AGXT |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1H0C, 1J04, 2YOB, 3R9A, 4CBR, 4CBS, 4I8A, 4KXK, 4KYO | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | AGXT, AGT, AGT1, AGXT1, PH1, SPAT, SPT, TLH6, alanine-glyoxylate aminotransferase, alanine--glyoxylate and serine--pyruvate aminotransferase, Ser-PyrAT |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604285 MGI: 1329033 HomoloGene: 37251 GeneCards: AGXT |
---|
шифр КФ | 2.6.1.44 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
primary hyperoxaluria type I[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • protein homodimerization activity • amino acid binding • alanine-glyoxylate transaminase activity • serine-pyruvate transaminase activity • transaminase activity • protein self-association • каталітична активність • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • pyridoxal phosphate binding • signaling receptor binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • пероксисома • мітохондріальний матрикс • peroxisomal matrix • мітохондрія • внутрішньоклітинна мембранна органела • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • Сигнальний шлях Notch • oxalic acid secretion • glyoxylate catabolic process • glycine biosynthetic process, by transamination of glyoxylate • pyruvate biosynthetic process • L-alanine catabolic process • response to glucocorticoid • response to cAMP • L-cysteine catabolic process • cellular nitrogen compound metabolic process • glyoxylate metabolic process • protein targeting to peroxisome |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 240.87 – 240.88 Mb | Хр. 1: 93.06 – 93.07 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
AGXT (англ. Alanine-glyoxylate aminotransferase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 392 амінокислот, а молекулярна маса — 43 010[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASHKLLVTP | | PKALLKPLSI | | PNQLLLGPGP | | SNLPPRIMAA | | GGLQMIGSMS |
KDMYQIMDEI | | KEGIQYVFQT | | RNPLTLVISG | | SGHCALEAAL | | VNVLEPGDSF |
LVGANGIWGQ | | RAVDIGERIG | | ARVHPMTKDP | | GGHYTLQEVE | | EGLAQHKPVL |
LFLTHGESST | | GVLQPLDGFG | | ELCHRYKCLL | | LVDSVASLGG | | TPLYMDRQGI |
DILYSGSQKA | | LNAPPGTSLI | | SFSDKAKKKM | | YSRKTKPFSF | | YLDIKWLANF |
WGCDDQPRMY | | HHTIPVISLY | | SLRESLALIA | | EQGLENSWRQ | | HREAAAYLHG |
RLQALGLQLF | | VKDPALRLPT | | VTTVAVPAGY | | DWRDIVSYVI | | DHFDIEIMGG |
LGPSTGKVLR | | IGLLGCNATR | | ENVDRVTEAL | | RAALQHCPKK | | KL |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, амінотрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом. Локалізований у мітохондрії, пероксисомах.
Література
- Nishiyama K., Berstein G., Oda T., Ichiyama A. (1990). Cloning and nucleotide sequence of cDNA encoding human liver serine-pyruvate aminotransferase. Eur. J. Biochem. 194: 9—18. PMID 2253628 DOI:10.1111/j.1432-1033.1990.tb19420.x
- Purdue P.E., Takada Y., Danpure C.J. (1990). Identification of mutations associated with peroxisome-to-mitochondrion mistargeting of alanine/glyoxylate aminotransferase in primary hyperoxaluria type 1. J. Cell Biol. 111: 2341—2351. PMID 1703535 DOI:10.1083/jcb.111.6.2341
- Takada Y., Kaneko N., Esumi H., Purdue P.E., Danpure C.J. (1990). Human peroxisomal L-alanine: glyoxylate aminotransferase. Evolutionary loss of a mitochondrial targeting signal by point mutation of the initiation codon. Biochem. J. 268: 517—520. PMID 2363689 DOI:10.1042/bj2680517
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Purdue P.E., Lumb M.J., Allsop J., Minatogawa Y., Danpure C.J. (1992). A glycine-to-glutamate substitution abolishes alanine:glyoxylate aminotransferase catalytic activity in a subset of patients with primary hyperoxaluria type 1. Genomics. 13: 215—218. PMID 1349575 DOI:10.1016/0888-7543(92)90225-H
- Danpure C.J. (1993). Primary hyperoxaluria type 1 and peroxisome-to-mitochondrion mistargeting of alanine:glyoxylate aminotransferase. Biochimie. 75: 309—315. PMID 8507692 DOI:10.1016/0300-9084(93)90091-6
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з AGXT переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:341 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P21549 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |