CKAP2 |
---|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | CKAP2, LB1, TMAP, se20-10, cytoskeleton associated protein 2 |
---|
Внешние ID | OMIM: 611569 MGI: 1931797 HomoloGene: 10070 GeneCards: CKAP2 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
| Хр. | 8-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 8|8 A2 | Начало | 22,658,176 bp[2] |
---|
Конец | 22,675,835 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - ventricular zone
- secondary oocyte
|
| Наибольшая экспрессия в | - secondary oocyte
- ventricular zone
- primary oocyte
- medial ganglionic eminence
- endothelial cell of lymphatic vessel
- fetal liver hematopoietic progenitor cell
- otic placode
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | |
---|
NM_001098525 NM_001286686 NM_001286687 NM_018204 |
| |
---|
RefSeq (белок) | |
---|
NP_001091995 NP_001273615 NP_001273616 NP_060674 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Chr 13: 52.46 – 52.48 Mb | Chr 8: 22.66 – 22.68 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
CKAP2 (англ. cytoskeleton-associated protein 2) — это белок, который у человека кодируется геном CKAP2[5]. Ген CKAP2 был впервые идентифицирован как оверэкспрессированный при диффузной крупноклеточной B-клеточной лимфоме[6].
Большое количество мРНК CKAP2 в норме обнаруживается в семенниках и тимусе, этой мРНК мало в печени, предстательной железе и почках[6].
Ген CKAP2 кодирует белок из 683 аминокислотных остатков, который не содержит участков, гомологичных аминокислотным последовательностям, представленным в международных базах данных. С помощью иммунофлуоресцентного анализа показано, что продуктом гена CKAP2 является цитоплазматический белок, который связывается с фибриллами цитоскелета.
Ген CKAP2 расположен в области q14 хромосомы 13, перестройки в которой обнаруживают при различных опухолях[6][7]. Так, делеции в этом участке хромосомы наблюдаются при множественной миеломе[8][9], раке предстательной железы[10], плоскоклеточном раке головы и шеи[11], В-клеточном пролимфоцитарном лейкозе[12], волосатоклеточном лейкозе[13], а также более чем в половине случаев В-клеточного хронического лимфолейкоза[14][15][16].
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136108 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037725 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Рахманалиев Э.Р., Климов Е.А., Компанийцев А.А., Сулимова Г.Е. Структура гена CKAP2 (LB1) человека, связанного с онкогенезом // Молекулярная биология. 2002. Т.36. №6. С. 985-989.
- ↑ 1 2 3 Maouche-Chrétien L., Deleu N., Badoual C., Fraissignes P., Berger R., Gaulard P., Roméo P. H., Leroy-Viard K. Identification of a novel cDNA, encoding a cytoskeletal associated protein, differentially expressed in diffuse large B cell lymphomas. (англ.) // Oncogene. — 1998. — Vol. 17, no. 10. — P. 1245—1251. — doi:10.1038/sj.onc.1202048. — PMID 9771967. [исправить]
- ↑ Удина И.Г., Баранова А.В., Компанийцев А.А., Сулимова Г.Е. 2001. Эволюционно-консервативный ген CKAP2 (LB1) расположен в области генома человека 13q14.3, часто перестраеваемой в различных опухолях. Генетика. 37, 120-123.
- ↑ Zojer N., Königsberg R., Ackermann J., Fritz E., Dallinger S., Krömer E., Kaufmann H., Riedl L., Gisslinger H., Schreiber S., Heinz R., Ludwig H., Huber H., Drach J. Deletion of 13q14 remains an independent adverse prognostic variable in multiple myeloma despite its frequent detection by interphase fluorescence in situ hybridization. (англ.) // Blood. — 2000. — Vol. 95, no. 6. — P. 1925—1930. — PMID 10706856. [исправить]
- ↑ Fonseca R., Oken M. M., Harrington D., Bailey R. J., Van Wier S. A., Henderson K. J., Kay N. E., Van Ness B., Greipp P. R., Dewald G. W. Deletions of chromosome 13 in multiple myeloma identified by interphase FISH usually denote large deletions of the q arm or monosomy. (англ.) // Leukemia. — 2001. — Vol. 15, no. 6. — P. 981—986. — PMID 11417487. [исправить]
- ↑ Ueda T., Emi M., Suzuki H., Komiya A., Akakura K., Ichikawa T., Watanabe M., Shiraishi T., Masai M., Igarashi T., Ito H. Identification of a I-cM region of common deletion on 13q14 associated with human prostate cancer. (англ.) // Genes, chromosomes & cancer. — 1999. — Vol. 24, no. 3. — P. 183—190. — PMID 10451697. [исправить]
- ↑ Gupta V. K., Schmidt A. P., Pashia M. E., Sunwoo J. B., Scholnick S. B. Multiple regions of deletion on chromosome arm 13q in head-and-neck squamous-cell carcinoma. (англ.) // International journal of cancer. — 1999. — Vol. 84, no. 5. — P. 453—457. — PMID 10502719. [исправить]
- ↑ Lens D., Matutes E., Catovsky D., Coignet L. J. Frequent deletions at 11q23 and 13q14 in B cell prolymphocytic leukemia (B-PLL). (англ.) // Leukemia. — 2000. — Vol. 14, no. 3. — P. 427—430. — PMID 10720137. [исправить]
- ↑ Dierlamm J., Stefanova M., Wlodarska I., Michaux L., Hinz K., Penas E. M., Maes B., Hagemeijer A., De Wolf Peeters C., Hossfeld D. K. Chromosomal gains and losses are uncommon in hairy cell leukemia: a study based on comparative genomic hybridization and interphase fluorescence in situ hybridization. (англ.) // Cancer genetics and cytogenetics. — 2001. — Vol. 128, no. 2. — P. 164—167. — PMID 11463458. [исправить]
- ↑ Wolf S., Mertens D., Schaffner C., Korz C., Döhner H., Stilgenbauer S., Lichter P. B-cell neoplasia associated gene with multiple splicing (BCMS): the candidate B-CLL gene on 13q14 comprises more than 560 kb covering all critical regions. (англ.) // Human molecular genetics. — 2001. — Vol. 10, no. 12. — P. 1275—1285. — PMID 11406609. [исправить]
- ↑ Mabuchi H., Fujii H., Calin G., Alder H., Negrini M., Rassenti L., Kipps T. J., Bullrich F., Croce C. M. Cloning and characterization of CLLD6, CLLD7, and CLLD8, novel candidate genes for leukemogenesis at chromosome 13q14, a region commonly deleted in B-cell chronic lymphocytic leukemia. (англ.) // Cancer research. — 2001. — Vol. 61, no. 7. — P. 2870—2877. — PMID 11306461. [исправить]
- ↑ Migliazza A., Bosch F., Komatsu H., Cayanis E., Martinotti S., Toniato E., Guccione E., Qu X., Chien M., Murty V. V., Gaidano G., Inghirami G., Zhang P., Fischer S., Kalachikov S. M., Russo J., Edelman I., Efstratiadis A., Dalla-Favera R. Nucleotide sequence, transcription map, and mutation analysis of the 13q14 chromosomal region deleted in B-cell chronic lymphocytic leukemia. (англ.) // Blood. — 2001. — Vol. 97, no. 7. — P. 2098—2104. — PMID 11264177. [исправить]
Внешние ссылки
OMIM