USP6

USP6
Идентификаторы
ПсевдонимыUSP6, HRP1, TRE17, TRE2, TRESMCR, Tre-2, USP6-short, ubiquitin specific peptidase 6
Внешние IDOMIM: 604334 HomoloGene: 136783 GeneCards: USP6
Расположение гена (человек)
17-я хромосома человека
Хр.17-я хромосома человека[1]
17-я хромосома человека
Расположение в геноме USP6
Расположение в геноме USP6
Локус17p13.2Начало5,116,032 bp[1]
Конец5,175,034 bp[1]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • цитоархитектоническое поле Бродмана 23

  • dorsal motor nucleus of vagus nerve

  • Region I of hippocampus proper

  • inferior olivary nucleus

  • Skeletal muscle tissue of biceps brachii

  • middle temporal gyrus
    н/д
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • thiol-dependent deubiquitinase
  • peptidase activity
  • cysteine-type endopeptidase activity
  • cysteine-type peptidase activity
  • связывание с белками плазмы
  • гидролазная активность
  • nucleic acid binding
  • GTPase activator activity
  • calmodulin binding
Компонент клетки
  • цитоплазма
  • recycling endosome
  • эндосома
  • клеточная мембрана
  • лизосома
  • мембрана
Биологический процесс
  • protein deubiquitination
  • regulation of vesicle-mediated transport
  • ubiquitin-dependent protein catabolic process
  • протеолиз
  • intracellular protein transport
  • regulation of vesicle fusion
  • activation of GTPase activity
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

9098

н/д

Ensembl

ENSG00000129204

н/д

UniProt

P35125

н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001304284
NM_004505
NM_005152

н/д

RefSeq (белок)

NP_001291213
NP_004496

н/д

Локус (UCSC)Chr 17: 5.12 – 5.18 Mbн/д
Поиск по PubMedИскать[2]н/д
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)

USP6 («карбоксил-концевая гидролаза убиквитина 6»; англ. Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6; КФ:3.4.19.12) — фермент. Продукт гена USP6[3][4][5], который присутствует только у приматов.

Каталитическая активность

Тиол-зависимый гидролиз эфирных, тиоэфирных, пептидных и изопептидных связей у C-концевого глицина убиквитина (небольшой белок, состоящий из 76 аминокислот, который присоединяется к белкам как внутриклеточная метка).

Функция

Гидролаза USP6 является деубиквитиназой с АТФ-независимой изопептидазной активностью, которая отщепляет C-конечную часть убиквитина. Фермент также катализирует свою собственную деубиквитинизацию, причём последняя активность обнаруживается In vitro только у изоформы 2 и отсутствует у изоформы 3. USP6 стимулирует локализацию ARF6 на плазматической мембране и селективно регулирует ARF6-зависимый эндоцитозный транспорт белков. Способен инициировать опухолеобразование за счёт индуцирования продукции матриксных металлопротеиназ после активации фактора транскрипции NF-κB[6][7][8].

В патологии

Транслокация USP6 ассоциирована с возникновением остеолитической костной неоплазмы аневризмальная костная киста (ABC)[8]. В клетках саркомы Юинга фермент USP6 запускает продукцию интерферона[9].

Структура

Фермент состоит из 1 406 аминокислот, молекулярная масса 158,7 кДа.

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000129204 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ↑ Puente X. S., Sanchez L. M., Overall C. M., Lopez-Otin C. Human and mouse proteases: a comparative genomic approach (англ.) // Nat Rev Genet : journal. — 2003. — July (vol. 4, no. 7). — P. 544—558. — doi:10.1038/nrg1111. — PMID 12838346.
  4. ↑ Hoogendijk J. E., Hensels G. W., Gabreels-Festen A. A., Gabreels F. J., Janssen E. A., de Jonghe P., Martin J. J., van Broeckhoven C., Valentijn L. J., Baas F., etal. De-novo mutation in hereditary motor and sensory neuropathy type I (англ.) // The Lancet : journal. — Elsevier, 1992. — May (vol. 339, no. 8801). — P. 1081—1082. — doi:10.1016/0140-6736(92)90668-S. — PMID 1349106.
  5. ↑ Entrez Gene: USP6 ubiquitin specific peptidase 6 (Tre-2 oncogene)  (неопр.). Архивировано 26 августа 2021 года.
  6. ↑ Martinu L., Masuda-Robens J. M., Robertson S. E., Santy L. C., Casanova J. E., Chou M. M. The TBC (Tre-2/Bub2/Cdc16) domain protein TRE17 regulates plasma membrane-endosomal trafficking through activation of Arf6 (англ.) // Mol Cell Biol : journal. — 2004. — Vol. 24, no. 22. — P. 9752—9762. — doi:10.1128/MCB.24.22.9752-9762.2004. — PMID 15509780. — PMC 525471.
  7. ↑ Shen C., Ye Y., Robertson S. E., Lau A. W., Mak D. O., Chou M. M. Calcium/calmodulin regulates ubiquitination of the ubiquitin-specific protease TRE17/USP6 (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2005. — Vol. 280, no. 43. — P. 35967—35973. — doi:10.1074/jbc.M505220200. — PMID 16127172.
  8. ↑ 1 2 Ye Y., Pringle L. M., Lau A. W., etal. TRE17/USP6 oncogene translocated in aneurysmal bone cyst induces matrix metalloproteinase production via activation of NFκB (англ.) // Oncogene : journal. — 2010. — June (vol. 29, no. 25). — P. 3619—3629. — doi:10.1038/onc.2010.116. — PMID 20418905. — PMC 2892027.
  9. ↑ Henrich I. C., Young R., Quick L., Oliveira A. M., Chou M. M. USP6 Confers Sensitivity to IFN-Mediated Apoptosis through Modulation of TRAIL Signaling in Ewing Sarcoma (англ.) // Mol Cancer Res[англ.] : journal. — 2018. — Vol. 16, no. 12. — P. 1834—1843. — doi:10.1158/1541-7786.MCR-18-0289. — PMID 30131449. — PMC 6279478.

Литература

  • D'Andrea A., Pellman D. Deubiquitinating enzymes: a new class of biological regulators (англ.) // Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol.[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 33, no. 5. — P. 337—352. — doi:10.1080/10409239891204251. — PMID 9827704.
  • Nakamura T., Hillova J., Mariage-Samson R., etal. A novel transcriptional unit of the tre oncogene widely expressed in human cancer cells (англ.) // Oncogene : journal. — 1992. — Vol. 7, no. 4. — P. 733—741. — PMID 1565468.
  • Papa F. R., Hochstrasser M. The yeast DOA4 gene encodes a deubiquitinating enzyme related to a product of the human tre-2 oncogene (англ.) // Nature : journal. — 1993. — Vol. 366, no. 6453. — P. 313—319. — doi:10.1038/366313a0. — PMID 8247125.
  • Onno M., Nakamura T., Hillova J., Hill M. Identification of novel sequences in the repertoire of hypervariable TRE17 genes from immortalized nonmalignant and malignant human keratinocytes (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1993. — Vol. 131, no. 2. — P. 209—215. — doi:10.1016/0378-1119(93)90295-E. — PMID 8406013.
  • Onno M., Nakamura T., Mariage-Samson R., etal. Human TRE17 oncogene is generated from a family of homologous polymorphic sequences by single-base changes (англ.) // DNA Cell Biol.[англ.] : journal. — 1993. — Vol. 12, no. 2. — P. 107—118. — doi:10.1089/dna.1993.12.107. — PMID 8471161.
  • Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Paulding C. A., Ruvolo M., Haber D. A. The Tre2 (USP6) oncogene is a hominoid-specific gene (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 100, no. 5. — P. 2507—2511. — doi:10.1073/pnas.0437015100. — PMID 12604796. — PMC 151371.
  • Masuda-Robens J. M., Kutney S. N., Qi H., Chou M. M. The TRE17 Oncogene Encodes a Component of a Novel Effector Pathway for Rho GTPases Cdc42 and Rac1 and Stimulates Actin Remodeling (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2003. — Vol. 23, no. 6. — P. 2151—2161. — doi:10.1128/MCB.23.6.2151-2161.2003. — PMID 12612085. — PMC 149457.
  • Bizimungu C., De Neve N., Burny A., etal. Expression in a RabGAP yeast mutant of two human homologues, one of which is an oncogene (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 310, no. 2. — P. 498—504. — doi:10.1016/j.bbrc.2003.09.051. — PMID 14521938.
  • Oliveira A. M., Hsi B. L., Weremowicz S., etal. USP6 (Tre2) fusion oncogenes in aneurysmal bone cyst (англ.) // Cancer Research[англ.] : journal. — American Association for Cancer Research[англ.], 2004. — Vol. 64, no. 6. — P. 1920—1923. — doi:10.1158/0008-5472.CAN-03-2827. — PMID 15026324.
  • Oliveira A. M., Perez-Atayde A. R., Inwards C. Y., etal. USP6 and CDH11 oncogenes identify the neoplastic cell in primary aneurysmal bone cysts and are absent in so-called secondary aneurysmal bone cysts (англ.) // Am. J. Pathol.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 165, no. 5. — P. 1773—1780. — doi:10.1016/S0002-9440(10)63432-3. — PMID 15509545. — PMC 3278819.
  • Martinu L., Masuda-Robens J. M., Robertson S. E., etal. The TBC (Tre-2/Bub2/Cdc16) Domain Protein TRE17 Regulates Plasma Membrane-Endosomal Trafficking through Activation of Arf6 (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2004. — Vol. 24, no. 22. — P. 9752—9762. — doi:10.1128/MCB.24.22.9752-9762.2004. — PMID 15509780. — PMC 525471.
  • Oliveira A. M., Perez-Atayde A. R., Dal Cin P., etal. Aneurysmal bone cyst variant translocations upregulate USP6 transcription by promoter swapping with the ZNF9, COL1A1, TRAP150, and OMD genes (англ.) // Oncogene : journal. — 2005. — Vol. 24, no. 21. — P. 3419—3426. — doi:10.1038/sj.onc.1208506. — PMID 15735689.
  • Bizimungu C., Vandenbol M. At least two regions of the oncoprotein Tre2 are involved in its lack of GAP activity (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 335, no. 3. — P. 883—890. — doi:10.1016/j.bbrc.2005.07.159. — PMID 16099424.
  • Shen C., Ye Y., Robertson S. E., etal. Calcium/calmodulin regulates ubiquitination of the ubiquitin-specific protease TRE17/USP6 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2006. — Vol. 280, no. 43. — P. 35967—35973. — doi:10.1074/jbc.M505220200. — PMID 16127172.
  • Dechamps C., Bach S., Portetelle D., Vandenbol M. The Tre2 oncoprotein, implicated in Ewing's sarcoma, interacts with two components of the cytoskeleton (англ.) // Biotechnol. Lett.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 28, no. 4. — P. 223—231. — doi:10.1007/s10529-005-5523-2. — PMID 16555005.