AFAP1

Ідентифікатори

Символи

AFAP1, AFAP, AFAP-110, AFAP110, actin filament associated protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608252 MGI: 1917542 HomoloGene: 11009 GeneCards: AFAP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin binding • SH3 domain binding • SH2 domain binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • цитоскелет • focal adhesion • гіалоплазма • actin cytoskeleton
Біологічний процес	• regulation of signal transduction • regulation of cytoskeleton organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


60312


70292

Ensembl


ENSG00000196526


ENSMUSG00000029094

UniProt


Q8N556


Q80YS6

RefSeq (мРНК)


NM_001134647 NM_021638 NM_198595 NM_001371090 NM_001371091


NM_027373

RefSeq (білок)


NP_001128119 NP_940997 NP_001358019 NP_001358020


NP_081649 NP_001390348 NP_001390349 NP_001390350

Локус (UCSC)

Хр. 4: 7.76 – 7.94 Mb

Хр. 5: 36.05 – 36.16 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

AFAP1 (англ. Actin filament associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 730 амінокислот, а молекулярна маса — 80 725^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEELIVELRL	FLELLDHEYL	TSTVREKKAV	ITNILLRIQS	SKGFDVKDHA
QKQETANSLP	APPQMPLPEI	PQPWLPPDSG	PPPLPTSSLP	EGYYEEAVPL
SPGKAPEYIT	SNYDSDAMSS	SYESYDEEEE	DGKGKKTRHQ	WPSEEASMDL
VKDAKICAFL	LRKKRFGQWT	KLLCVIKDTK	LLCYKSSKDQ	QPQMELPLQG
CNITYIPKDS	KKKKHELKIT	QQGTDPLVLA	VQSKEQAEQW	LKVIKEAYSG
CSGPVDSECP	PPPSSPVHKA	ELEKKLSSER	PSSDGEGVVE	NGITTCNGKE
QVKRKKSSKS	EAKGTVSKVT	GKKITKIISL	GKKKPSTDEQ	TSSAEEDVPT
CGYLNVLSNS	RWRERWCRVK	DNKLIFHKDR	TDLKTHIVSI	PLRGCEVIPG
LDSKHPLTFR	LLRNGQEVAV	LEASSSEDMG	RWIGILLAET	GSSTDPEALH
YDYIDVEMSA	SVIQTAKQTF	CFMNRRVISA	NPYLGGTSNG	YAHPSGTALH
YDDVPCINGS	LKGKKPPVAS	NGVTGKGKTL	SSQPKKADPA	AVVKRTGSNA
AQYKYGKNRV	EADAKRLQTK	EEELLKRKEA	LRNRLAQLRK	ERKDLRAAIE
VNAGRKPQAI	LEEKLKQLEE	ECRQKEAERV	SLELELTEVK	ESLKKALAGG
VTLGLAIEPK	SGTSSPQSPV	FRHRTLENSP	ISSCDTSDTE	GPVPVNSAAV
LKKSQAAPGS	SPCRGHVLRK	AKEWELKNGT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Dorfleutner A., Stehlik C., Zhang J., Gallick G.E., Flynn D.C. (2007). AFAP-110 is required for actin stress fiber formation and cell adhesion in MDA-MB-231 breast cancer cells. J. Cell. Physiol. 213: 740—749. PMID 17520695 DOI:10.1002/jcp.21143

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24017 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8N556 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.