ABCA5 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ABCA5, ABC13, EST90625, ATP binding cassette subfamily A member 5, HTC3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 612503 MGI: 2386607 HomoloGene: 10263 GeneCards: ABCA5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • ATPase activity • ATP binding • lipid transporter activity • ATPase-coupled transmembrane transporter activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • ендосома • late endosome • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • late endosome membrane • мембрана • Golgi membrane • лізосома • lysosomal membrane |
---|
Біологічний процес | • lipid transport • high-density lipoprotein particle remodeling • cholesterol efflux • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation • reverse cholesterol transport • cholesterol transport • трансмембранний транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 69.24 – 69.33 Mb | Хр. 11: 110.16 – 110.23 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ABCA5 (англ. ATP binding cassette subfamily A member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 642 амінокислот, а молекулярна маса — 186 508[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSTAIREVGV | | WRQTRTLLLK | | NYLIKCRTKK | | SSVQEILFPL | | FFLFWLILIS |
MMHPNKKYEE | | VPNIELNPMD | | KFTLSNLILG | | YTPVTNITSS | | IMQKVSTDHL |
PDVIITEEYT | | NEKEMLTSSL | | SKPSNFVGVV | | FKDSMSYELR | | FFPDMIPVSS |
IYMDSRAGCS | | KSCEAAQYWS | | SGFTVLQASI | | DAAIIQLKTN | | VSLWKELEST |
KAVIMGETAV | | VEIDTFPRGV | | ILIYLVIAFS | | PFGYFLAIHI | | VAEKEKKIKE |
FLKIMGLHDT | | AFWLSWVLLY | | TSLIFLMSLL | | MAVIATASLL | | FPQSSSIVIF |
LLFFLYGLSS | | VFFALMLTPL | | FKKSKHVGIV | | EFFVTVAFGF | | IGLMIILIES |
FPKSLVWLFS | | PFCHCTFVIG | | IAQVMHLEDF | | NEGASFSNLT | | AGPYPLIITI |
IMLTLNSIFY | | VLLAVYLDQV | | IPGEFGLRRS | | SLYFLKPSYW | | SKSKRNYEEL |
SEGNVNGNIS | | FSEIIEPVSS | | EFVGKEAIRI | | SGIQKTYRKK | | GENVEALRNL |
SFDIYEGQIT | | ALLGHSGTGK | | STLMNILCGL | | CPPSDGFASI | | YGHRVSEIDE |
MFEARKMIGI | | CPQLDIHFDV | | LTVEENLSIL | | ASIKGIPANN | | IIQEVQKVLL |
DLDMQTIKDN | | QAKKLSGGQK | | RKLSLGIAVL | | GNPKILLLDE | | PTAGMDPCSR |
HIVWNLLKYR | | KANRVTVFST | | HFMDEADILA | | DRKAVISQGM | | LKCVGSSMFL |
KSKWGIGYRL | | SMYIDKYCAT | | ESLSSLVKQH | | IPGATLLQQN | | DQQLVYSLPF |
KDMDKFSGLF | | SALDSHSNLG | | VISYGVSMTT | | LEDVFLKLEV | | EAEIDQADYS |
VFTQQPLEEE | | MDSKSFDEME | | QSLLILSETK | | AALVSTMSLW | | KQQMYTIAKF |
HFFTLKRESK | | SVRSVLLLLL | | IFFTVQIFMF | | LVHHSFKNAV | | VPIKLVPDLY |
FLKPGDKPHK | | YKTSLLLQNS | | ADSDISDLIS | | FFTSQNIMVT | | MINDSDYVSV |
APHSAALNVM | | HSEKDYVFAA | | VFNSTMVYSL | | PILVNIISNY | | YLYHLNVTET |
IQIWSTPFFQ | | EITDIVFKIE | | LYFQAALLGI | | IVTAMPPYFA | | MENAENHKIK |
AYTQLKLSGL | | LPSAYWIGQA | | VVDIPLFFII | | LILMLGSLLA | | FHYGLYFYTV |
KFLAVVFCLI | | GYVPSVILFT | | YIASFTFKKI | | LNTKEFWSFI | | YSVAALACIA |
ITEITFFMGY | | TIATILHYAF | | CIIIPIYPLL | | GCLISFIKIS | | WKNVRKNVDT |
YNPWDRLSVA | | VISPYLQCVL | | WIFLLQYYEK | | KYGGRSIRKD | | PFFRNLSTKS |
KNRKLPEPPD | | NEDEDEDVKA | | ERLKVKELMG | | CQCCEEKPSI | | MVSNLHKEYD |
DKKDFLLSRK | | VKKVATKYIS | | FCVKKGEILG | | LLGPNGAGKS | | TIINILVGDI |
EPTSGQVFLG | | DYSSETSEDD | | DSLKCMGYCP | | QINPLWPDTT | | LQEHFEIYGA |
VKGMSASDMK | | EVISRITHAL | | DLKEHLQKTV | | KKLPAGIKRK | | LCFALSMLGN |
PQITLLDEPS | | TGMDPKAKQH | | MWRAIRTAFK | | NRKRAAILTT | | HYMEEAEAVC |
DRVAIMVSGQ | | LRCIGTVQHL | | KSKFGKGYFL | | EIKLKDWIEN | | LEVDRLQREI |
QYIFPNASRQ | | ESFSSILAYK | | IPKEDVQSLS | | QSFFKLEEAK | | HAFAIEEYSF |
SQATLEQVFV | | ELTKEQEEED | | NSCGTLNSTL | | WWERTQEDRV | | VF |
Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.
Література
- Petry F., Kotthaus A., Hirsch-Ernst K.I. (2003). Cloning of human and rat ABCA5/Abca5 and detection of a human splice variant. Biochem. Biophys. Res. Commun. 300: 343—350. PMID 12504089 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02827-9
- Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:35 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8WWZ7 (англ.) . Архів оригіналу за 1 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |