ApoER2 |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
3A7Q |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | LRP8, APOER2, HSZ75190, LRP-8, MCI1, low density lipoprotein receptor-related protein 8, LDL receptor related protein 8 |
---|
Внешние ID | OMIM: 602600 MGI: 1340044 HomoloGene: 31250 GeneCards: LRP8 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![4-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9c/Ideogram_house_mouse_chromosome_4.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_4.svg.png) | Хр. | 4-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 4|4 C7 | Начало | 107,801,869 bp[2] |
---|
Конец | 107,876,840 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - ventricular zone
- right testis
- left testis
- right lobe of thyroid gland
- left lobe of thyroid gland
- lateral nuclear group of thalamus
- Brodmann area 46
|
| Наибольшая экспрессия в | - ventricular zone
- neural layer of retina
- tail of embryo
- primary visual cortex
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fd/PBB_GE_LRP8_208433_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_LRP8_208433_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9d/PBB_GE_LRP8_205282_at_fs.png/250px-PBB_GE_LRP8_205282_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - reelin receptor activity
- calcium ion binding
- apolipoprotein binding
- связывание с белками плазмы
- kinesin binding
- high-density lipoprotein particle binding
- very-low-density lipoprotein particle receptor activity
- transmembrane signaling receptor activity
- low-density lipoprotein particle receptor activity
| Компонент клетки | - часть мембраны
- мембрана
- постсинаптическое уплотнение
- receptor complex
- клеточная мембрана
- microtubule associated complex
- внеклеточная область
- аксон
- neuronal cell body
- дендрит
- Кавеола
| Биологический процесс | - эндоцитоз
- ammon gyrus development
- липидный обмен
- cytokine-mediated signaling pathway
- cellular response to growth factor stimulus
- positive regulation of protein tyrosine kinase activity
- modulation of chemical synaptic transmission
- negative regulation of transcription by RNA polymerase II
- positive regulation of dendrite development
- cellular response to cholesterol
- протеолиз
- retinoid metabolic process
- reelin-mediated signaling pathway
- positive regulation of CREB transcription factor activity
- cerebral cortex development
- positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
- positive regulation of dendritic spine morphogenesis
- передача сигнала
- рецепторно-опосредованный эндоцитоз
- regulation of apoptotic process
- regulation of innate immune response
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | |
---|
NM_001018054 NM_004631 NM_017522 NM_033300 |
| NM_001080926 NM_053073 NM_001369051 NM_001369052 NM_001369053
|
---|
NM_001369054 |
|
---|
RefSeq (белок) | |
---|
NP_001018064 NP_004622 NP_059992 NP_150643 |
| NP_001074395 NP_001355980 NP_001355981 NP_001355982 NP_001355983
|
---|
NP_444303 |
|
---|
Локус (UCSC) | Chr 1: 53.24 – 53.33 Mb | Chr 4: 107.8 – 107.88 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
Low density lipoprotein receptor-related protein 8 (сокр. LRP8), или Аполипопротеин-Е рецептор 2 (АпоЕ рецептор 2, ApoER2) – рецептор, принадлежащий к семейству рецепторов липопротеинов низкой плотности (англ. Low density lipoprotein receptor gene family), обнаруживаемый преимущественно в мозге и плаценте. ApoER2 состоит из пяти функциональных доменов, подобно другим белкам своего семейства.
ApoER2 способен связываться с АпоЕ-содержащими липопротеинами, регулировать поступление селена в клетки, осуществляя эндоцитоз селенопротеина P[5], а также выступает рецептором рилина и тромбоспондина 1. Белок рилин, его рецепторы ApoER2 и VLDLR, и адаптерный белок цитоплазмы DAB1 являются участниками единого сигнального пути, регулирующего правильное построение слоёв коры головного мозга. В отсутствие обоих рецепторов ApoER2 и VLDLR у мышей наблюдается reeler-фенотип, такой же, как и при отсутствии белка рилин. ApoER2 играет более важную роль в сигнальном пути рилина, так как при его отсутствии наблюдаются более серьёзные нарушения миграции нейронов, чем при отсутствии лишь рецептора VLDLR.
Усиление долговременной потенциации, вызываемое рилином, также опосредовано рецептором ApoER2. Внутриклеточный домен рецептора, кодируемый экзоном 19, воздействует на рецептор NMDA (NMDAR), играющий важную роль в механизмах памяти и обучения. Точный механизм воздействия пока неизвестен. Предполагается, что ApoER2 образует комплексы с NMDAR и белком PSD95. Экзон 19 подвержен альтернативному сплайсингу, причём относительное количество рецепторов с экзоном 19 увеличивается во время активности и уменьшается во время сна. Отсутствие экзона 19 у подопытных мышей не нарушает процесс кортикогенеза, но приводит к нарушению работы памяти[6].
Связь с заболеваниями
В 2006 году была обнаружена ассоциация материнского однонуклеотидного полиморфизма rs2297660 гена LRP8 с задержкой внутриутробного роста[7]. Каждая дополнительная копия «А»-аллели rs2297660 уменьшает риск задержки роста на 33% и связана с повышенным весом плода.
Ссылки
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000157193 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028613 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Olson G.E., Winfrey V.P., Nagdas S.K., Hill K.E., Burk R.F. Apolipoprotein E receptor-2 (ApoER2) mediates selenium uptake from selenoprotein P by the mouse testis (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2007. — April (vol. 282, no. 16). — P. 12290—12297. — doi:10.1074/jbc.M611403200. — PMID 17314095.
- ↑ Beffert U., Weeber E. J., Durudas A., Qiu S., Masiulis I., Sweatt J. D., Li W. P., Adelmann G., Frotscher M., Hammer R. E., Herz J. Modulation of synaptic plasticity and memory by Reelin involves differential splicing of the lipoprotein receptor Apoer2. (англ.) // Neuron. — 2005. — 18 August (vol. 47, no. 4). — P. 567—579. — doi:10.1016/j.neuron.2005.07.007. — PMID 16102539. [исправить]
- ↑ Wang L., Wang X., Laird N., Zuckerman B., Stubblefield P., Xu X. Polymorphism in maternal LRP8 gene is associated with fetal growth. (англ.) // American Journal Of Human Genetics. — 2006. — May (vol. 78, no. 5). — P. 770—777. — doi:10.1086/503712. — PMID 16642433. [исправить]