ATOH1

ATOH1
Идентификаторы
ПсевдонимыATOH1, ATH1, HATH1, MATH-1, bHLHa14, atonal bHLH transcription factor 1
Внешние IDOMIM: 601461 MGI: 104654 HomoloGene: 31297 GeneCards: ATOH1
Расположение гена (человек)
4-я хромосома человека
Хр.4-я хромосома человека[1]
4-я хромосома человека
Расположение в геноме ATOH1
Расположение в геноме ATOH1
Локус4q22.2Начало93,828,753 bp[1]
Конец93,830,964 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
6-я хромосома мыши
Хр.6-я хромосома мыши[2]
6-я хромосома мыши
Расположение в геноме ATOH1
Расположение в геноме ATOH1
Локус6 C1|6 30.03 cMНачало64,706,109 bp[2]
Конец64,708,229 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • mucosa of transverse colon

  • mucosa of sigmoid colon

  • epithelium of colon

  • muscle layer of sigmoid colon
Наибольшая экспрессия в
  • rhombic lip

  • crypt of lieberkuhn of small intestine

  • left colon

  • vestibular sensory epithelium

  • Intestinal villus

  • male urethra
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • ДНК-связывающий
  • sequence-specific DNA binding
  • protein dimerization activity
  • DNA-binding transcription factor activity
  • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
  • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
  • chromatin DNA binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Компонент клетки
  • клеточное ядро
Биологический процесс
  • Notch signaling pathway
  • regulation of neuron differentiation
  • auditory receptor cell fate determination
  • дифференцировка клеток
  • positive regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation
  • ДНК-зависимая регуляция транскрипции
  • positive regulation of inner ear receptor cell differentiation
  • негативная регуляция апоптоза
  • neuron migration
  • auditory receptor cell fate specification
  • транскрипция, ДНК-зависимая
  • развитие нервной системы
  • Аксональное наведение
  • multicellular organism development
  • развитие центральной нервной системы
  • развитие мозга
  • inner ear auditory receptor cell differentiation
  • inner ear morphogenesis
  • positive regulation of neuron differentiation
  • neuron differentiation
  • cerebral cortex development
  • inner ear development
  • положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор
  • transcription by RNA polymerase II
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

474

11921

Ensembl

ENSG00000172238

ENSMUSG00000073043

UniProt

Q92858

P48985

RefSeq (мРНК)

NM_005172

NM_007500

RefSeq (белок)

NP_005163

NP_031526

Локус (UCSC)Chr 4: 93.83 – 93.83 MbChr 6: 64.71 – 64.71 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

ATOH1 (Protein atonal homolog 1) — белок, кодируемый геном человека ATOH1.[5][6]

Функции

Белок принадлежит к семейству BHLH факторов транскрипции. Активирует E-box зависимую транскрипцию.[6] ATOH1 участвует в формировании нейрональных и не нейрональных типов клеток. Генетическая делеция ATOH1 показала, что этот фактор транскрипции необходим для развития мозжечковых гранулярных нейронов, волосковых клеток внутреннего уха, промежуточных нейронов в спинном мозге, клеток Меркеля в коже, секреторных клеток кишечника (бокаловидных клеток, энтероэндокринных клеток и клеток Панета).

Считается частью сигнального пути Notch.

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000172238 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000073043 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Ben-Arie N., McCall A. E., Berkman S., Eichele G., Bellen H. J., Zoghbi H. Y. Evolutionary conservation of sequence and expression of the bHLH protein Atonal suggests a conserved role in neurogenesis (англ.) // Human Molecular Genetics[англ.] : journal. — Oxford University Press, 1996. — September (vol. 5, no. 9). — P. 1207—1216. — doi:10.1093/hmg/5.9.1207. — PMID 8872459.
  6. 1 2 Entrez Gene: ATOH1 atonal homolog 1 (Drosophila)  (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.