSPTGLPLI	QLWSVVGDEV	VLINRSLVER	GLAQWVDSYY
TSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

Trendelenburg G., Hummel M., Riecken E.-O., Hanski C. (1996). Molecular characterization of AKAP149, a novel A kinase anchor protein with a KH domain. Biochem. Biophys. Res. Commun. 225: 313—319. PMID 8769136 DOI:10.1006/bbrc.1996.1172
Lin R.-Y., Moss S.B., Rubin C.S. (1995). Characterization of S-AKAP84, a novel developmentally regulated A kinase anchor protein of male germ cells. J. Biol. Chem. 270: 27804—27811. PMID 7499250 DOI:10.1074/jbc.270.46.27804
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:367 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q92667 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.