Genom rdzeniowy

Genom rdzeniowy (ang. core genome) – zbiór genów obecny we wszystkich genomach danej grupy organizmów[1]. Jest jedną z części składowych pan-genomu[2] oraz jest najczęściej używany w analizach filogenetycznych bakterii[3]. Geny zaliczane do genomu rdzeniowego danego taksonu zazwyczaj biorą udział w utrzymywaniu homeostazy, uczestnicząc między innymi w replikacji DNA czy translacji[2].

Przypisy

  1. ↑ Rachel M.R.M. Sherman Rachel M.R.M., Steven L.S.L. Salzberg Steven L.S.L., Pan-genomics in the human genome era, „Nature Reviews Genetics”, 21 (4), 2020, s. 243–254, DOI: 10.1038/s41576-020-0210-7  (ang.).
  2. ↑ a b Luis CarlosL.C. Guimarães Luis CarlosL.C. i inni, Inside the Pan-genome – Methods and Software Overview, „Current Genomics”, 16 (4), 2015, s. 245–252, DOI: 10.2174/1389202916666150423002311, PMID: 27006628, PMCID: PMC4765519  (ang.).
  3. ↑ L.L. Rouli L.L. i inni, The bacterial pangenome as a new tool for analysing pathogenic bacteria, „New Microbes and New Infections”, 7, 2015, s. 72–85, DOI: 10.1016/j.nmni.2015.06.005  (ang.).