NAIP |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
2VM5 |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | NAIP, BIRC1, NLRB1, psiNLR family, apoptosis inhibitory protein, NLR family apoptosis inhibitory protein |
---|
Внешние ID | OMIM: 600355 MGI: 1298226 HomoloGene: 136092 GeneCards: NAIP |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![13-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/04/Ideogram_house_mouse_chromosome_13.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_13.svg.png) | Хр. | 13-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 13 D1|13 53.01 cM | Начало | 100,280,571 bp[2] |
---|
Конец | 100,338,600 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - right uterine tube
- epithelium of colon
|
| Наибольшая экспрессия в | - left colon
- epithelium of small intestine
- Intestinal villus
- male urethra
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | |
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - peptidase inhibitor activity
- нуклеотид-связывающий
- cysteine-type endopeptidase inhibitor activity
- связывание с ионом металла
- ubiquitin-protein transferase activity
- связывание с белками плазмы
- АТФ-связанные
- cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process
| Компонент клетки | - перикарион
- neuronal cell body
- basolateral plasma membrane
- neuron projection
- цитоплазма
- клеточное ядро
| Биологический процесс | - negative regulation of neuron apoptotic process
- negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
- response to amino acid
- negative regulation of peptidase activity
- immune system process
- развитие нервной системы
- response to axon injury
- врождённый иммунитет
- воспалительная реакция
- апоптоз
- protein ubiquitination
- positive regulation of canonical Wnt signaling pathway
- mitotic spindle assembly
- inhibition of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
- негативная регуляция апоптоза
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | |
---|
ENSG00000278613 ENSG00000276068 ENSG00000249437 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | |
---|
NM_004536 NM_022892 NM_001346870 |
| |
---|
RefSeq (белок) | |
---|
NP_001333799 NP_004527 NP_075043 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Chr 5: 70.97 – 71.03 Mb | Chr 13: 100.28 – 100.34 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
NAIP (англ. NLR family, apoptosis inhibitory protein) — цитозольный белок, Nod-подобный рецептор, продукт гена NAIP, ингибирует апоптоз.
Функции
NAIP является анти-апоптозным белком, ингибирует каспазы 3, 7 и 9. Может ингибировать как аутопротеолиз прокаспазы-9, так и активирующий протеолиз прокаспазы-3 под действием каспазы-9. Играет роль медиатора выживания нейрональных клеток в патологических условиях, предотвращает апоптоз моторных нейронов, вызванный различными сигналами. Различные мутации белка были обнаружены у больных с тяжёлой спинальной мышечной атрофией.
Структура
NLRC5 — крупный белок, состоит из 1403 аминокислот, молекулярная масса — 159,6 кДа. Молекула включает 3 BIR-повтора, NACHT-домен с участком связывания АТФ и 4 цистеиновых участков связываний цинка в 3-м BIR-домене.
Взаимодействует с APAF1 через NACHT-домен.[5]
Тканевая специфичность
Экспрессируется в моторных нейронах, но отсутствует в сенсорных нейронах. Присутствует в печени, плаценте, в меньшей степени — в спинном мозге.
Примечания
- ↑ 1 2 3 ENSG00000276068, ENSG00000249437 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000278613, ENSG00000276068, ENSG00000249437 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000078945 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ UniProt Q13075 (неопр.). Дата обращения: 22 мая 2012. Архивировано 29 августа 2017 года.
Литература
- van der Steege G., Draaijers T. G., Grootscholten P. M., et al. A provisional transcript map of the spinal muscular atrophy (SMA) critical region. (англ.) // Eur. J. Hum. Genet.[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 3, no. 2. — P. 87—95. — PMID 7552146.
- Liston P., Roy N., Tamai K., et al. Suppression of apoptosis in mammalian cells by NAIP and a related family of IAP genes. (англ.) // Nature : journal. — 1996. — Vol. 379, no. 6563. — P. 349—353. — doi:10.1038/379349a0. — PMID 8552191.
- Chen Q., Baird S. D., Mahadevan M., et al. Sequence of a 131-kb region of 5q13.1 containing the spinal muscular atrophy candidate genes SMN and NAIP. (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1998. — Vol. 48, no. 1. — P. 121—127. — doi:10.1006/geno.1997.5141. — PMID 9503025.
- Monani U. R., Lorson C. L., Parsons D. W., et al. A single nucleotide difference that alters splicing patterns distinguishes the SMA gene SMN1 from the copy gene SMN2. (англ.) // Human Molecular Genetics[англ.] : journal. — Oxford University Press, 1999. — Vol. 8, no. 7. — P. 1177—1183. — doi:10.1093/hmg/8.7.1177. — PMID 10369862.
- Yamamoto K., Sakai H., Hadano S., et al. Identification of two distinct transcripts for the neuronal apoptosis inhibitory protein gene. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 264, no. 3. — P. 998—1006. — doi:10.1006/bbrc.1999.1615. — PMID 10544044.
- Mercer E. A., Korhonen L., Skoglösa Y., et al. NAIP interacts with hippocalcin and protects neurons against calcium-induced cell death through caspase-3-dependent and -independent pathways. (англ.) // EMBO J. : journal. — 2000. — Vol. 19, no. 14. — P. 3597—3607. — doi:10.1093/emboj/19.14.3597. — PMID 10899114. — PMC 313967.
- Sanna M. G., da Silva Correia J., Ducrey O., et al. IAP suppression of apoptosis involves distinct mechanisms: the TAK1/JNK1 signaling cascade and caspase inhibition. (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 6. — P. 1754—1766. — doi:10.1128/MCB.22.6.1754-1766.2002. — PMID 11865055. — PMC 135597.
- Akutsu T., Nishio H., Sumino K., et al. Molecular genetics of spinal muscular atrophy: contribution of the NAIP gene to clinical severity. (англ.) // The Kobe journal of medical sciences : journal. — 2002. — Vol. 48, no. 1—2. — P. 25—31. — PMID 11912351.
- Xu M., Okada T., Sakai H., et al. Functional human NAIP promoter transcription regulatory elements for the NAIP and PsiNAIP genes. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 1574, no. 1. — P. 35—50. — doi:10.1016/S0167-4781(01)00343-8. — PMID 11955612.
- Notarbartolo M., Cervello M., Dusonchet L., D'Alessandro N. NAIP-deltaEx10-11: a novel splice variant of the apoptosis inhibitor NAIP differently expressed in drug-sensitive and multidrug-resistant HL60 leukemia cells. (англ.) // Leuk. Res.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 26, no. 9. — P. 857—862. — doi:10.1016/S0145-2126(02)00016-4. — PMID 12127562.
- Lindholm D., Mercer E. A., Yu L. Y., et al. Neuronal apoptosis inhibitory protein: Structural requirements for hippocalcin binding and effects on survival of NGF-dependent sympathetic neurons. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 1600, no. 1—2. — P. 138—147. — doi:10.1016/S1570-9639(02)00454-5. — PMID 12445469.
- Damiano J. S., Oliveira V., Welsh K., Reed J. C. Heterotypic interactions among NACHT domains: implications for regulation of innate immune responses. (англ.) // Biochem. J.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 381, no. Pt 1. — P. 213—219. — doi:10.1042/BJ20031506. — PMID 15107016. — PMC 1133779.
- Davoodi J., Lin L., Kelly J., et al. Neuronal apoptosis-inhibitory protein does not interact with Smac and requires ATP to bind caspase-9. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 39. — P. 40622—40628. — doi:10.1074/jbc.M405963200. — PMID 15280366.
- Aubin D., Gagnon A., Grunder L., et al. Adipogenic and antiapoptotic protein levels in human adipose stromal cells after weight loss. (англ.) // Obes. Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 12, no. 8. — P. 1231—1234. — doi:10.1038/oby.2004.156. — PMID 15340105.
- Schmutz J., Martin J., Terry A., et al. The DNA sequence and comparative analysis of human chromosome 5. (англ.) // Nature : journal. — 2004. — Vol. 431, no. 7006. — P. 268—274. — doi:10.1038/nature02919. — PMID 15372022.
- Romanish M. T., Lock W. M., van de Lagemaat L. N., et al. Repeated recruitment of LTR retrotransposons as promoters by the anti-apoptotic locus NAIP during mammalian evolution. (англ.) // PLoS Genet.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 3, no. 1. — P. e10. — doi:10.1371/journal.pgen.0030010. — PMID 17222062. — PMC 1781489.
- Maier J. K., Balabanian S., Coffill C. R., et al. Distribution of neuronal apoptosis inhibitory protein in human tissues. (англ.) // J. Histochem. Cytochem.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 55, no. 9. — P. 911—923. — doi:10.1369/jhc.6A7144.2007. — PMID 17510375.
![Перейти к шаблону «Nod-подобные рецепторы»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
Содержащие CARD-домен | |
---|
Содержащие пириновый домен | |
---|
Ингибитор апоптоза | NAIP |
---|
Семейство X1 | |
---|