AIM2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3RN2, 3RN5, 3VD8, 4O7Q

Ідентифікатори

Символи

AIM2, PYHIN4, absent in melanoma 2

Зовнішні ІД

OMIM: 604578 MGI: 2686159 HomoloGene: 83226 GeneCards: AIM2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • double-stranded DNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • AIM2 inflammasome complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • мітохондрія • гіалоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity • Піроптоз • cellular response to interferon-beta • процес імунної системи • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of interleukin-1 beta production • positive regulation of protein oligomerization • activation of innate immune response • inflammatory response • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of defense response to virus by host • GO:0097285 апоптоз • вроджений імунітет
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9447


383619

Ensembl


ENSG00000163568


ENSMUSG00000037860

UniProt


O14862


Q91VJ1

RefSeq (мРНК)


NM_004833 NM_001348247


NM_001013779

RefSeq (білок)


NP_004824 NP_001335176


NP_001013801

Локус (UCSC)

Хр. 1: 159.06 – 159.19 Mb

Хр. 1: 173.35 – 173.47 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

AIM2 (англ. Absent in melanoma 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 343 амінокислот, а молекулярна маса — 38 954^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESKYKEILL	LTGLDNITDE	ELDRFKFFLS	DEFNIATGKL	HTANRIQVAT
LMIQNAGAVS	AVMKTIRIFQ	KLNYMLLAKR	LQEEKEKVDK	QYKSVTKPKP
LSQAEMSPAA	SAAIRNDVAK	QRAAPKVSPH	VKPEQKQMVA	QQESIREGFQ
KRCLPVMVLK	AKKPFTFETQ	EGKQEMFHAT	VATEKEFFFV	KVFNTLLKDK
FIPKRIIIIA	RYYRHSGFLE	VNSASRVLDA	ESDQKVNVPL	NIIRKAGETP
KINTLQTQPL	GTIVNGLFVV	QKVTEKKKNI	LFDLSDNTGK	MEVLGVRNED
TMKCKEGDKV	RLTFFTLSKN	GEKLQLTSGV	HSTIKVIKAK	KKT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fernandes-Alnemri T., Yu J.W., Datta P., Wu J., Alnemri E.S. (2009). AIM2 activates the inflammasome and cell death in response to cytoplasmic DNA. Nature. 458: 509—513. PMID 19158676 DOI:10.1038/nature07710
Veeranki S., Duan X., Panchanathan R., Liu H., Choubey D. (2011). IFI16 protein mediates the anti-inflammatory actions of the type-I interferons through suppression of activation of caspase-1 by inflammasomes. PLoS ONE. 6: E27040—E27040. PMID 22046441 DOI:10.1371/journal.pone.0027040

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:357 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, O14862 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.