ADAMTS4

ADAMTS4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2RJP, 3B2Z, 4WK7, 4WKE, 4WKI

Ідентифікатори
Символи ADAMTS4, ADAMTS-2, ADAMTS-4, ADMP-1, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 4
Зовнішні ІД OMIM: 603876 MGI: 1339949 HomoloGene: 36169 GeneCards: ADAMTS4
Онтологія гена
Молекулярна функція

• protease binding
• GO:0070122 peptidase activity
• zinc ion binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• hydrolase activity
• metallopeptidase activity
• зв'язування з іоном металу
• metalloendopeptidase activity

Клітинна компонента

• extracellular region
• міжклітинний простір
• nuclear speck
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

• skeletal system development
• extracellular matrix disassembly
• протеоліз

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9507
240913
Ensembl
ENSG00000158859
ENSMUSG00000006403
UniProt
O75173
Q8BNJ2
RefSeq (мРНК)
NM_005099
NM_001320336
NM_172845
RefSeq (білок)
NP_001307265
NP_005090
NP_766433
Локус (UCSC) Хр. 1: 161.18 – 161.2 Mb Хр. 1: 171.08 – 171.09 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ADAMTS4 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 837 амінокислот, а молекулярна маса — 90 197[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSQTGSHPGRGLAGRWLWGAQPCLLLPIVPLSWLVWLLLLLLASLLPSAR
LASPLPREEEIVFPEKLNGSVLPGSGAPARLLCRLQAFGETLLLELEQDS
GVQVEGLTVQYLGQAPELLGGAEPGTYLTGTINGDPESVASLHWDGGALL
GVLQYRGAELHLQPLEGGTPNSAGGPGAHILRRKSPASGQGPMCNVKAPL
GSPSPRPRRAKRFASLSRFVETLVVADDKMAAFHGAGLKRYLLTVMAAAA
KAFKHPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQVGPSAAQTLRSFCAWQRGLN
TPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGVSTCDTLGMADVGTVCDPARSCAIVED
DGLQSAFTAAHELGHVFNMLHDNSKPCISLNGPLSTSRHVMAPVMAHVDP
EEPWSPCSARFITDFLDNGYGHCLLDKPEAPLHLPVTFPGKDYDADRQCQ
LTFGPDSRHCPQLPPPCAALWCSGHLNGHAMCQTKHSPWADGTPCGPAQA
CMGGRCLHMDQLQDFNIPQAGGWGPWGPWGDCSRTCGGGVQFSSRDCTRP
VPRNGGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPTGSALTFREEQCAAYNHRTDLFKSF
PGPMDWVPRYTGVAPQDQCKLTCQAQALGYYYVLEPRVVDGTPCSPDSSS
VCVQGRCIHAGCDRIIGSKKKFDKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRKFRYGYN
NVVTIPAGATHILVRQQGNPGHRSIYLALKLPDGSYALNGEYTLMPSPTD
VVLPGAVSLRYSGATAASETLSGHGPLAQPLTLQVLVAGNPQDTRLRYSF
FVPRPTPSTPRPTPQDWLHRRAQILEILRRRPWAGRK

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • Wainwright S.D., Bondeson J., Hughes C.E. (2006). An alternative spliced transcript of ADAMTS4 is present in human synovium from OA patients. Matrix Biol. 25: 317—320. PMID 16723216 DOI:10.1016/j.matbio.2006.03.006
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Wainwright S.D., Bondeson J., Caterson B., Hughes C.E. (2013). ADAMTS-4_v1 is a splice variant of ADAMTS-4 that is expressed as a protein in human synovium and cleaves aggrecan at the interglobular domain. Arthritis Rheum. 65: 2866—2875. PMID 23897278 DOI:10.1002/art.38102

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:220 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, O75173 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
  • п
  • о
  • р
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM
Матриксні металопротеїнази

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.