TCF21 |
---|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | TCF21, POD1, bHLHa23, transcription factor 21 |
---|
Внешние ID | OMIM: 603306 MGI: 1202715 HomoloGene: 2414 GeneCards: TCF21 |
---|
|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - upper lobe of left lung
- lower lobe of lung
- metanephric glomerulus
- right auricle
|
| Наибольшая экспрессия в | - left lung lobe
- Gonadal ridge
- efferent ductule
- right lung lobe
- migratory enteric neural crest cell
- stroma of kidney
- septum transversum
- endocardial cushion
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/64/PBB_GE_TCF21_204931_at_fs.png/250px-PBB_GE_TCF21_204931_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - ДНК-связывающий
- protein dimerization activity
- DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
- histone deacetylase binding
- DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
- bHLH transcription factor binding
- E-box binding
- androgen receptor binding
- DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
| Компонент клетки | | Биологический процесс | - roof of mouth development
- ureteric bud development
- ДНК-зависимая регуляция транскрипции
- epithelial cell differentiation
- lung morphogenesis
- diaphragm development
- нефрогенез
- metanephric mesenchymal cell differentiation
- negative regulation of androgen receptor signaling pathway
- развитие бронхиол
- Sertoli cell differentiation
- glomerulus development
- sex differentiation
- negative regulation of transcription by RNA polymerase II
- развитие селезёнки
- transcription by RNA polymerase II
- morphogenesis of a branching structure
- транскрипция, ДНК-зависимая
- развитие репродуктивной структуры
- metanephric glomerular capillary formation
- branching involved in ureteric bud morphogenesis
- vasculature development
- определение пола
- respiratory system development
- embryonic digestive tract morphogenesis
- морфогенез органа животных
- развитие лёгочной альвеолы
- lung vasculature development
- branchiomeric skeletal muscle development
- положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор
- развитие желёз
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 6: 133.89 – 133.9 Mb | Chr 10: 22.69 – 22.7 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
TCF21 (Фактор транскрипции 21) также известный как pod-1[5], капсулин или эпикардин, представляет собой белок, который у человека кодируется геном TCF21 на 6-й хромосоме (6q23-q24) человека.[6][7] TCF21 является членом факторов транскрипции содержащих базовый структурный мотив bHLH, которые влияют на судьбу и дифференцировку клеток, регулируя экспрессию генов. Он играет важную роль в широком спектре биологических процессов, включая органогенез, эпителиально-мезенхимальный переход (ЭМП), клеточный цикл, аутофагию, пролиферацию, дифференцировку, и выживание клеток, а также метастазирование рака. Контролируемая экспрессия и активность TCF21 обеспечивают сбалансированную программу транскрипции, которая гарантирует соответствующий рост и созревание во время эмбриогенеза и развития органов. Нарушение его регуляции тесно связано с множеством заболеваний.[7] Его функция в основном регулируется некодирующими РНК, посттрансляционными модификациями и межбелковыми взаимодействиями.[8]
Появляется все больше доказательств того, что полиморфизм TCF21 может определять генетическую предрасположенность к ишемической болезни сердца[9] При многих типах рака человека ген TCF21 эпигенетически инактивирован.[7][10]
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000118526 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000045680 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Quaggin SE, Vanden Heuvel GB, Igarashi P (February 1998). "Pod-1, a mesoderm-specific basic-helix-loop-helix protein expressed in mesenchymal and glomerular epithelial cells in the developing kidney". Mechanisms of Development. 71 (1—2): 37—48. doi:10.1016/S0925-4773(97)00201-3. PMID 9507058.
- ↑ Smith LT, Lin M, Brena RM, Lang JC, Schuller DE, Otterson GA, Morrison CD, Smiraglia DJ, Plass C (2006). Epigenetic regulation of the tumor suppressor gene TCF21 on 6q23-q24 in lung and head and neck cancer. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 103 (4): 982—987. PMC 1348006 PMID 16415157 doi:10.1073/pnas.0510171102
- ↑ 1 2 3 Lotfi, C. F. P., Passaia, B. S., & Kremer, J. L. (2021). Role of the bHLH transcription factor TCF21 in development and tumorigenesis. Brazilian Journal of Medical and Biological Research, 54(5) e10637. PMID 33729392 PMC 7959166 doi:10.1590/1414-431X202010637
- ↑ Ao, X., Ding, W., Zhang, Y., Ding, D., & Liu, Y. (2020). TCF21: a critical transcription factor in health and cancer. Journal of Molecular Medicine, 98(8), 1055—1068. PMID 32542449 doi:10.1007/s00109-020-01934-7
- ↑ Hu, H., Lin, S., Wang, S., & Chen, X. (2020). The Role of Transcription Factor 21 in Epicardial Cell Differentiation and the Development of Coronary Heart Disease. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 8, 457. PMID 32582717 PMC 7290112 doi:10.3389/fcell.2020.00457
- ↑ Jiang, X., & Yang, Z. (2018). Multiple biological functions of transcription factor 21 in the development of various cancers. OncoTargets and therapy, 11, 3533. PMID 29950858 PMC 6016277 doi:10.2147/OTT.S164033